87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6037 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6037  glycoside hydrolase family 37  100 
 
 		 745 aa  1526    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.930873  normal  0.82415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2737  glycoside hydrolase family 37  28.53 
 
 		 708 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.886373  normal  0.227148 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1011  glycoside hydrolase family protein  26.4 
 
 		 581 aa  120  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.956563  normal  0.837929 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4434  glycoside hydrolase family protein  27.32 
 
 		 718 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000698524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2027  glycoside hydrolase family 37  29.86 
 
 		 732 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.203835 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3625  cell wall surface anchor family protein  28.72 
 
 		 717 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.500986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4151  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 		 721 aa  100  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0360  cell wall surface anchor family protein  25.41 
 
 		 852 aa  97.4  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3745  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 738 aa  96.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00662603  decreased coverage  0.0000773633 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06895  putative glycosyl hydrolase  32.22 
 
 		 896 aa  89.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0838  hypothetical protein  26.3 
 
 		 681 aa  87.8  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1774  glycoside hydrolase family 37  24.66 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4394  putative glycosyl hydrolase  23.83 
 
 		 783 aa  78.2  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3547  putative glycosyl hydrolase  24.28 
 
 		 783 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.733119  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02899  hypothetical protein  23.57 
 
 		 783 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02949  predicted glycosyl hydrolase  23.57 
 
 		 783 aa  77.4  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0620  putative glycosyl hydrolase  23.57 
 
 		 783 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0621  glycosyl hydrolase  23.61 
 
 		 783 aa  77  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3262  putative glycosyl hydrolase  23.39 
 
 		 783 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1970  putative glycosyl hydrolase  30.21 
 
 		 790 aa  75.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.434752  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000897  putative isomerase  28.87 
 
 		 896 aa  75.1  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0668  hypothetical protein  23.31 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1260  glycoside hydrolase family 37  30 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3374  putative glycosyl hydrolase  28.65 
 
 		 783 aa  74.3  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7692  Glycogen debranching protein-like protein  25.09 
 
 		 543 aa  73.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.440373 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0996  hypothetical protein  22.65 
 
 		 477 aa  70.5  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1396  Alpha,alpha-trehalase  28.35 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1430  Alpha,alpha-trehalase  28.35 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0503  glycoside hydrolase family 37  29.6 
 
 		 452 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01637  hypothetical protein  22.81 
 
 		 433 aa  63.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000231497  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1426  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 		 495 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1236  hypothetical protein  26.25 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0457319  hitchhiker  0.00331425 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.5 
 
 		 723 aa  59.3  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3506  hypothetical protein  26.75 
 
 		 445 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1844  hypothetical protein  21.41 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1286  hypothetical protein  23.25 
 
 		 419 aa  56.2  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0855  hypothetical protein  25.14 
 
 		 446 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  0.020116 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0119  Alpha,alpha-trehalase  24.14 
 
 		 529 aa  54.7  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1779  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.87 
 
 		 720 aa  54.3  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.120305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5323  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.2 
 
 		 764 aa  54.3  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0383  trehalase  19.92 
 
 		 474 aa  53.9  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34840  hypothetical protein  26.32 
 
 		 468 aa  53.9  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.204167  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4480  hypothetical protein  24.92 
 
 		 444 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0558365  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2856  amylo-alpha-16-glucosidase  24.88 
 
 		 737 aa  53.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.816237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2376  hypothetical protein  26 
 
 		 441 aa  53.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.353866  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1131  glycoside hydrolase family 37  24.29 
 
 		 914 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.579131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5556  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.8 
 
 		 765 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3185  hypothetical protein  31.41 
 
 		 440 aa  52  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000929672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2355  hypothetical protein  25.18 
 
 		 432 aa  51.6  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1841  hypothetical protein  23.68 
 
 		 509 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0139  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.96 
 
 		 733 aa  50.1  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3150  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.96 
 
 		 781 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500039 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5524  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.55 
 
 		 757 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735015 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5389  hypothetical protein  23.02 
 
 		 422 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0922  Alpha,alpha-trehalase  25.47 
 
 		 544 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  hitchhiker  0.00590138 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1462  hypothetical protein  29.1 
 
 		 408 aa  49.3  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5206  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.4 
 
 		 759 aa  49.3  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2002  hypothetical protein  31.77 
 
 		 456 aa  48.5  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000576814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3598  hypothetical protein  26.52 
 
 		 575 aa  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0199  hypothetical protein  21.03 
 
 		 723 aa  48.5  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3939  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.36 
 
 		 724 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2125  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.89 
 
 		 732 aa  47.8  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.964235 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  23.55 
 
 		 810 aa  47.8  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1750  hypothetical protein  25.27 
 
 		 459 aa  47.8  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.5 
 
 		 725 aa  47.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5404  hypothetical protein  23.79 
 
 		 896 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.379787  normal  0.773862 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06606  mannosyl-oligosaccharide glucosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04210)  24.3 
 
 		 749 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.10149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1229  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.31 
 
 		 729 aa  47.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.526565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5852  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.21 
 
 		 736 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8127  glycogen debranching protein  25.68 
 
 		 706 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4082  hypothetical protein  25 
 
 		 522 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0432  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.83 
 
 		 708 aa  46.6  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0716  hypothetical protein  21.59 
 
 		 566 aa  46.6  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.55 
 
 		 751 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4174  hypothetical protein  24.18 
 
 		 729 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2046  Alpha,alpha-trehalase  26.7 
 
 		 733 aa  46.6  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0706  Amylo-alpha-16-glucosidase  25.7 
 
 		 726 aa  46.2  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1135  hypothetical protein  22.13 
 
 		 757 aa  45.8  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.625879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1143  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.37 
 
 		 732 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0995661 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6050  hypothetical protein  23.88 
 
 		 446 aa  45.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117298  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3691  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.05 
 
 		 734 aa  45.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0421  hypothetical protein  22.14 
 
 		 727 aa  44.3  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4021  Amylo-alpha-16-glucosidase  22.48 
 
 		 734 aa  44.3  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5386  hypothetical protein  23.08 
 
 		 450 aa  44.3  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474069  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1574  glucosidase  25 
 
 		 890 aa  44.3  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.786209  normal  0.991499 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5762  hypothetical protein  22.78 
 
 		 446 aa  43.9  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5475  hypothetical protein  22.78 
 
 		 446 aa  43.9  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal  0.162072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>