174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2098 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2098  hypothetical protein  100 
 
 		 1500 aa  2793    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2766  hypothetical protein  29.01 
 
 		 1463 aa  347  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.70976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2993  protein of unknown function DUF490  29.33 
 
 		 1463 aa  345  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.407315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2889  protein of unknown function DUF490  28.92 
 
 		 1441 aa  337  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.913216 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4225  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1428 aa  336  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.436488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1717  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1423 aa  326  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0158292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1002  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1487 aa  310  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19226  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2388  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1451 aa  308  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130143  normal  0.0161246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6778  protein of unknown function DUF490  29.97 
 
 		 1530 aa  304  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1489 aa  303  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2482  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1462 aa  301  6e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.915526  normal  0.262243 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2617  protein of unknown function DUF490  27.35 
 
 		 1424 aa  243  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0464  protein of unknown function DUF490  31.99 
 
 		 1550 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0413  protein of unknown function DUF490  27.19 
 
 		 1405 aa  213  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1130  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1783 aa  207  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0432  protein of unknown function DUF490  29.27 
 
 		 1448 aa  202  3e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.883753 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2904  protein of unknown function DUF490  41.76 
 
 		 1937 aa  202  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125236 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2888  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1869 aa  201  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6385  hypothetical protein  30.74 
 
 		 1448 aa  197  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4089  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1404 aa  191  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2200  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1396 aa  179  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.339994 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1183  hypothetical protein  32.72 
 
 		 1276 aa  178  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1561  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1406 aa  178  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.222268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2845  hypothetical protein  32.72 
 
 		 1276 aa  177  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0070  hypothetical protein  29.04 
 
 		 1270 aa  172  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0054  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1578 aa  172  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2645  hypothetical protein  30.52 
 
 		 1362 aa  171  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2622  hypothetical protein  31.22 
 
 		 1276 aa  169  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3627  protein of unknown function DUF490  27.92 
 
 		 2140 aa  163  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.1533 
 
 
-
 
NC_004310  BR0049  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1515 aa  158  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1343  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1550 aa  157  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0048  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1510 aa  155  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3915  protein of unknown function DUF490  26.68 
 
 		 2032 aa  153  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.411951 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1520  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1538 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0244  hypothetical protein  38.79 
 
 		 1206 aa  136  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3382  protein of unknown function DUF490  29.66 
 
 		 1084 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2678  hypothetical protein  30.11 
 
 		 1501 aa  134  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0447  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1352 aa  124  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2396  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1335 aa  124  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2797  hypothetical protein  26.31 
 
 		 1206 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.149049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2893  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1224 aa  112  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2396  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1223 aa  110  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2889  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1224 aa  110  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.224565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28850  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1232 aa  107  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3646  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1224 aa  107  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0441929 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0834  putative signal peptide protein  26.93 
 
 		 1243 aa  106  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654835  normal  0.24318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0830  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1256 aa  98.2  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0579081  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2750  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1229 aa  95.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478411  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4471  protein of unknown function DUF490  29.14 
 
 		 1359 aa  95.1  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3265  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1325 aa  94.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1657  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1443 aa  93.2  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0174  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1505 aa  91.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0672  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1401 aa  90.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31690  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1221 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2142  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1398 aa  89.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.048277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2695  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1221 aa  89.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0187  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1308 aa  88.6  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1835  hypothetical protein  25.39 
 
 		 1402 aa  88.6  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.242519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2113  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1385 aa  87.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1896  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1305 aa  87  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.705923  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2361  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1453 aa  86.7  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.284497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0856  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1346 aa  85.9  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.394645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2479  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1226 aa  85.5  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.502504 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1893  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1449 aa  85.5  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0229632 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0295  protein of unknown function DUF490  26.82 
 
 		 1382 aa  85.1  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.749583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0165  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1504 aa  84.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.615752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0173  protein of unknown function DUF490  29.81 
 
 		 1507 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1593  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1292 aa  84.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3162  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1453 aa  84  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.124572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2809  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1377 aa  83.2  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0184  protein of unknown function DUF490  29.81 
 
 		 1507 aa  83.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2391  protein of unknown function DUF490  24.29 
 
 		 1344 aa  83.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0970282  normal  0.146937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0461  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1218 aa  82.8  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1089  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1434 aa  82.8  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1935  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1344 aa  82.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.883664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1928  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1344 aa  82.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.764751  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1902  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1341 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1443  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1304 aa  79.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1615  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1297 aa  79.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.354502 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3956  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1473 aa  79  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1217  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1361 aa  78.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2688  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1290 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246331  normal  0.948604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2884  protein of unknown function DUF490  30.84 
 
 		 1378 aa  73.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.358808  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2173  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1299 aa  74.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0467553 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0383  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1395 aa  73.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3561  hypothetical protein  30.7 
 
 		 1380 aa  73.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.681268 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5264  protein of unknown function DUF490  24.07 
 
 		 1515 aa  72.4  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0856  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1346 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336201  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0706  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1372 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1821  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1056 aa  71.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1014  protein of unknown function DUF490  27.62 
 
 		 1443 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.954334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2307  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1372 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2979  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1372 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1054  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1372 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.985451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1620  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1372 aa  70.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1207  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1372 aa  69.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.420256  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2485  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1358 aa  69.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2353  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1360 aa  69.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.732619  normal  0.322584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2437  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1353 aa  69.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.240748  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2596  protein of unknown function DUF490  26.11 
 
 		 1304 aa  69.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346321 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>