More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2310 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  100 
 
 		 1067 aa  2142    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  32.71 
 
 		 1090 aa  493  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  32.44 
 
 		 1082 aa  485  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  31.58 
 
 		 1097 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  29.74 
 
 		 1076 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  29.62 
 
 		 1084 aa  391  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  30.13 
 
 		 1125 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  36.83 
 
 		 1193 aa  378  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  26.86 
 
 		 1079 aa  357  5e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  29.42 
 
 		 1167 aa  341  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  29.97 
 
 		 1059 aa  305  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  25.2 
 
 		 1075 aa  295  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  27.58 
 
 		 1104 aa  295  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  28.05 
 
 		 1117 aa  286  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  26 
 
 		 1094 aa  270  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  27.07 
 
 		 1089 aa  266  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  25.63 
 
 		 1094 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  25.63 
 
 		 1094 aa  262  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  27.1 
 
 		 1084 aa  262  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  25.63 
 
 		 1094 aa  261  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  28.45 
 
 		 1107 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  25.72 
 
 		 1094 aa  258  6e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  25.82 
 
 		 1097 aa  258  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  25 
 
 		 1092 aa  255  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  25.6 
 
 		 1093 aa  255  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  25.59 
 
 		 1094 aa  252  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  25.47 
 
 		 1093 aa  251  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  25.49 
 
 		 1093 aa  251  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  25.82 
 
 		 1104 aa  247  8e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  28.23 
 
 		 1069 aa  247  9e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  24.78 
 
 		 1094 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  26.46 
 
 		 1016 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  24.33 
 
 		 1094 aa  228  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1051 aa  224  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  24.49 
 
 		 1008 aa  220  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  26 
 
 		 1183 aa  177  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  25.64 
 
 		 1181 aa  168  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  29.11 
 
 		 1147 aa  155  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  30.69 
 
 		 1186 aa  147  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  26.83 
 
 		 425 aa  132  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  26.52 
 
 		 1005 aa  125  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  25.5 
 
 		 1065 aa  124  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  25.18 
 
 		 1354 aa  120  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  26.62 
 
 		 428 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  26.5 
 
 		 1066 aa  106  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  26.65 
 
 		 1010 aa  102  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  27.12 
 
 		 427 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  26.56 
 
 		 1065 aa  102  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  26.38 
 
 		 1060 aa  101  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  25.16 
 
 		 1081 aa  99.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  26.1 
 
 		 1062 aa  99  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  26.1 
 
 		 1062 aa  98.6  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  27.21 
 
 		 432 aa  99  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  23.71 
 
 		 1069 aa  98.6  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  26.44 
 
 		 1062 aa  98.6  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  36.49 
 
 		 572 aa  96.3  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  25.64 
 
 		 1545 aa  95.9  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  25.35 
 
 		 1062 aa  95.9  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  25.64 
 
 		 1062 aa  94  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  25.4 
 
 		 1545 aa  94  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  25.74 
 
 		 1067 aa  94  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  27.08 
 
 		 1042 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  28.83 
 
 		 389 aa  94  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  24.81 
 
 		 465 aa  94.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  24.94 
 
 		 1062 aa  93.6  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  25.45 
 
 		 1062 aa  93.6  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  26.84 
 
 		 1031 aa  92  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  24.95 
 
 		 1078 aa  91.7  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  26.13 
 
 		 483 aa  91.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  27.14 
 
 		 457 aa  90.9  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  23.62 
 
 		 1049 aa  90.9  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  26.99 
 
 		 1040 aa  90.9  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  36.23 
 
 		 567 aa  90.1  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  24.72 
 
 		 1062 aa  90.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  25.88 
 
 		 482 aa  88.6  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  24.58 
 
 		 1138 aa  87.4  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1042 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  25.4 
 
 		 1484 aa  85.5  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2615  peptidase S41  26.43 
 
 		 427 aa  84.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  26.49 
 
 		 410 aa  84  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  27.61 
 
 		 1059 aa  84  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  22.85 
 
 		 1071 aa  82.4  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  25.68 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  23.93 
 
 		 1111 aa  80.5  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  27.74 
 
 		 969 aa  80.9  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  33.52 
 
 		 1062 aa  80.5  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  23.56 
 
 		 1084 aa  80.1  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  31.73 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  33.82 
 
 		 454 aa  79  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  31.25 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  32.24 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  34.03 
 
 		 432 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  29.17 
 
 		 435 aa  77.4  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  33.55 
 
 		 434 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  34.21 
 
 		 434 aa  76.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4927  peptidase S41  28.22 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.966695 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  26.84 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  24.88 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  27.12 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  33.55 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>