More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0808 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  100 
 
 
495 aa  1002    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  64.42 
 
 
516 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000038172  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  56.2 
 
 
503 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  53.02 
 
 
503 aa  501  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  49.49 
 
 
465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  43.59 
 
 
436 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  41.85 
 
 
400 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  26.54 
 
 
418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  26.84 
 
 
475 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  27.13 
 
 
394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  43.17 
 
 
412 aa  110  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  26.46 
 
 
431 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  24.4 
 
 
422 aa  98.6  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  26.43 
 
 
407 aa  98.6  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0079  peptidase M23  36.57 
 
 
419 aa  91.7  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.597935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3774  Peptidase M23  25.9 
 
 
446 aa  90.1  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  38.81 
 
 
372 aa  89.7  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  32.3 
 
 
500 aa  89.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  25 
 
 
387 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  31.46 
 
 
370 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  38.71 
 
 
449 aa  89.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  38.81 
 
 
373 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  23.13 
 
 
417 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  38.81 
 
 
372 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  37.5 
 
 
388 aa  87  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  39.72 
 
 
464 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  30.83 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  32.33 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  40.44 
 
 
478 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  38.3 
 
 
453 aa  84  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  37.18 
 
 
484 aa  83.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  26.84 
 
 
430 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  38.35 
 
 
471 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  39.55 
 
 
474 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  30.57 
 
 
440 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  39.84 
 
 
530 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2540  peptidase M23B  37.96 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.258183  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  33.73 
 
 
441 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  32.84 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  24.05 
 
 
434 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  34.07 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  33.81 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  39.06 
 
 
534 aa  80.1  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  35.56 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  35.19 
 
 
477 aa  79.7  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  35.56 
 
 
438 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  35.56 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  35.56 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2158  Peptidase M23  36.3 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  32.84 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  29.71 
 
 
344 aa  77  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  36.72 
 
 
509 aa  77  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  31.34 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  29.81 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  30.97 
 
 
362 aa  77  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  29.81 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  30.97 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  30.97 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  34.35 
 
 
372 aa  76.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  34.78 
 
 
420 aa  76.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  23.03 
 
 
396 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  30.97 
 
 
362 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1457  peptidase M23B  40.44 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  22.67 
 
 
456 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  32.93 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  37.31 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  34.31 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  33.09 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  32.56 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  22.67 
 
 
456 aa  73.2  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  36.8 
 
 
538 aa  73.2  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  31.9 
 
 
509 aa  73.6  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  30.32 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  21.31 
 
 
456 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  32.56 
 
 
436 aa  73.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1979  peptidase M23B  34.78 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.552283  normal  0.0521861 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  33.83 
 
 
458 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  35.48 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  37 
 
 
467 aa  71.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0849  peptidase M23B  36.51 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2869  Peptidase M23  35.88 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  30.6 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  33.33 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  34.69 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  29.2 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  30.84 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  33.07 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  33.33 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  35.48 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  33.9 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  36.08 
 
 
462 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1572  peptidase, M23/M37 family  33.33 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.42945e-48 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  33.08 
 
 
452 aa  70.1  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  31.76 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  22.94 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  35.21 
 
 
481 aa  70.1  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1362  cell wall endopeptidase  33.33 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.83171e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1361  cell wall endopeptidase  33.33 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000286273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1640  peptidase, M23/M37 family  33.33 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000676143  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  29.2 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>