More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0803 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0803  DNA repair protein, RadC-like  100 
 
 		 166 aa  332  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2277  DNA repair protein RadC  60.81 
 
 		 166 aa  187  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0786  DNA repair protein RadC  56.08 
 
 		 166 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1463  DNA repair protein RadC  53.42 
 
 		 167 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.794646 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1885  DNA repair protein RadC  58.55 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2168  DNA repair protein RadC  52.63 
 
 		 163 aa  160  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00702134  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3737  DNA repair protein RadC  52.41 
 
 		 168 aa  159  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0216  DNA repair protein RadC  51.97 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0275  DNA repair protein RadC  52.41 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00125645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  56.45 
 
 		 229 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  56.45 
 
 		 230 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  54.03 
 
 		 229 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  54.03 
 
 		 228 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  49.19 
 
 		 241 aa  130  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2374  DNA repair protein RadC  56.48 
 
 		 165 aa  130  9e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  55.74 
 
 		 231 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  55.74 
 
 		 231 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  50.41 
 
 		 229 aa  125  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  50.41 
 
 		 227 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  45.45 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  43.05 
 
 		 230 aa  124  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  48.25 
 
 		 228 aa  124  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  46.3 
 
 		 222 aa  124  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  49.59 
 
 		 236 aa  123  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  52.94 
 
 		 233 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  42.5 
 
 		 229 aa  122  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3111  DNA repair protein RadC  40.24 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  52.5 
 
 		 229 aa  121  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  41.67 
 
 		 227 aa  121  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  46.15 
 
 		 228 aa  120  8e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  52.46 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  51.85 
 
 		 227 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  54.37 
 
 		 231 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  53.85 
 
 		 227 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  45.38 
 
 		 235 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  48.65 
 
 		 206 aa  118  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  43.62 
 
 		 223 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  47.62 
 
 		 222 aa  117  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  47.93 
 
 		 225 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  49.59 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  48.41 
 
 		 223 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  50.43 
 
 		 226 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  50 
 
 		 223 aa  115  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  45.16 
 
 		 228 aa  115  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  49.57 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  47.11 
 
 		 225 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  47.11 
 
 		 225 aa  114  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  49.57 
 
 		 225 aa  114  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  47.11 
 
 		 225 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  47.11 
 
 		 225 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  47.11 
 
 		 225 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  47.11 
 
 		 225 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  46.28 
 
 		 225 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001836  DNA repair protein RadC  41.61 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  53.33 
 
 		 222 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  43.44 
 
 		 227 aa  111  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  45.53 
 
 		 223 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2951  DNA repair protein, RadC family protein  43.9 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  44.76 
 
 		 222 aa  108  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0144  DNA repair protein RadC  43.55 
 
 		 222 aa  108  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00783617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  40.94 
 
 		 224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  42.67 
 
 		 224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  40.27 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  47.58 
 
 		 224 aa  107  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  45.31 
 
 		 232 aa  107  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3133  DNA repair protein RadC  40.28 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0278844  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  39.29 
 
 		 227 aa  107  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  38.84 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1032  DNA repair protein RadC  44.72 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1257  DNA repair protein RadC  42.28 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.502332 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3004  DNA repair protein RadC  49.55 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00190795  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  38.57 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0302  DNA repair protein RadC  40.3 
 
 		 225 aa  105  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473834 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3359  DNA repair protein RadC  45.53 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0308  RadC family DNA repair protein  44.72 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00747747  hitchhiker  0.00434898 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1455  RadC family DNA repair protein  38.57 
 
 		 157 aa  104  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  39.6 
 
 		 224 aa  104  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0101  DNA repair protein RadC  41.6 
 
 		 221 aa  103  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000716823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0244  DNA repair protein  47.06 
 
 		 151 aa  103  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.483345  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  37.7 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1655  DNA repair protein RadC  45.53 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153921  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4680  DNA repair protein, RadC family  45.53 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1402  DNA repair protein, RadC family  45.53 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0957622 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  43.8 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2855  DNA repair protein, RadC family  45.53 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2246  RadC family DNA repair protein  45.53 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1864  DNA repair protein RadC  42.4 
 
 		 225 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4896  RadC family DNA repair protein  45.53 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1772  DNA repair protein RadC  44.35 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0323381  normal  0.027226 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  40.8 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4100  DNA repair protein RadC  39.2 
 
 		 221 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0607652  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0750  RadC family DNA repair protein  40 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  43.69 
 
 		 221 aa  101  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1125  DNA repair protein, RadC family  45.08 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  43.55 
 
 		 224 aa  101  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  41.6 
 
 		 224 aa  101  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  43.2 
 
 		 232 aa  100  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0692  DNA repair protein RadC  42.74 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001821  DNA repair protein RadC  43.55 
 
 		 224 aa  100  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000198963  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4390  DNA repair protein RadC  39.2 
 
 		 221 aa  100  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00436549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>