More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1134 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1134  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 169 aa  342  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3538  DNA repair protein RadC  63.31 
 
 		 169 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2347  DNA repair protein RadC  63.31 
 
 		 169 aa  218  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00287634  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1252  DNA repair protein RadC  62.72 
 
 		 169 aa  214  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2620  hypothetical protein  66.67 
 
 		 169 aa  211  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2319  DNA repair protein RadC  61.54 
 
 		 169 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.094604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2636  DNA repair protein RadC  62.72 
 
 		 168 aa  210  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0606643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36040  DNA repair protein RadC-like protein  62.13 
 
 		 168 aa  204  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31260  RadC-like protein  61.54 
 
 		 168 aa  202  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145795  unclonable  2.34568e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1867  DNA repair protein RadC  60.36 
 
 		 168 aa  202  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1273  DNA repair protein RadC  63.23 
 
 		 168 aa  194  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4157  DNA repair protein RadC  52.9 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1658  hypothetical protein  49.7 
 
 		 169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00985169  normal  0.385856 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1383  putative DNA repair protein RadC  52.41 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  54.41 
 
 		 224 aa  157  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  53.52 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2951  DNA repair protein, RadC family protein  53.42 
 
 		 158 aa  151  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4202  DNA repair protein RadC  49.04 
 
 		 164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.21413 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  54.41 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1259  DNA repair protein RadC  54.3 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  59.68 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2357  DNA repair protein RadC  57.38 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.162482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1772  DNA repair protein RadC  56 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0323381  normal  0.027226 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  51.03 
 
 		 223 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001836  DNA repair protein RadC  50.35 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  54.4 
 
 		 224 aa  144  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  51.72 
 
 		 224 aa  144  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0308  RadC family DNA repair protein  50 
 
 		 159 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00747747  hitchhiker  0.00434898 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  49.66 
 
 		 242 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0121519 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1032  DNA repair protein RadC  49.32 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1455  RadC family DNA repair protein  51.39 
 
 		 157 aa  142  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  53.6 
 
 		 224 aa  141  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  51.72 
 
 		 224 aa  141  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1699  DNA repair protein RadC  52.7 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.233274  normal  0.0652003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1804  DNA repair protein RadC  52.38 
 
 		 168 aa  140  8e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4842  DNA repair protein RadC  56.03 
 
 		 227 aa  139  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000109613  hitchhiker  0.0000409278 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1776  DNA repair protein RadC  50.99 
 
 		 168 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.647543  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1238  DNA repair protein RadC  60.33 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1257  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  51.05 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0380  DNA repair protein RadC  51.7 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000656816 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  46.43 
 
 		 224 aa  138  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3209  RadC family DNA repair protein  53.6 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  52.48 
 
 		 224 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1402  DNA repair protein, RadC family  49.65 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0957622 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0055  DNA repair protein RadC  55.17 
 
 		 222 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00110117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3443  DNA repair protein RadC  44.65 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0061  DNA repair protein RadC  55.17 
 
 		 222 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000803057  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4063  DNA repair protein RadC  45.59 
 
 		 222 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000737579  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4155  DNA repair protein RadC  55.17 
 
 		 222 aa  137  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000385869  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2777  DNA repair protein RadC  54.29 
 
 		 238 aa  137  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3847  DNA repair protein RadC  45.59 
 
 		 222 aa  137  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.55148e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0625  DNA repair protein RadC  53.44 
 
 		 171 aa  137  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1125  DNA repair protein, RadC family  52.8 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2597  DNA repair protein RadC  53.6 
 
 		 224 aa  137  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000367988  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  50.35 
 
 		 224 aa  137  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2246  RadC family DNA repair protein  52.8 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3450  DNA repair protein RadC  54.29 
 
 		 238 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268052  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  50.81 
 
 		 224 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2855  DNA repair protein, RadC family  52.8 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1062  RadC family DNA repair protein  52.8 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.130862 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1655  DNA repair protein RadC  52.8 
 
 		 148 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153921  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3973  DNA repair protein RadC  45.59 
 
 		 222 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000015619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4139  DNA repair protein RadC  45.59 
 
 		 222 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000017896  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  46.75 
 
 		 224 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5008  DNA repair protein RadC  45.59 
 
 		 222 aa  137  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000900324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3521  DNA repair protein RadC  51.7 
 
 		 168 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4033  DNA repair protein RadC  51.43 
 
 		 225 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3928  DNA repair protein RadC  45.33 
 
 		 221 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0713663  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4055  DNA repair protein RadC  45.33 
 
 		 221 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.298214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3946  DNA repair protein RadC  45.33 
 
 		 221 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0929037  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  54.31 
 
 		 221 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4116  DNA repair protein RadC  45.33 
 
 		 221 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00598559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0073  DNA repair protein RadC  45.59 
 
 		 214 aa  136  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000433644  hitchhiker  0.000000188277 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03495  DNA repair protein RadC  45.59 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0032943  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  45.59 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  49.33 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1383  DNA repair protein RadC  51.22 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03447  hypothetical protein  45.59 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00415391  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4680  DNA repair protein, RadC family  52.8 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4804  RadC family DNA repair protein  52.8 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3410  RadC family DNA repair protein  52.8 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  50.37 
 
 		 224 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3359  DNA repair protein RadC  54.4 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  51.64 
 
 		 224 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0932  DNA repair protein RadC  53.6 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  59.29 
 
 		 234 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2888  DNA repair protein RadC  50.41 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3350  RadC family DNA repair protein  52 
 
 		 158 aa  135  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0948  DNA repair protein RadC  47.27 
 
 		 244 aa  135  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3339  DNA repair protein RadC  50.71 
 
 		 224 aa  134  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0155907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4896  RadC family DNA repair protein  52 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3133  DNA repair protein RadC  53.6 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0278844  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  47.29 
 
 		 222 aa  134  6.0000000000000005e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0125  DNA repair protein RadC  54.87 
 
 		 242 aa  134  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0110  DNA repair protein RadC  54.87 
 
 		 242 aa  134  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00049  DNA repair protein RadC  45.93 
 
 		 225 aa  134  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00103184  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3252  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 234 aa  134  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  47.06 
 
 		 221 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4009  DNA repair protein RadC  44.67 
 
 		 221 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.273398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>