More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0270 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0270  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 211 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2935  DNA repair protein RadC  41.15 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144285  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  36.49 
 
 		 223 aa  127  9.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3359  DNA repair protein RadC  43.75 
 
 		 158 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  34.46 
 
 		 224 aa  124  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1070  DNA repair protein RadC  31.96 
 
 		 272 aa  123  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0324215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  33.5 
 
 		 224 aa  121  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1032  DNA repair protein RadC  42.34 
 
 		 160 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2620  hypothetical protein  46.49 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  28.29 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  29.56 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4476  DNA repair protein RadC  30.69 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2636  DNA repair protein RadC  45.61 
 
 		 168 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0606643 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  32.22 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3410  RadC family DNA repair protein  41.07 
 
 		 158 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4804  RadC family DNA repair protein  41.07 
 
 		 158 aa  118  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36040  DNA repair protein RadC-like protein  46.85 
 
 		 168 aa  118  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4680  DNA repair protein, RadC family  41.07 
 
 		 158 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0308  RadC family DNA repair protein  42.34 
 
 		 159 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00747747  hitchhiker  0.00434898 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3209  RadC family DNA repair protein  41.07 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0625  DNA repair protein RadC, putative  34.93 
 
 		 218 aa  117  9e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.42242  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1655  DNA repair protein RadC  41.07 
 
 		 148 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153921  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2855  DNA repair protein, RadC family  41.07 
 
 		 158 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3350  RadC family DNA repair protein  41.96 
 
 		 158 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1402  DNA repair protein, RadC family  41.07 
 
 		 158 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0957622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4033  DNA repair protein RadC  34.95 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  30.65 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1125  DNA repair protein, RadC family  41.07 
 
 		 158 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2246  RadC family DNA repair protein  41.07 
 
 		 158 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  31.84 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5346  DNA repair protein RadC  31.16 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.67199 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1134  DNA repair protein RadC  46.43 
 
 		 169 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  35.75 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2347  DNA repair protein RadC  44.74 
 
 		 169 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00287634  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1867  DNA repair protein RadC  43.8 
 
 		 168 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4896  RadC family DNA repair protein  41.07 
 
 		 158 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2319  DNA repair protein RadC  46.9 
 
 		 169 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.094604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0492  DNA repair protein RadC  43.61 
 
 		 167 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3538  DNA repair protein RadC  45.61 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4842  DNA repair protein RadC  32.78 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000109613  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  45.13 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31260  RadC-like protein  46.02 
 
 		 168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145795  unclonable  2.34568e-22 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  30.17 
 
 		 221 aa  114  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1709  DNA repair protein RadC  31.94 
 
 		 275 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.537978 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1311  DNA repair protein RadC  29.56 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  32.24 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001836  DNA repair protein RadC  44.74 
 
 		 158 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1454  DNA repair protein RadC  31.44 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327679  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  44.25 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  30.66 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1062  RadC family DNA repair protein  40.18 
 
 		 158 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.130862 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08165  DNA repair protein RadC  35.26 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0474  DNA repair protein RadC  41.59 
 
 		 157 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  29.95 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  29.95 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  29.95 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3569  DNA repair protein RadC  31.13 
 
 		 254 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1043  DNA repair protein RadC  30.39 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.193077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  29.95 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1511  DNA repair protein RadC  30.89 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3773  DNA repair protein RadC  41.59 
 
 		 237 aa  111  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  30.73 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  29.95 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0357  DNA repair protein RadC  32.52 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3005  DNA repair protein RadC  37.78 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329509 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  31.87 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1772  DNA repair protein RadC  41.88 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0323381  normal  0.027226 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1362  DNA repair protein RadC  32.26 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1273  DNA repair protein RadC  44.35 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  30.39 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0575  DNA repair protein RadC  29.76 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0830  RadC family DNA repair protein  30.81 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0533914  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2597  DNA repair protein RadC  42.48 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000367988  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0948  DNA repair protein RadC  31.25 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3443  DNA repair protein RadC  39.82 
 
 		 159 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1654  DNA repair protein RadC  32.37 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794365  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1252  DNA repair protein RadC  45.3 
 
 		 169 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7509  DNA repair protein RadC  28.29 
 
 		 242 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2553  DNA repair protein RadC  33.83 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0932  DNA repair protein RadC  38.58 
 
 		 157 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0327  DNA repair protein RadC  32.78 
 
 		 225 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000320995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2621  DNA repair protein RadC  29.29 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0692  DNA repair protein RadC  38.71 
 
 		 158 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  30.05 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  30.05 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  30.05 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  30.05 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  30.73 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  30.05 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  30.05 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2077  DNA repair protein RadC  31 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  30.05 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2409  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6762  DNA repair protein RadC  29.76 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00351119  normal  0.181603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1904  DNA repair protein RadC  28.9 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000968261 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0720  DNA repair protein RadC  29.95 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  30.35 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1257  DNA repair protein RadC  35.9 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502332 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2374  DNA repair protein RadC  45.13 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>