More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3938 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3938  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 222 aa  417  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0199142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3887  DNA repair protein RadC  82.68 
 
 		 235 aa  271  7e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3824  DNA repair protein RadC  86.75 
 
 		 235 aa  267  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3965  DNA repair protein RadC  86.14 
 
 		 235 aa  265  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.207152  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3935  DNA repair protein RadC  68.52 
 
 		 222 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102944 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3937  DNA repair protein RadC  66.46 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.040495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1122  DNA repair protein RadC  64.33 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3262  DNA repair protein RadC  62.72 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  44 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  42.37 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  40.8 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 241 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  38.25 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  38.29 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  37.57 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  39.55 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  32.37 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  36.31 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  34.3 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1225  truncated DNA repair protein RadC  31.18 
 
 		 184 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.247593  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  29.11 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  36.93 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  34.64 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1917  DNA repair protein RadC  33.69 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 246 aa  97.4  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3142  DNA repair protein RadC  38.42 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00442306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  34.05 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  34.05 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05605  putative DNA repair protein  33.15 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.762004  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  35.57 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  33.93 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  33.93 
 
 		 223 aa  96.3  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1718  DNA repair protein RadC  31.95 
 
 		 184 aa  95.9  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1752  DNA repair protein RadC  31.95 
 
 		 184 aa  95.9  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.351254  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  34.27 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  36.72 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  25.88 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  37.14 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  38.15 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  37.14 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  34.13 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  37.14 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  34.52 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  35.8 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  35.79 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  33.52 
 
 		 224 aa  92.8  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  35.47 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  38.29 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  33.52 
 
 		 243 aa  92.8  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  36.31 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  34.38 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0125  DNA repair protein RadC  35.52 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  34.13 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0110  DNA repair protein RadC  35.52 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0491  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 226 aa  91.7  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  30.95 
 
 		 222 aa  91.3  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  35.93 
 
 		 221 aa  91.7  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  36.93 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  35.8 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  30.41 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0523  DNA repair protein RadC  32.75 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  39.08 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0101  DNA repair protein RadC  32.35 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  33.9 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0781  DNA repair protein RadC  41.71 
 
 		 262 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3170  DNA repair protein RadC  33.53 
 
 		 185 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  30.06 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0979  DNA repair protein RadC  41.71 
 
 		 278 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0984  DNA repair protein RadC  41.71 
 
 		 278 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2230  DNA repair protein RadC  41.71 
 
 		 278 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  34.48 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1139  DNA repair protein RadC  41.71 
 
 		 278 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  37.14 
 
 		 257 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1020  DNA repair protein RadC  41.71 
 
 		 278 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.569834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2099  DNA repair protein RadC  41.71 
 
 		 278 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.208076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2646  DNA repair protein RadC  41.71 
 
 		 278 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  33.87 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  34.08 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  30.11 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  30.36 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  30.34 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  33.52 
 
 		 231 aa  89  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  40.45 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0585  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 242 aa  88.2  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  28.16 
 
 		 229 aa  88.2  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  34.13 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  33.52 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  33.51 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1153  DNA repair protein  29.53 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3837  DNA repair protein RadC  32.95 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00013144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0147  DNA repair protein RadC  36.79 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  32.63 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1494  DNA repair protein  30.3 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000647961  decreased coverage  0.0000976606 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2597  DNA repair protein RadC  31.21 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000367988  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  35.96 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  37.71 
 
 		 225 aa  85.5  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  33.52 
 
 		 224 aa  85.5  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00049  DNA repair protein RadC  30.06 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00103184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>