More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2073 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 243 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  75.93 
 
 		 243 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  75.93 
 
 		 243 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  69.71 
 
 		 243 aa  357  8e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  67.9 
 
 		 243 aa  344  6e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  66.8 
 
 		 243 aa  344  8e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1227  DNA repair protein RadC  60.83 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.179342 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  43.04 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  43.04 
 
 		 226 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  39.38 
 
 		 236 aa  174  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  41.07 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  41.07 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  41.07 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  40.18 
 
 		 225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  40.27 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  40.62 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  40.62 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  40.18 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  39.29 
 
 		 225 aa  168  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  43.04 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  42.17 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  40.69 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  40.87 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  39.09 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  38.5 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  37.66 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  37.95 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  40.62 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  38.63 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  38.74 
 
 		 231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  38.74 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0147  DNA repair protein RadC  40.62 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  37.72 
 
 		 227 aa  149  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3048  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000891178  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  41.67 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  39.38 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1494  DNA repair protein  40.17 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000647961  decreased coverage  0.0000976606 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  39.71 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  38.33 
 
 		 228 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  35.44 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  37.05 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  38.39 
 
 		 227 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  38.12 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0820  DNA repair protein RadC  39.81 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  38.67 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0101  DNA repair protein RadC  39.56 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  39.82 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  38.79 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  39.11 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  39.38 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  37.34 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  36.82 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3170  DNA repair protein RadC  40.44 
 
 		 185 aa  142  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  38.05 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  41.85 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0110  DNA repair protein RadC  38.18 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  36.28 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0125  DNA repair protein RadC  38.18 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  38.79 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  38.26 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  38.18 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  37.72 
 
 		 229 aa  138  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  35.98 
 
 		 227 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  39.01 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  38.91 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  37.27 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  37.56 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0973  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0917  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.372898  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1153  DNA repair protein  37.87 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2092  DNA repair protein RadC  38.84 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  35.24 
 
 		 234 aa  135  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  39.09 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2739  DNA repair protein RadC  36.64 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  35.16 
 
 		 215 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0894  DNA repair protein RadC  39.45 
 
 		 227 aa  135  8e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.823184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0523  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 231 aa  134  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  36.28 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  40.65 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  38.12 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  33.48 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  36.84 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1225  truncated DNA repair protein RadC  42.55 
 
 		 184 aa  133  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.247593  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  34.7 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  38.64 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2777  DNA repair protein RadC  36.86 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  32.89 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1917  DNA repair protein RadC  34.57 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  36.41 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00049  DNA repair protein RadC  34.74 
 
 		 225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00103184  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  36.36 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  36.87 
 
 		 224 aa  129  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>