More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2303 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 229 aa  461  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  71.88 
 
 		 229 aa  341  5.999999999999999e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  50.9 
 
 		 225 aa  234  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  50.9 
 
 		 225 aa  234  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  50.9 
 
 		 225 aa  234  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  50.9 
 
 		 225 aa  234  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  50.45 
 
 		 225 aa  234  9e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  50.22 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  50.45 
 
 		 225 aa  231  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 225 aa  231  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  49.55 
 
 		 225 aa  231  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 225 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  46.85 
 
 		 227 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  50.22 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  46.4 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  47.75 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  47.77 
 
 		 227 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  48.15 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  45.22 
 
 		 230 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  46.43 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  44.29 
 
 		 241 aa  207  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  44.84 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  43.95 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  45.54 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  44.39 
 
 		 229 aa  204  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  46.43 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  43.05 
 
 		 222 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  42.15 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  45.98 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  43.64 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  44.8 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  47.32 
 
 		 229 aa  201  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  49.05 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  45.41 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 222 aa  198  6e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  41.7 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  42.92 
 
 		 232 aa  194  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  41.82 
 
 		 223 aa  194  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  45.05 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  45.74 
 
 		 227 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  46.15 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  44.24 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  44.14 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  44 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  43.24 
 
 		 222 aa  188  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  44.39 
 
 		 227 aa  188  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  41.92 
 
 		 235 aa  187  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  43.56 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  40.91 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  42.15 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  41.56 
 
 		 245 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  43.95 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  48.31 
 
 		 186 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0302  DNA repair protein RadC  39.65 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3170  DNA repair protein RadC  47.73 
 
 		 185 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  43.81 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  46.77 
 
 		 206 aa  171  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  41.7 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0101  DNA repair protein RadC  38.43 
 
 		 243 aa  170  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  40.28 
 
 		 246 aa  169  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  39.01 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  38.77 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  38.68 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  39.83 
 
 		 243 aa  166  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  36.12 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2739  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0056  DNA repair protein RadC  35.68 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183755  normal  0.0623388 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  38.68 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  38.79 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  38.16 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  38.16 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  36.16 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  39.29 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  38.84 
 
 		 224 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0820  DNA repair protein RadC  36.73 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  38.84 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  45.22 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  35.27 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 243 aa  161  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3111  DNA repair protein RadC  55.2 
 
 		 169 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  37.56 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  38.39 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  36.04 
 
 		 224 aa  158  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  40.29 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  36.61 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0917  DNA repair protein RadC  35.91 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.372898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2092  DNA repair protein RadC  39.11 
 
 		 223 aa  155  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  35.4 
 
 		 229 aa  154  8e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2597  DNA repair protein RadC  35.27 
 
 		 224 aa  154  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000367988  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  36.94 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  35 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  35.71 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  35.43 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  35 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  35 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  35 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>