More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0899 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 226 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  88.94 
 
 		 226 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  69.37 
 
 		 225 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  69.37 
 
 		 225 aa  330  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  69.37 
 
 		 225 aa  329  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  69.37 
 
 		 225 aa  330  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  68.92 
 
 		 225 aa  329  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  68.47 
 
 		 225 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  68.92 
 
 		 225 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  68.47 
 
 		 225 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  68.92 
 
 		 225 aa  325  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  61.43 
 
 		 227 aa  289  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  61.82 
 
 		 233 aa  280  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  58.56 
 
 		 236 aa  271  7e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  66.29 
 
 		 186 aa  254  7e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3170  DNA repair protein RadC  67.61 
 
 		 185 aa  252  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  52.73 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  53.05 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  53.42 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  53.42 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  55.86 
 
 		 229 aa  234  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  51.35 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  49.11 
 
 		 229 aa  231  9e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  53.18 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  50.23 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  51.1 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  47.75 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  49.52 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  50.46 
 
 		 232 aa  211  5.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  48.64 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  48.66 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  51.76 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  44.59 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  45.13 
 
 		 227 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  47.75 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  44.74 
 
 		 228 aa  201  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  45.5 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  43.17 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  49.55 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  50.45 
 
 		 233 aa  197  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  45.89 
 
 		 229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  47.77 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  44.29 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  46.4 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  54.72 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  45.33 
 
 		 230 aa  193  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  46.85 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  45.37 
 
 		 245 aa  192  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  46.52 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  42.06 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  45.41 
 
 		 223 aa  191  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  45.5 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  44.59 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  44.5 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  44.02 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  45.13 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  44.4 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  44.4 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  44.5 
 
 		 222 aa  186  4e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  40.99 
 
 		 222 aa  185  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  46.41 
 
 		 213 aa  185  6e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  43.69 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  43.69 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  45.41 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  44.7 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  43.04 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  42.67 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1430  DNA repair protein RadC  45.24 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  41.56 
 
 		 243 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  41.56 
 
 		 243 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  46.22 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  44.04 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  41.23 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  42.66 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 233 aa  178  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  42.22 
 
 		 229 aa  177  9e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  40.99 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1095  DNA repair protein RadC  43.66 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.912816  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3837  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00013144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  40.89 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2739  DNA repair protein RadC  41.59 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  37.73 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  39.64 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  40.85 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  39.64 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  38.74 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  38.12 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  40.99 
 
 		 224 aa  167  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  38.67 
 
 		 243 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 224 aa  167  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  38.29 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1225  truncated DNA repair protein RadC  48.02 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.247593  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0081  DNA repair protein RadC  42.34 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3828  DNA repair protein RadC  36.94 
 
 		 225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.760529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>