More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0110 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0110  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.222701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0081  DNA repair protein RadC  48.83 
 
 		 220 aa  195  6e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  45.28 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0302  DNA repair protein RadC  47.17 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2092  DNA repair protein RadC  38.39 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3048  DNA repair protein RadC  42.11 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000891178  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2739  DNA repair protein RadC  43.93 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0973  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  38.65 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  39.29 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  36.28 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  35.29 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  35.43 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  37.84 
 
 		 229 aa  135  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  39.05 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  36.62 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  35.27 
 
 		 231 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  37.13 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  36.63 
 
 		 226 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  37.26 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  34.88 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  35.98 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  35.27 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  37.81 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  35.14 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  36.62 
 
 		 234 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  37.31 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  33.94 
 
 		 228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  34.68 
 
 		 235 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  34.74 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  36.73 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  35.61 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  36.16 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  35.12 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  35.65 
 
 		 224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  35.82 
 
 		 227 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0917  DNA repair protein RadC  35.24 
 
 		 225 aa  126  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.372898  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  32.24 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 227 aa  125  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0894  DNA repair protein RadC  34.38 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.823184 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  34.26 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  32.23 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  37.62 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  32.06 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  36.57 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  35.15 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  34.96 
 
 		 229 aa  122  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  31.94 
 
 		 224 aa  122  7e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  33.64 
 
 		 224 aa  121  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  36.04 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  31.28 
 
 		 224 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  37.13 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  35.12 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0820  DNA repair protein RadC  36.12 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  36.02 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  36.19 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0110  DNA repair protein RadC  33.64 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0523  DNA repair protein RadC  35.84 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0125  DNA repair protein RadC  33.64 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  32.7 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  32.38 
 
 		 225 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  32.86 
 
 		 222 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  33.66 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  32.21 
 
 		 229 aa  119  6e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  33.65 
 
 		 215 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  34.6 
 
 		 223 aa  118  7.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0101  DNA repair protein RadC  33.77 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  32.08 
 
 		 223 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  33.65 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  41.03 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  32.71 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02919  DNA repair protein RadC  34.51 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  36.95 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  33.5 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  33.94 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  33.94 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00049  DNA repair protein RadC  30.33 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00103184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  33.03 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  35 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  34.08 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1463  DNA repair protein RadC  38.85 
 
 		 167 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.794646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5284  DNA repair protein RadC  31.28 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  34.42 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  33.33 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  32.06 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  32.7 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  30.81 
 
 		 224 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  32.23 
 
 		 224 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  30.32 
 
 		 224 aa  111  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0818  DNA repair protein RadC  32.13 
 
 		 253 aa  111  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  32.54 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05605  putative DNA repair protein  34.11 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.762004  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00653  DNA repair protein RadC  30.33 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>