195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2240 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  100 
 
 		 339 aa  680    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  52.98 
 
 		 358 aa  322  7e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  52.8 
 
 		 372 aa  308  9e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  49.39 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  42.56 
 
 		 350 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  36.56 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  40.81 
 
 		 383 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  39.22 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  37.72 
 
 		 361 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  37.24 
 
 		 358 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  38.41 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  37.13 
 
 		 336 aa  172  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  36.13 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  38.43 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  32.34 
 
 		 629 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  36.03 
 
 		 341 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  35 
 
 		 353 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  36.78 
 
 		 323 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  36.13 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  34.55 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  34.64 
 
 		 337 aa  142  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  34.93 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  34.8 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.71 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.06 
 
 		 346 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  30.7 
 
 		 351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0614  amidohydrolase 2  35.25 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  32.67 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  31.74 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.9 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  33.46 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  29.6 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  30.1 
 
 		 320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  26.65 
 
 		 358 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  30.96 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3899  amidohydrolase 2  32.75 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.231791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  27.92 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  31.05 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  30.69 
 
 		 342 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  28.42 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  27.78 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  29.71 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  30.14 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  29.38 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  27.41 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  28.72 
 
 		 317 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  29.39 
 
 		 358 aa  100  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  28.18 
 
 		 325 aa  99.8  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  25 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  25 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  27.2 
 
 		 381 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  25.56 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  29.29 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  27.09 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  28.52 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  29.07 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  26.21 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  31.56 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  30.71 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  31.25 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  26.62 
 
 		 326 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  28.53 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  29.3 
 
 		 334 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  26.71 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  27.43 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  28.37 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  27.3 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  27.27 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  27.74 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  26.67 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  30.07 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  25.86 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  26.93 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  28.52 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  23.72 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  25.88 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  25.47 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  27.39 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  26.84 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  29.1 
 
 		 378 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  23.88 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  30.8 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  29.01 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  27.64 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  24.83 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  24.58 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  28.04 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  25.17 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  28.15 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07440  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  24.54 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.723165  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  25.74 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  22.9 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  22.53 
 
 		 342 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  26.69 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  24.29 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  26.09 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  25.29 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  25.2 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>