More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1979 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1979  peptidase M23B  100 
 
 		 409 aa  796    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.552283  normal  0.0521861 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1203  peptidase M23B  82.64 
 
 		 399 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.104562 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2543  peptidoglycan-binding LysM ( peptidase)  82.64 
 
 		 399 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.97237  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1793  peptidase M23B  53.79 
 
 		 426 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.532041  normal  0.0360441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2138  hypothetical protein  50.25 
 
 		 409 aa  331  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123403  normal  0.331255 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1065  peptidase M23B  46.79 
 
 		 373 aa  292  9e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0161444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2729  peptidase M23B  48.41 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  32 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  33.19 
 
 		 394 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  34.31 
 
 		 427 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  34.31 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  35.14 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  29.22 
 
 		 538 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  26.16 
 
 		 509 aa  98.6  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  35.32 
 
 		 291 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  30.5 
 
 		 257 aa  97.8  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  28.85 
 
 		 534 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  31.44 
 
 		 328 aa  97.1  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  32.35 
 
 		 287 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  34.35 
 
 		 275 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  30.47 
 
 		 323 aa  94.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  34.93 
 
 		 294 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  32.34 
 
 		 438 aa  93.6  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  29.18 
 
 		 465 aa  93.2  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  31.72 
 
 		 268 aa  93.2  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  32.63 
 
 		 509 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  27.96 
 
 		 530 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  34.48 
 
 		 274 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  31.74 
 
 		 230 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  30.24 
 
 		 295 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  44.74 
 
 		 446 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  31.44 
 
 		 286 aa  90.1  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  36.02 
 
 		 484 aa  89.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  33.06 
 
 		 478 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  26.49 
 
 		 283 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  34.24 
 
 		 297 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  31.82 
 
 		 240 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  36.77 
 
 		 500 aa  87.8  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  32.89 
 
 		 289 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  32.89 
 
 		 289 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  34.06 
 
 		 274 aa  87  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  43.86 
 
 		 455 aa  87  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  43.86 
 
 		 451 aa  87  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4989  Peptidase M23  31.64 
 
 		 267 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0293299  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  32.61 
 
 		 233 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  32.61 
 
 		 233 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  32.61 
 
 		 296 aa  86.7  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  32.61 
 
 		 296 aa  86.7  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  32.61 
 
 		 233 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  32.61 
 
 		 233 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  30.24 
 
 		 265 aa  86.3  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  31.67 
 
 		 333 aa  86.3  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  30.83 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  42.86 
 
 		 501 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  38.51 
 
 		 537 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  42.11 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  32.5 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  31.44 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  32.13 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  32.61 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  29.86 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  28.4 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  31 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  33.33 
 
 		 453 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  31.6 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  31 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  31 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  31 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  31.47 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  34.8 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  28.4 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  42.98 
 
 		 494 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3262  peptidase M23B  30.04 
 
 		 331 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  39.17 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  30.57 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  30.57 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  31 
 
 		 250 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  28.42 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  30.08 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  30.57 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  30.57 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  31.74 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  30.26 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  27.16 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  30.57 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  29.55 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  31.91 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  31.78 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  30.62 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  30.62 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5705  peptidase M23B  31.14 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246973 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  30.62 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  29.74 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  30.62 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  37.41 
 
 		 495 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  27.95 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  25.47 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4047  peptidase M23B  32.89 
 
 		 284 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  31.72 
 
 		 285 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  24.79 
 
 		 285 aa  79.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>