More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1227 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1227  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 244 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.179342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  66.94 
 
 		 243 aa  322  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  64.46 
 
 		 243 aa  315  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  63.33 
 
 		 243 aa  311  6.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  63.33 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  63.33 
 
 		 243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  60.83 
 
 		 243 aa  295  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  40.44 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  41.4 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  36.48 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  35.78 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  39.11 
 
 		 226 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  38.43 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  38.67 
 
 		 225 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 228 aa  162  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  37.55 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  37.55 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  37.55 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  38.22 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  37.55 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  37.12 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  36.68 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  37.12 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  36.12 
 
 		 229 aa  158  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  38.39 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  39.41 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  40.36 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  43.4 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  40.62 
 
 		 229 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  39.11 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  38.29 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  37.55 
 
 		 231 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  35.34 
 
 		 229 aa  151  7e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  41.47 
 
 		 223 aa  151  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  36.77 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  39.74 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  39.21 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  37.84 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  36.96 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  41.74 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  36.21 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  35.22 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0358  DNA repair protein RadC  41.67 
 
 		 224 aa  143  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0732931  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0528  DNA repair protein RadC  41.67 
 
 		 224 aa  143  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.204187  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0820  DNA repair protein RadC  37.27 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  36.24 
 
 		 222 aa  143  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00049  DNA repair protein RadC  36.79 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00103184  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  36.73 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  35.38 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  34.35 
 
 		 227 aa  141  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  38.64 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  35.53 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  40.18 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1494  DNA repair protein  37.56 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000647961  decreased coverage  0.0000976606 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  37.85 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  35.91 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  39.25 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  35.68 
 
 		 223 aa  138  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  35.5 
 
 		 235 aa  138  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  38.64 
 
 		 225 aa  138  7.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  38.99 
 
 		 224 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0101  DNA repair protein RadC  35.81 
 
 		 243 aa  138  8.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1225  truncated DNA repair protein RadC  39.57 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.247593  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  37.85 
 
 		 221 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  37.85 
 
 		 221 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  37.85 
 
 		 221 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  37.85 
 
 		 221 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  35.94 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1153  DNA repair protein  37.28 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  40.37 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  38.32 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  39.27 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  33.62 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  36.45 
 
 		 221 aa  136  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  36.53 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  37.85 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0523  DNA repair protein RadC  35.45 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  38.64 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  37.38 
 
 		 221 aa  135  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  35.48 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  37.84 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  39.63 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  38.18 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  38.64 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  35.48 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  39.35 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  34.91 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  35.48 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  32.6 
 
 		 232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  35.51 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  39.55 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  35.51 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  35.51 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  35.51 
 
 		 214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  38.74 
 
 		 186 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  35.51 
 
 		 222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>