More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2739 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2739  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 225 aa  455  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  51.57 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0302  DNA repair protein RadC  52.47 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0081  DNA repair protein RadC  50.22 
 
 		 220 aa  219  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3048  DNA repair protein RadC  44.39 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000891178  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2092  DNA repair protein RadC  41.31 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  41.59 
 
 		 226 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  42.15 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  40.81 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  40.36 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  41.92 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0110  hypothetical protein  43.93 
 
 		 247 aa  162  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.222701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  41.74 
 
 		 228 aa  161  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 225 aa  161  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  40.18 
 
 		 236 aa  158  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  40.72 
 
 		 241 aa  154  8e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  40.37 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  38.81 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  38.4 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  36.84 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  37.9 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  40.91 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  37.9 
 
 		 227 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  40.27 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  38.6 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0973  DNA repair protein RadC  39.9 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0497584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  39.19 
 
 		 223 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  37.83 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  37.79 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  37.55 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  40.45 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  36.73 
 
 		 229 aa  141  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  35.22 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  37.73 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  39.22 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  38.22 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  35.78 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  36.89 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  37.89 
 
 		 243 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  37.89 
 
 		 243 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  38.33 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  38.6 
 
 		 227 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  36.89 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  37.38 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  36.99 
 
 		 235 aa  135  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  36.73 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  36.64 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  35.14 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  35.56 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  36.56 
 
 		 243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  43.21 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  36.76 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  38.7 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0101  DNA repair protein RadC  37.39 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  34.25 
 
 		 222 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  34.93 
 
 		 243 aa  128  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  36.21 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  34.25 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  41.98 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  34.25 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  33.79 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  33.94 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  33.94 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  33.94 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  33.79 
 
 		 214 aa  125  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 232 aa  125  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  34.96 
 
 		 225 aa  124  8.000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  36.28 
 
 		 237 aa  124  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  33.96 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  34.07 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  33.94 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  34.07 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  34.07 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  34.07 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  37.43 
 
 		 186 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  36.24 
 
 		 215 aa  122  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  33.63 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  34.5 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1153  DNA repair protein  33.94 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3737  DNA repair protein RadC  39.74 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  35.87 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1718  DNA repair protein RadC  37.84 
 
 		 184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  39.63 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1752  DNA repair protein RadC  37.84 
 
 		 184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.351254  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  35.24 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  35.78 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2168  DNA repair protein RadC  43.2 
 
 		 163 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00702134  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0216  DNA repair protein RadC  43.2 
 
 		 163 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>