More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2833 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  99.1 
 
 		 254 aa  447  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  87.44 
 
 		 261 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  72.41 
 
 		 263 aa  333  9e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  70.04 
 
 		 258 aa  320  9.999999999999999e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  68.61 
 
 		 254 aa  305  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  65.32 
 
 		 257 aa  279  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  64.06 
 
 		 230 aa  251  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  59.49 
 
 		 278 aa  250  9.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  62.37 
 
 		 275 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  56.54 
 
 		 275 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  62.9 
 
 		 247 aa  244  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  59.62 
 
 		 242 aa  244  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  63.44 
 
 		 246 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  58.76 
 
 		 251 aa  242  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  60.2 
 
 		 273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  61.83 
 
 		 248 aa  241  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  61.83 
 
 		 248 aa  241  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  60.22 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  55.12 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  57.14 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  55.38 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  56.45 
 
 		 241 aa  231  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  59.56 
 
 		 226 aa  228  5e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  54.29 
 
 		 254 aa  228  8e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  56.87 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  58.33 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  56.86 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  55.91 
 
 		 265 aa  224  6e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  54.55 
 
 		 249 aa  221  7e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  55.5 
 
 		 239 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  54.55 
 
 		 246 aa  221  8e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  57.81 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  55.5 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  59.77 
 
 		 209 aa  216  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  52.15 
 
 		 255 aa  201  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  54.12 
 
 		 203 aa  197  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  54.12 
 
 		 196 aa  192  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  46.81 
 
 		 245 aa  178  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  51.14 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  44.98 
 
 		 272 aa  175  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  40.41 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  41.4 
 
 		 230 aa  168  5e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5346  DNA repair protein RadC  52.08 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.67199 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  38.71 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3721  DNA repair protein RadC  68.32 
 
 		 138 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0768638  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  48.07 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1428  DNA repair protein RadC  42.71 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00255062  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  39.78 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  39.67 
 
 		 275 aa  138  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3283  DNA repair protein RadC  41.4 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  38.3 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0229  DNA repair protein RadC  37.63 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  43.65 
 
 		 228 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  39.78 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  37.1 
 
 		 272 aa  131  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1542  DNA repair protein RadC  66.67 
 
 		 162 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0350169 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  41.27 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  38.71 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  31.05 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  41.67 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0061  DNA repair protein RadC  35.91 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000803057  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4155  DNA repair protein RadC  35.91 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000385869  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  41.4 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0055  DNA repair protein RadC  35.91 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00110117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0257  DNA repair protein RadC  38.5 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  37.63 
 
 		 232 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1625  DNA repair protein RadC  39.38 
 
 		 229 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  38.59 
 
 		 224 aa  121  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0208  DNA repair protein RadC  48.25 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0478736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  36.96 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  38.76 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  38.59 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  34.81 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  34.81 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  34.81 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  38.04 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  34.81 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  34.81 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  39.13 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5194  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0102732  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5284  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  37.57 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3148  DNA repair protein RadC  39.11 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.886628  normal  0.925448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  35.33 
 
 		 224 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  36.78 
 
 		 221 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  35.68 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5335  DNA repair protein RadC  38.04 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  36.78 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  38.89 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4842  DNA repair protein RadC  33.7 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000109613  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0585  DNA repair protein RadC  39.11 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  34.81 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0186  DNA repair protein RadC  36.46 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.953222  hitchhiker  0.000000662884 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  33.7 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  33.7 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>