167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2521 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3166  hypothetical protein  36.66 
 
 		 1652 aa  776    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2521  DNA helicase, putative  100 
 
 		 1697 aa  3404    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  37.93 
 
 		 1629 aa  894    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1974  DNA helicase, putative  38.21 
 
 		 1649 aa  925    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.915196 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1474 aa  455  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0920  superfamily I DNA/RNA helicase  28.47 
 
 		 1622 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0577  superfamily I DNA and RNA helicase subunits-like protein  27.39 
 
 		 1630 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2421  hypothetical protein  30.01 
 
 		 1724 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220469  normal  0.974769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2605  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1680 aa  345  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.6809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  36.88 
 
 		 1523 aa  315  4.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3050  superfamily I DNA/RNA helicase  35.1 
 
 		 1790 aa  315  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.266706 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0720  superfamily protein I DNA/RNA helicase  37.41 
 
 		 1490 aa  290  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  35.96 
 
 		 1489 aa  280  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3745  superfamily I DNA/RNA helicase  36.21 
 
 		 1694 aa  263  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  40.79 
 
 		 1557 aa  254  8.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  35.77 
 
 		 1410 aa  244  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1299  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1763 aa  244  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0991  superfamily I DNA/RNA helicase  35.1 
 
 		 2622 aa  240  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  34.24 
 
 		 1387 aa  231  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1222  superfamily I DNA/RNA helicase  29.64 
 
 		 1950 aa  142  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2107  superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunit  30.02 
 
 		 1958 aa  141  8.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1551  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.65 
 
 		 1403 aa  137  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3679  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1328 aa  136  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  29.57 
 
 		 1980 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1722 aa  134  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  29.62 
 
 		 1945 aa  133  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  29.36 
 
 		 1973 aa  133  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0861  putative DNA helicase  27.57 
 
 		 1958 aa  133  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0909  putative DNA helicase  29.16 
 
 		 2002 aa  132  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.331081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1823 aa  130  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  30.11 
 
 		 1986 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7588  DNA helicase related protein  28.33 
 
 		 2204 aa  123  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279157 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  27.85 
 
 		 1754 aa  122  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  27.83 
 
 		 1622 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  27.18 
 
 		 2207 aa  121  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1940  DNA helicase-related protein  26.8 
 
 		 1803 aa  121  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3784  DNA helicase related protein  26.82 
 
 		 2197 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.650978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3695  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1904 aa  118  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.932942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  28.1 
 
 		 905 aa  118  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  28.1 
 
 		 905 aa  118  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  29.35 
 
 		 2045 aa  118  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  29.52 
 
 		 1983 aa  118  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  28.73 
 
 		 2198 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  28.3 
 
 		 907 aa  117  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2942  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1801 aa  117  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139053 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  26.44 
 
 		 2016 aa  117  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  27.68 
 
 		 905 aa  116  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0990  putative DNA helicase related protein  28.05 
 
 		 1559 aa  116  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.649093 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1970  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  27.83 
 
 		 1853 aa  116  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.525095 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1773  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1575 aa  115  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.396183  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  27.92 
 
 		 905 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1574  superfamily I DNA/RNA helicase  26.19 
 
 		 1575 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.173807  normal  0.305759 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  27.68 
 
 		 900 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3040  DNA helicase related protein  26.9 
 
 		 2222 aa  112  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1211  putative DNA helicase  27.25 
 
 		 1991 aa  111  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.455109 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  27.79 
 
 		 2013 aa  111  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  27.84 
 
 		 1959 aa  110  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  26.33 
 
 		 1121 aa  110  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3286  hypothetical protein  26.59 
 
 		 1589 aa  109  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  27.21 
 
 		 905 aa  109  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1227  hypothetical protein  26.81 
 
 		 1589 aa  108  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.354813  hitchhiker  0.000000158554 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  27.43 
 
 		 1861 aa  106  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  26.91 
 
 		 906 aa  105  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  27.38 
 
 		 2123 aa  105  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1952  superfamily I DNA/RNA helicase  26.7 
 
 		 2096 aa  104  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.447363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2764  putative DNA/RNA helicase  26.55 
 
 		 1589 aa  104  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0829  putative DNA helicase related protein  27.8 
 
 		 1571 aa  104  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0276092 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  27.51 
 
 		 2759 aa  104  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  26.02 
 
 		 908 aa  103  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  24.79 
 
 		 1888 aa  100  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4744  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  28.39 
 
 		 1877 aa  100  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.994907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1108  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  27.97 
 
 		 1867 aa  100  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0948182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0753  DNA/RNA helicase  25.51 
 
 		 1559 aa  99.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6903  putative DNA helicase related protein  26.12 
 
 		 1593 aa  98.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.130907  normal  0.263192 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  25.18 
 
 		 1081 aa  96.3  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1572 aa  94.7  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.66 
 
 		 1203 aa  95.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0808  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1854 aa  92.8  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  28.46 
 
 		 903 aa  91.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1822 aa  89.4  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  26.33 
 
 		 1363 aa  88.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2528  hypothetical protein  24.95 
 
 		 2098 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28895  hypothetical protein  24.89 
 
 		 2098 aa  86.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.8357  hitchhiker  0.0000000156251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1416  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 		 2101 aa  86.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284923  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6413  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 		 2101 aa  86.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266578  normal  0.65163 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7073  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 		 2098 aa  86.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.305625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5700  serine/threonine protein kinase  25.39 
 
 		 2104 aa  85.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.919762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  25.73 
 
 		 2005 aa  85.5  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4582  superfamily I DNA helicase  28.39 
 
 		 1328 aa  84  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  28.39 
 
 		 1296 aa  84  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  24.31 
 
 		 1838 aa  78.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  26.37 
 
 		 946 aa  77  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0803  putative DNA helicase  25.7 
 
 		 2125 aa  75.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0818  putative DNA helicase  25.7 
 
 		 2125 aa  75.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0544273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.97 
 
 		 1196 aa  75.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  28.78 
 
 		 629 aa  74.3  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  27.15 
 
 		 958 aa  70.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  30.6 
 
 		 1099 aa  69.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2163  DNA helicase  21.96 
 
 		 1822 aa  69.7  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.540092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  28.32 
 
 		 1427 aa  67.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>