More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1864 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  73.78 
 
 		 225 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  66.67 
 
 		 225 aa  316  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1625  DNA repair protein RadC  59.45 
 
 		 229 aa  266  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1428  DNA repair protein RadC  50.9 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00255062  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  50.67 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  41.18 
 
 		 242 aa  174  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  43.5 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  42.99 
 
 		 275 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  42.66 
 
 		 242 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  41.89 
 
 		 230 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  41.74 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  43.98 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  42.99 
 
 		 275 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  42.2 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  40.72 
 
 		 236 aa  168  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  42.2 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  42.2 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  40.27 
 
 		 254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  39.27 
 
 		 228 aa  162  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  42.59 
 
 		 260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  38.99 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  42.01 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  42.01 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  41.63 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  40.62 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  41.63 
 
 		 250 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  41.74 
 
 		 275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  42.2 
 
 		 251 aa  154  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  41.94 
 
 		 248 aa  154  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  37.16 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  39.35 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  41.18 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  41.55 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  39.45 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  40.37 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  38.5 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  37.33 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  40.37 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  39.17 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  39.37 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  39.27 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  39.17 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  41.33 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  33.18 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  37.38 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  38.25 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  36.87 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  35.45 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3283  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  35.29 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  35.45 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0257  DNA repair protein RadC  35.59 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  37.56 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  41.48 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  36.24 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  37.56 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  37.56 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  36.65 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  38.03 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  41.57 
 
 		 209 aa  131  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  35.81 
 
 		 224 aa  131  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  37.33 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  39.63 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  37.96 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  35.35 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  35.51 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  35.81 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  34.88 
 
 		 236 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3148  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 259 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.886628  normal  0.925448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  35.02 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  34.56 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  42.31 
 
 		 196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  36.04 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  36.7 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3252  DNA repair protein RadC  35.71 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0948  DNA repair protein RadC  36.45 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  36.02 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00049  DNA repair protein RadC  33.02 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00103184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  36.04 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  36.14 
 
 		 230 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  34.65 
 
 		 227 aa  124  8.000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  34.27 
 
 		 224 aa  124  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  38.14 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  37.62 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  37.85 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3339  DNA repair protein RadC  36.45 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0155907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  38.14 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05605  putative DNA repair protein  34.72 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.762004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  38.54 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  33.94 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  34.72 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0056  DNA repair protein RadC  31.63 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183755  normal  0.0623388 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0794  DNA repair protein RadC  35.81 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.132133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1654  DNA repair protein RadC  35.11 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794365  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  35.68 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1733  DNA repair protein RadC  35.78 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.112707  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  33.33 
 
 		 224 aa  121  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>