More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5725 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1291  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.31 
 
 		 1085 aa  703    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.21 
 
 		 1111 aa  688    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.219097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0501  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.16 
 
 		 1098 aa  672    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159333 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 1072 aa  2156    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3540  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.94 
 
 		 1059 aa  659    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.468941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4388  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.31 
 
 		 1109 aa  712    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.20511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1599  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.66 
 
 		 1091 aa  694    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.11 
 
 		 1111 aa  687    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1485  transcription-repair coupling factor  36.14 
 
 		 1172 aa  631  1e-179  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2619  transcription-repair coupling factor  37.94 
 
 		 1155 aa  624  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1754  transcription-repair coupling factor  37.48 
 
 		 1144 aa  622  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.430393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1647  transcription-repair coupling factor  37.38 
 
 		 1198 aa  620  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0790633 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0109  transcription-repair coupling factor  35.17 
 
 		 1156 aa  617  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.174112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4532  transcription-repair coupling factor  36.78 
 
 		 1196 aa  618  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.850755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1726  transcription-repair coupling factor  37.88 
 
 		 1177 aa  616  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4163  transcription-repair coupling factor  36.78 
 
 		 1196 aa  618  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4676  transcription-repair coupling factor  36.51 
 
 		 1200 aa  619  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4157  transcription repair coupling factor  36.13 
 
 		 1171 aa  614  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6308  transcription-repair coupling factor  36.1 
 
 		 1203 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0152711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3081  transcription-repair coupling factor  36.52 
 
 		 1171 aa  613  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195799  normal  0.080304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7185  transcription-repair coupling factor  36.78 
 
 		 1190 aa  612  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.202363  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0894  transcription-repair coupling factor  36.1 
 
 		 1173 aa  608  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180496  normal  0.440454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2850  transcription-repair coupling factor  35.61 
 
 		 1171 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.334437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1513  transcription-repair coupling factor  34.82 
 
 		 1174 aa  599  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.696907  normal  0.0197286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2938  transcription-repair coupling factor  35 
 
 		 1172 aa  602  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0798  transcription-repair coupling factor  34.55 
 
 		 1163 aa  602  1e-170  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.151739  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3640  transcription-repair coupling factor  35.4 
 
 		 1170 aa  598  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4262  transcription-repair coupling factor  37.07 
 
 		 1168 aa  596  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336252  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1982  transcription-repair coupling factor  35.78 
 
 		 1164 aa  599  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2322  transcription-repair coupling factor  36.06 
 
 		 1153 aa  596  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.831848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2610  transcription-repair coupling factor  35 
 
 		 1172 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2622  transcription-repair coupling factor  35.19 
 
 		 1172 aa  598  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.153021  hitchhiker  0.000463296 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2053  transcription-repair coupling factor  34.79 
 
 		 1173 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0242332  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1518  transcription-repair coupling factor  36.03 
 
 		 1195 aa  598  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1349  transcription-repair coupling factor  34.95 
 
 		 1149 aa  589  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0579  transcription-repair coupling factor  35.84 
 
 		 1122 aa  586  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1561  transcription repair coupling factor  35.89 
 
 		 1160 aa  588  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224407  normal  0.305942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1702  transcription-repair coupling factor  36.56 
 
 		 1167 aa  588  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3811  transcription-repair coupling factor  36.76 
 
 		 1154 aa  589  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0544  transcription-repair coupling factor  35.75 
 
 		 1132 aa  582  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1653  transcription-repair coupling factor  36.46 
 
 		 1194 aa  582  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2850  transcription-repair coupling factor (helicase)  36.14 
 
 		 1165 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.74664  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2366  transcription-repair coupling factor  33.8 
 
 		 1175 aa  574  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1500  transcription-repair coupling factor  35.56 
 
 		 1163 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0625318 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1443  transcription-repair coupling factor  36.11 
 
 		 1165 aa  572  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0802912 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1399  transcription-repair coupling factor  35.08 
 
 		 1171 aa  572  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779162  normal  0.977146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1914  transcription-repair coupling factor  33.57 
 
 		 1166 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.621253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2211  transcription-repair coupling factor  36.16 
 
 		 1176 aa  567  1e-160  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1730  transcription-repair coupling factor  34 
 
 		 1167 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0919435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0250  transcription-repair coupling factor  29.77 
 
 		 1134 aa  556  1e-156  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0765  transcription-repair coupling factor  29.09 
 
 		 1128 aa  548  1e-154  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.267338  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1642  transcription-repair coupling factor protein  33.12 
 
 		 1157 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.250538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1575  transcription-repair coupling factor  32.47 
 
 		 1143 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221185  normal  0.0233451 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1904  transcription-repair coupling factor  32.38 
 
 		 1143 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.288854 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3547  transcription-repair coupling factor  32.66 
 
 		 1158 aa  528  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0162042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0214  transcription-repair coupling factor  33.02 
 
 		 1157 aa  527  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0683043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0197  transcription-repair coupling factor  33.49 
 
 		 1157 aa  529  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5656599999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0499  transcription-repair coupling factor  32.26 
 
 		 1177 aa  527  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.245405  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1246  transcription-repair coupling factor  33.2 
 
 		 1157 aa  524  1e-147  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.545868  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1299  transcription-repair coupling factor  33.01 
 
 		 1157 aa  520  1e-146  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1082  putative transcription repair coupling factor  34.87 
 
 		 1159 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0091  transcription-repair coupling factor  33.3 
 
 		 1161 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1665  transcription-repair coupling factor  31.73 
 
 		 1149 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.808978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3866  transcription-repair coupling factor  31.89 
 
 		 1149 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1748  transcription-repair coupling factor  32.13 
 
 		 1134 aa  514  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921754  normal  0.10168 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1594  transcription-repair coupling factor  36.07 
 
 		 1131 aa  516  1e-144  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1651  transcription-repair coupling factor  31.55 
 
 		 1198 aa  512  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0949353  normal  0.53283 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0997  transcription-repair coupling factor  32.33 
 
 		 1164 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2101  transcription-repair coupling factor  31.75 
 
 		 1150 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325386  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1016  transcription-repair coupling factor  31.53 
 
 		 1153 aa  504  1e-141  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0983  transcription-repair coupling factor  31.63 
 
 		 1153 aa  506  1e-141  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14570  transcription-repair coupling factor  33.24 
 
 		 1149 aa  506  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1689  transcription-repair coupling factor  31.81 
 
 		 1141 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281852 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1933  transcription-repair coupling factor  32.43 
 
 		 1173 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2157  transcription-repair coupling factor  32.64 
 
 		 1148 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0929  transcription-repair coupling factor  31.58 
 
 		 1180 aa  499  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.574552  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1896  transcription-repair coupling factor  31.47 
 
 		 1150 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.482284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1360  transcription-repair coupling factor  32.25 
 
 		 1150 aa  502  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1168  transcription-repair coupling factor  31.33 
 
 		 1159 aa  501  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.507558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0081  transcription-repair coupling factor  31.73 
 
 		 1183 aa  501  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000883466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1955  transcription-repair coupling factor  32.09 
 
 		 1150 aa  501  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0130326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25230  transcription-repair coupling factor  32.64 
 
 		 1148 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1330  transcription-repair coupling factor  32.29 
 
 		 1155 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.643209  normal  0.63963 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0912  transcription-repair coupling factor  31.94 
 
 		 1181 aa  499  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2148  transcription-repair coupling factor  31.63 
 
 		 1149 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0369  transcription-repair coupling factor  32.81 
 
 		 1149 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2313  transcription-repair coupling factor  31.85 
 
 		 1160 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.141111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1567  transcription-repair coupling factor  32.4 
 
 		 1150 aa  498  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1705  transcription-repair coupling factor  31.31 
 
 		 1174 aa  498  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1327  transcription-repair coupling factor  32.04 
 
 		 1156 aa  498  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.241535  hitchhiker  0.000253034 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0539  transcription-repair coupling factor  32.81 
 
 		 1116 aa  496  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0291296  hitchhiker  0.00000000346725 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1201  transcription-repair coupling factor  33.74 
 
 		 1154 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.656597  normal  0.0999319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1874  transcription-repair coupling factor  31.7 
 
 		 1160 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157118  normal  0.0187303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2478  transcription-repair coupling factor  31.66 
 
 		 1150 aa  496  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.349906  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1647  transcription-repair coupling factor  31.75 
 
 		 1150 aa  495  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3594  transcription-repair coupling factor  31.57 
 
 		 1149 aa  496  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0140  transcription-repair coupling factor  31.71 
 
 		 1159 aa  496  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00133746  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1706  transcription-repair coupling factor  30.71 
 
 		 1148 aa  492  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.43136  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1796  transcription-repair coupling protein Mfd  30.42 
 
 		 1153 aa  491  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.46752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2550  transcription-repair coupling factor  31.46 
 
 		 1161 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.277957  normal  0.0823791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>