More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0147 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0147  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 226 aa  434  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  43.54 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  42.5 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  42.64 
 
 		 228 aa  175  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  42.36 
 
 		 241 aa  176  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  42.11 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  42.58 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  43.54 
 
 		 226 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  42.11 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  41.63 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  41.63 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  41.63 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  41.15 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  41.63 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  41.63 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  43.54 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  40.19 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  43.4 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  42.57 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  37.8 
 
 		 236 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  48.33 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  41.79 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  42.51 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  41.9 
 
 		 227 aa  161  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  41.55 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  40.36 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  41.98 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  41.98 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  43.35 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  43.41 
 
 		 233 aa  158  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  42.06 
 
 		 231 aa  157  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  40.62 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  38.1 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  48.04 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1733  DNA repair protein RadC  38.05 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.112707  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  42.06 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  40.48 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  40.57 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  39.62 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  40.19 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  42.58 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  40.39 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  36.89 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  42.65 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  39.17 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  38.39 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0110  DNA repair protein RadC  40.19 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  37.62 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  42.06 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0125  DNA repair protein RadC  40.19 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  38.86 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  42.29 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  39.09 
 
 		 206 aa  145  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  34.8 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  41.75 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  39.27 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  41.75 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  41.75 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  39.23 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  38.36 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  40.19 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  38.97 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  36.2 
 
 		 224 aa  141  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3142  DNA repair protein RadC  42.5 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00442306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  35.45 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  39 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4155  DNA repair protein RadC  38.28 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000385869  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  39.81 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0794  DNA repair protein RadC  43.27 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.132133 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0055  DNA repair protein RadC  38.28 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00110117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0061  DNA repair protein RadC  38.28 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000803057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  40.55 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  36.09 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  42.58 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0820  DNA repair protein RadC  33.49 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  37.98 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  38.28 
 
 		 221 aa  138  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  37.56 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  37.69 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  39.9 
 
 		 224 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  35.75 
 
 		 224 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  38.57 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2230  DNA repair protein RadC  44.23 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  38.46 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  38.76 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2099  DNA repair protein RadC  44.23 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.208076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1139  DNA repair protein RadC  44.23 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2646  DNA repair protein RadC  44.23 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0979  DNA repair protein RadC  44.23 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1020  DNA repair protein RadC  44.23 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.569834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0984  DNA repair protein RadC  44.23 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  42 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00049  DNA repair protein RadC  34.45 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00103184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>