More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2092 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2092  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3048  DNA repair protein RadC  54.17 
 
 		 221 aa  263  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000891178  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0081  DNA repair protein RadC  45.62 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 223 aa  202  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0302  DNA repair protein RadC  40.19 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2739  DNA repair protein RadC  41.31 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0973  DNA repair protein RadC  44.29 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0497584  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0110  hypothetical protein  38.39 
 
 		 247 aa  175  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.222701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  39.11 
 
 		 229 aa  168  8e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  42.73 
 
 		 230 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  37.95 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  37.95 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  37.95 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  37.95 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  37.95 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  38.36 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  37.95 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  37.95 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  36.73 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  37.95 
 
 		 225 aa  158  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  37.95 
 
 		 225 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  40.97 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  40.27 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  39.63 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  37.16 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 229 aa  151  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  36.7 
 
 		 223 aa  151  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 227 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  36.99 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  36.04 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  38.12 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  38.84 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  39.73 
 
 		 231 aa  148  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  39.37 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  37.1 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  35.91 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  38.39 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  36.94 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  34.7 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  36.4 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  40.17 
 
 		 227 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  35.14 
 
 		 228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0523  DNA repair protein RadC  38.5 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  35.45 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  36.41 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  35.29 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  38.91 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  36.57 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  37.44 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  38.07 
 
 		 230 aa  141  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  39.29 
 
 		 237 aa  141  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  38.53 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  36.94 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  35.92 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  36.4 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  36.4 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  35.32 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  39.47 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0820  DNA repair protein RadC  35.51 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  37 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  35.78 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  38.67 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  36.61 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5144  DNA repair protein RadC  38.6 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0917  DNA repair protein RadC  36.65 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.372898  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  39.09 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  35.4 
 
 		 243 aa  131  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  35.4 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  33.77 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  38.29 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  34.23 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  38.91 
 
 		 245 aa  128  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2162  DNA repair protein RadC  36.53 
 
 		 218 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1430  DNA repair protein RadC  33.49 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05605  putative DNA repair protein  38.79 
 
 		 231 aa  127  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.762004  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  32.73 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1153  DNA repair protein  35.19 
 
 		 233 aa  125  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0101  DNA repair protein RadC  33.63 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  33.96 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  36.19 
 
 		 228 aa  125  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3142  DNA repair protein RadC  37.56 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00442306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1494  DNA repair protein  36.11 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000647961  decreased coverage  0.0000976606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  35.71 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1890  DNA repair protein RadC  34.76 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3170  DNA repair protein RadC  37.02 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2501  DNA repair protein RadC  34.76 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970207  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2526  DNA repair protein RadC  34.76 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  34.91 
 
 		 233 aa  122  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  36.81 
 
 		 186 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  37.96 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  36.73 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  34.6 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  35.11 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5833  DNA repair protein RadC  35.07 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3450  DNA repair protein RadC  35.04 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268052  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0326  DNA repair protein RadC  35.16 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0327  DNA repair protein RadC  35.71 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000320995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>