More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1909 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1909  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 249 aa  510  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1283  DNA repair protein RadC  89.96 
 
 		 249 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0949779  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1246  DNA repair protein RadC  90.57 
 
 		 246 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.114408  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  69.96 
 
 		 275 aa  319  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  70.14 
 
 		 275 aa  318  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  68.61 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2270  DNA repair protein RadC  68.78 
 
 		 278 aa  310  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0335  DNA repair protein RadC  61.07 
 
 		 236 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75672 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0430  DNA repair protein RadC  64.73 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  65.02 
 
 		 242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  58.8 
 
 		 242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  64.13 
 
 		 247 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1459  DNA repair protein RadC  66.06 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.734795  hitchhiker  0.00198862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2599  DNA repair protein RadC  62.16 
 
 		 230 aa  295  5e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.187954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2898  DNA repair protein RadC  61.61 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0152  DNA repair protein RadC  61.92 
 
 		 239 aa  284  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  57.69 
 
 		 265 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2163  DNA repair protein RadC  58.85 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  60.43 
 
 		 238 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0700  DNA repair protein RadC  60.83 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2483  DNA repair protein RadC  57.6 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.582097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0389  DNA repair protein RadC  59.17 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.741641  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2207  DNA repair protein RadC  58.65 
 
 		 248 aa  275  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0585  DNA repair protein RadC  59.02 
 
 		 248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2304  DNA repair protein RadC  60.09 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.138327  normal  0.0504467 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0732  DNA repair protein RadC  57.01 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0286  DNA repair protein RadC  54.51 
 
 		 257 aa  265  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  55.96 
 
 		 273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0008  DNA repair protein RadC  54.39 
 
 		 258 aa  250  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0728991  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1171  DNA repair protein RadC  55.61 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  52.67 
 
 		 254 aa  245  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2764  DNA repair protein RadC  56.25 
 
 		 261 aa  244  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  53.64 
 
 		 226 aa  241  7e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1493  DNA repair protein RadC  55.5 
 
 		 255 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3052  DNA repair protein RadC  64.32 
 
 		 209 aa  235  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.184717  normal  0.163227 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  52.38 
 
 		 246 aa  234  7e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7387  DNA repair protein RadC  62.78 
 
 		 203 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2833  DNA repair protein RadC  57.81 
 
 		 223 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  45.66 
 
 		 245 aa  208  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  45.74 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  49.51 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5346  DNA repair protein RadC  53.96 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.67199 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1428  DNA repair protein RadC  44.7 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00255062  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3794  DNA repair protein RadC  52.87 
 
 		 196 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0842954  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5205  DNA repair protein RadC  47.06 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0363  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  41.55 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0054  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0649  DNA repair protein RadC  40.81 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0301917  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3721  DNA repair protein RadC  55.3 
 
 		 138 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0768638  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3086  DNA repair protein RadC  45.25 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2442  DNA repair protein RadC  40.44 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0675  DNA repair protein RadC  40.83 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.461756  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  43.5 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1462  RadC family DNA repair protein  36.99 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.457457  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0208  DNA repair protein RadC  46.51 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0478736 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1625  DNA repair protein RadC  42.31 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3283  DNA repair protein RadC  45.45 
 
 		 225 aa  152  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0757  DNA repair protein RadC  38.64 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1240  DNA repair protein  36.99 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.770366  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1263  DNA repair protein RadC  34.71 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.94843  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0229  DNA repair protein RadC  38.64 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  34.51 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1542  DNA repair protein RadC  50.41 
 
 		 162 aa  139  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0350169 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0257  DNA repair protein RadC  34.84 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  36.2 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  37.21 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0559  DNA repair protein RadC  35.27 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000678315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  35.71 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  34.93 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  41.67 
 
 		 227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  33.76 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0376  DNA repair protein RadC  34.53 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000147811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  34.53 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  33 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0186  DNA repair protein RadC  35.64 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.953222  hitchhiker  0.000000662884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  32.29 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  33 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  36.56 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  36.27 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0402  DNA repair protein RadC  34.53 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000130829  hitchhiker  0.000000000166485 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  33 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0388  DNA repair protein RadC  34.53 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000131294  hitchhiker  0.0000732355 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  33.96 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0377  DNA repair protein RadC  34.53 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000108999  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  33 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  33 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0326  DNA repair protein RadC  33.18 
 
 		 225 aa  125  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  33 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  33 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  33 
 
 		 222 aa  125  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  32.26 
 
 		 233 aa  125  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0210  DNA repair protein RadC  37.67 
 
 		 244 aa  125  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567078  normal  0.0524973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5284  DNA repair protein RadC  35.15 
 
 		 226 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  33 
 
 		 222 aa  125  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5194  DNA repair protein RadC  35.15 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0102732  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0462  DNA repair protein RadC  34.53 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000108191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>