More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2664 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 224 aa  443  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  73.21 
 
 		 224 aa  327  8e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  74.55 
 
 		 223 aa  322  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  72.32 
 
 		 242 aa  315  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  70.98 
 
 		 224 aa  313  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  68.3 
 
 		 224 aa  311  4.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  69.2 
 
 		 224 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  69.2 
 
 		 224 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  69.2 
 
 		 224 aa  308  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  66.52 
 
 		 224 aa  308  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  71.43 
 
 		 224 aa  307  6.999999999999999e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  68.75 
 
 		 224 aa  303  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  66.07 
 
 		 224 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  65.62 
 
 		 224 aa  299  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  64.73 
 
 		 224 aa  291  7e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  62.95 
 
 		 224 aa  286  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0528  DNA repair protein RadC  64.86 
 
 		 224 aa  285  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0358  DNA repair protein RadC  64.86 
 
 		 224 aa  285  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  63.39 
 
 		 224 aa  285  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2597  DNA repair protein RadC  66.52 
 
 		 224 aa  282  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000367988  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  61.61 
 
 		 224 aa  281  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5284  DNA repair protein RadC  59.38 
 
 		 226 aa  274  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  63.39 
 
 		 223 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5194  DNA repair protein RadC  59.38 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0102732  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0186  DNA repair protein RadC  59.82 
 
 		 226 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.953222  hitchhiker  0.000000662884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  62.5 
 
 		 225 aa  270  9e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  62.95 
 
 		 224 aa  270  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  62.05 
 
 		 224 aa  270  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  58.93 
 
 		 224 aa  265  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  60.81 
 
 		 224 aa  264  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  63.11 
 
 		 234 aa  260  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  60.71 
 
 		 224 aa  260  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3828  DNA repair protein RadC  56.25 
 
 		 225 aa  259  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.760529  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0327  DNA repair protein RadC  59.38 
 
 		 225 aa  257  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000320995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  62.22 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  58.48 
 
 		 224 aa  250  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5335  DNA repair protein RadC  56.7 
 
 		 226 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3837  DNA repair protein RadC  54.91 
 
 		 225 aa  249  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00013144  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1917  DNA repair protein RadC  56 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  55.8 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0385  DNA repair protein RadC  56.7 
 
 		 225 aa  248  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00103198  hitchhiker  0.000000153707 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  53.57 
 
 		 224 aa  248  5e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  57.14 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0326  DNA repair protein RadC  54.46 
 
 		 225 aa  246  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0110  DNA repair protein RadC  57.27 
 
 		 242 aa  245  3e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0125  DNA repair protein RadC  57.27 
 
 		 242 aa  245  3e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0402  DNA repair protein RadC  57.59 
 
 		 225 aa  244  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000130829  hitchhiker  0.000000000166485 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0388  DNA repair protein RadC  57.59 
 
 		 225 aa  244  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000131294  hitchhiker  0.0000732355 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0377  DNA repair protein RadC  57.59 
 
 		 225 aa  244  6e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000108999  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0056  DNA repair protein RadC  51.8 
 
 		 225 aa  244  9e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183755  normal  0.0623388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0462  DNA repair protein RadC  57.14 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000108191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4561  DNA repair protein RadC  53.57 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000169917  hitchhiker  0.00000617306 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0376  DNA repair protein RadC  57.59 
 
 		 225 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000147811  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  56.7 
 
 		 224 aa  242  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4842  DNA repair protein RadC  54.95 
 
 		 227 aa  241  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000109613  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3597  DNA repair protein RadC  57.59 
 
 		 225 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0215962  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4248  DNA repair protein RadC  57.59 
 
 		 225 aa  241  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0359  DNA repair protein RadC  57.59 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3770  DNA repair protein RadC  57.59 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625851  normal  0.642753 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  57.21 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  53.64 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0055  DNA repair protein RadC  52.27 
 
 		 222 aa  231  7.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00110117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4155  DNA repair protein RadC  52.27 
 
 		 222 aa  231  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000385869  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0061  DNA repair protein RadC  52.27 
 
 		 222 aa  231  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000803057  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00049  DNA repair protein RadC  49.11 
 
 		 225 aa  230  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00103184  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  54.34 
 
 		 221 aa  230  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3142  DNA repair protein RadC  57.52 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00442306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  51.66 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  51.6 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3339  DNA repair protein RadC  55.8 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0155907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  50.23 
 
 		 221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0948  DNA repair protein RadC  54.91 
 
 		 244 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  0.486956 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  47.89 
 
 		 222 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  47.89 
 
 		 222 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  47.89 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3252  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  47.89 
 
 		 222 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  47.89 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  47.89 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1654  DNA repair protein RadC  50.83 
 
 		 237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794365  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  47.89 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  47.89 
 
 		 222 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  47.89 
 
 		 214 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  49.77 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  49.77 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  49.77 
 
 		 221 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  49.77 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  49.77 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  50.23 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  48.39 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2119  DNA repair protein RadC  47.53 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3773  DNA repair protein RadC  50.63 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3450  DNA repair protein RadC  52.28 
 
 		 238 aa  204  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268052  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2695  DNA repair protein RadC  59.46 
 
 		 222 aa  204  9e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2777  DNA repair protein RadC  51.87 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1834  DNA repair protein RadC  47.09 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1904  DNA repair protein RadC  54.42 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000968261 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2553  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2409  DNA repair protein RadC  49.52 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1733  DNA repair protein RadC  48.33 
 
 		 239 aa  198  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.112707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>