More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3222 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3222  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 408 aa  791    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40917  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  77.89 
 
 		 409 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2819  major facilitator transporter  78.61 
 
 		 408 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2478  major facilitator transporter  67.01 
 
 		 398 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4473  major facilitator superfamily permease  65.26 
 
 		 402 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544881  normal  0.908548 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1830  major facilitator transporter  63.59 
 
 		 398 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121743  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1740  major facilitator transporter  64.86 
 
 		 403 aa  478  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3562  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5891  major facilitator transporter  38.9 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6507  major facilitator superfamily MFS_1  39.85 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1096  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 399 aa  179  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4758  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 417 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130699 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0995  putative membrane transport protein  31.81 
 
 		 416 aa  162  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2328  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 406 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0114986  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2064  major facilitator superfamily transporter  30.39 
 
 		 409 aa  149  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.380103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3614  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 401 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 402 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4422  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 474 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0527  MDR-like permease  23.87 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  27.45 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0877  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 458 aa  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7927  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437479  normal  0.239391 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  21.74 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4478  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  25 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  22.06 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  22.06 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  19.95 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4500  major facilitator superfamily transporter  29.84 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  21.18 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0354  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-2 (14 Spanner) (DHA2) family protein  27.81 
 
 		 542 aa  68.9  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  27.37 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  27.7 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  39.38 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  33.33 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5751  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.912985 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23780  arabinose efflux permease family protein  28.8 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2287  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 387 aa  67  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 411 aa  67  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3710  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.010262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  22.16 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05590  arabinose efflux permease family protein  31.39 
 
 		 502 aa  66.6  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  21.39 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  31.47 
 
 		 515 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.62 
 
 		 504 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0898  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 464 aa  66.2  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325125  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  23.6 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  27.23 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  27.23 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  27.23 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1772  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  23.6 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  23.6 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  23.6 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  23.6 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  21.71 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  23.6 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  27.23 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  27.23 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.62 
 
 		 498 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  26.38 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4017  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  28.22 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  27.04 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>