More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4202 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4202  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 164 aa  327  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.21413 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1273  DNA repair protein RadC  60.13 
 
 		 168 aa  193  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4157  DNA repair protein RadC  60.78 
 
 		 168 aa  188  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1252  DNA repair protein RadC  56.86 
 
 		 169 aa  185  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3538  DNA repair protein RadC  54.14 
 
 		 169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1658  hypothetical protein  56.71 
 
 		 169 aa  181  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00985169  normal  0.385856 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2319  DNA repair protein RadC  53.5 
 
 		 169 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.094604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2620  hypothetical protein  56.21 
 
 		 169 aa  180  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2636  DNA repair protein RadC  50.96 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0606643 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1867  DNA repair protein RadC  51.59 
 
 		 168 aa  173  9e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36040  DNA repair protein RadC-like protein  52.23 
 
 		 168 aa  173  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31260  RadC-like protein  51.59 
 
 		 168 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000145795  unclonable  2.34568e-22 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  51.83 
 
 		 224 aa  171  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2347  DNA repair protein RadC  52.87 
 
 		 169 aa  170  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00287634  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1383  putative DNA repair protein RadC  55.78 
 
 		 158 aa  167  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  59.29 
 
 		 224 aa  165  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  58 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  55.33 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  58.28 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0948  DNA repair protein RadC  54.78 
 
 		 244 aa  157  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3339  DNA repair protein RadC  53.5 
 
 		 224 aa  157  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0155907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3450  DNA repair protein RadC  52.44 
 
 		 238 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268052  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4033  DNA repair protein RadC  54.29 
 
 		 225 aa  155  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2777  DNA repair protein RadC  51.83 
 
 		 238 aa  154  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001836  DNA repair protein RadC  49.67 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  54.67 
 
 		 223 aa  152  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3252  DNA repair protein RadC  49.39 
 
 		 234 aa  152  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1654  DNA repair protein RadC  51.83 
 
 		 237 aa  151  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0794365  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1134  DNA repair protein RadC  49.04 
 
 		 169 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3773  DNA repair protein RadC  50.32 
 
 		 237 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2951  DNA repair protein, RadC family protein  49.31 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0695  DNA repair protein RadC  54.27 
 
 		 222 aa  148  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.63774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3142  DNA repair protein RadC  56.76 
 
 		 226 aa  147  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00442306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2695  DNA repair protein RadC  55.06 
 
 		 222 aa  147  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1254  DNA repair protein RadC  51.06 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.621293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1396  DNA repair protein RadC  51.06 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  53.79 
 
 		 224 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  52.86 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0625  DNA repair protein RadC  52.86 
 
 		 171 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3005  DNA repair protein RadC  46.01 
 
 		 164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0692  DNA repair protein RadC  48.34 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2231  DNA repair protein RadC  63.28 
 
 		 193 aa  142  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.173334  normal  0.265512 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08165  DNA repair protein RadC  51.3 
 
 		 305 aa  142  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1904  DNA repair protein RadC  46.95 
 
 		 226 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000968261 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1455  RadC family DNA repair protein  49.68 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 224 aa  142  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2357  DNA repair protein RadC  50.67 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.162482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2888  DNA repair protein RadC  49.3 
 
 		 157 aa  142  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2355  DNA repair protein RadC  50.35 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  unclonable  0.000000132381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  51.43 
 
 		 224 aa  141  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 224 aa  141  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1182  DNA repair protein RadC  46.3 
 
 		 164 aa  140  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  49.33 
 
 		 224 aa  140  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  55.56 
 
 		 224 aa  139  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_33  DNA repair protein RadC  46.34 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1383  DNA repair protein RadC  47.89 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  50.71 
 
 		 257 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  50.71 
 
 		 257 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  50.71 
 
 		 257 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0794  DNA repair protein RadC  43.9 
 
 		 256 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.132133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  47.33 
 
 		 224 aa  137  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3298  DNA repair protein RadC  48.65 
 
 		 164 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 257 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3837  DNA repair protein RadC  43.29 
 
 		 225 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00013144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  48 
 
 		 224 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0326  DNA repair protein RadC  44.51 
 
 		 225 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2861  DNA repair protein RadC  48.23 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  43.29 
 
 		 224 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  48.48 
 
 		 224 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0685  DNA repair protein RadC  46.81 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.605515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1257  DNA repair protein RadC  46.5 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502332 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2597  DNA repair protein RadC  48 
 
 		 224 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000367988  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3481  DNA repair protein RadC  45.4 
 
 		 233 aa  134  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1776  DNA repair protein RadC  54.17 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.647543  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3828  DNA repair protein RadC  42.07 
 
 		 225 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.760529  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0946  DNA repair protein RadC  48.94 
 
 		 164 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0380  DNA repair protein RadC  54.29 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000656816 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2396  DNA repair protein  48.94 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  44.67 
 
 		 224 aa  133  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2927  DNA repair protein RadC  48.99 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1804  DNA repair protein RadC  54.17 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  0.391578 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0327  DNA repair protein RadC  47.83 
 
 		 225 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000320995  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  44 
 
 		 224 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  46.06 
 
 		 228 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1259  DNA repair protein RadC  52.78 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2184  DNA repair protein RadC  48.94 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0385  DNA repair protein RadC  43.29 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00103198  hitchhiker  0.000000153707 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  44.38 
 
 		 224 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0388  DNA repair protein RadC  49.23 
 
 		 225 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000131294  hitchhiker  0.0000732355 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0402  DNA repair protein RadC  49.23 
 
 		 225 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000130829  hitchhiker  0.000000000166485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0377  DNA repair protein RadC  49.23 
 
 		 225 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000108999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0492  DNA repair protein RadC  45.77 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0055  DNA repair protein RadC  45.65 
 
 		 222 aa  131  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00110117  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4248  DNA repair protein RadC  49.23 
 
 		 225 aa  131  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4155  DNA repair protein RadC  45.65 
 
 		 222 aa  131  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000385869  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0061  DNA repair protein RadC  45.65 
 
 		 222 aa  131  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000803057  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  49.33 
 
 		 242 aa  131  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3597  DNA repair protein RadC  49.23 
 
 		 225 aa  131  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0215962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2555  DNA repair protein RadC  56.52 
 
 		 193 aa  130  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3770  DNA repair protein RadC  49.23 
 
 		 225 aa  130  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.625851  normal  0.642753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>