131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5475 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5475  AAA ATPase  100 
 
 
391 aa  784    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.945567  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2398  hypothetical protein  72.61 
 
 
390 aa  554  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.90734  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3833  hypothetical protein  72.35 
 
 
390 aa  555  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1336  hypothetical protein  65.26 
 
 
394 aa  477  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0386172 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3747  hypothetical protein  62.6 
 
 
387 aa  464  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0407  hypothetical protein  59.69 
 
 
389 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11265  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1072  AAA ATPase  56.04 
 
 
390 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.352616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1352  AAA ATPase  57.51 
 
 
394 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.054577 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0926  hypothetical protein  60.36 
 
 
402 aa  433  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3104  AAA ATPase  60.27 
 
 
389 aa  425  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.459276  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0011  ATPase  55.81 
 
 
392 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3737  AAA ATPase  47.33 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0181  AAA family ATPase  48.63 
 
 
383 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0254129 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6960  transcriptional regulator, ArsR family  47.03 
 
 
392 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259678  normal  0.107157 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2477  AAA family ATPase  46.4 
 
 
383 aa  310  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0644  hypothetical protein  46.38 
 
 
388 aa  298  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0599  AAA family ATPase  46.26 
 
 
380 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12040  hypothetical protein  44.56 
 
 
441 aa  290  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1959  hypothetical protein  43.01 
 
 
388 aa  278  9e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0740  hypothetical protein  42.56 
 
 
384 aa  277  2e-73  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1926  hypothetical protein  42.12 
 
 
350 aa  238  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5229  AAA ATPase  33.66 
 
 
418 aa  202  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303429  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0829  ATPase protein  33.94 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1495  AAA family ATPase  31.93 
 
 
392 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000702587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3137  putative GTP-binding protein  32.27 
 
 
418 aa  166  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0414  AAA family ATPase  30.56 
 
 
392 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.117991  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1538  AAA family ATPase  34.33 
 
 
388 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.129495  hitchhiker  0.000845255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3504  AAA family ATPase  30.28 
 
 
426 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603891  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1213  AAA family ATPase  30.94 
 
 
415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0064  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  32.37 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2346  AAA family ATPase  33.42 
 
 
385 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3330  AAA+ superfamily protein  32.53 
 
 
386 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4815  hypothetical protein  28.64 
 
 
406 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604188  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2317  AAA family ATPase  30.27 
 
 
418 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0779  AAA family ATPase  33.51 
 
 
402 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0799  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  31.53 
 
 
394 aa  149  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2779  hypothetical protein  30.05 
 
 
406 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3875  AAA family ATPase  29.02 
 
 
416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1921  AAA family ATPase  32.75 
 
 
389 aa  146  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0922  ATPase  54.41 
 
 
139 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1795  hypothetical protein  29.71 
 
 
380 aa  144  3e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0540  hypothetical protein  27.74 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1764  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  33.84 
 
 
386 aa  139  6e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10609  hypothetical protein  28.81 
 
 
411 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3726  AAA family ATPase  28.31 
 
 
385 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0737  hypothetical protein  30.56 
 
 
409 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.608539  normal  0.643464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2955  AAA family ATPase  29.95 
 
 
416 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3861  AAA family ATPase  28.88 
 
 
415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0363925 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3974  AAA family ATPase  30.35 
 
 
412 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0703  hypothetical protein  29.38 
 
 
436 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232427  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4738  putative GTP-binding protein  29.3 
 
 
409 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5079  hypothetical protein  27.91 
 
 
417 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5329  hypothetical protein  27.68 
 
 
407 aa  126  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1879  hypothetical protein  29.14 
 
 
339 aa  126  7e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13201  hypothetical protein  29.4 
 
 
454 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.407807 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0818  hypothetical ATPase  29.22 
 
 
421 aa  126  8.000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0127  ATPase (AAA+ superfamily)  26.16 
 
 
412 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.803222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0783  AAA family ATPase  26.41 
 
 
412 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4096  hypothetical protein  28.3 
 
 
408 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0124  putative GTP-binding protein  27.97 
 
 
408 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3175  AAA family ATPase  28.23 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0676  ATPase, AAA+ superfamily protein  26.4 
 
 
425 aa  113  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1910  hypothetical protein  24.94 
 
 
426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0218  hypothetical protein  26.65 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0220  hypothetical protein  26.58 
 
 
474 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6254  hypothetical protein  28.93 
 
 
430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2189  ATPase  28.54 
 
 
413 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1211  hypothetical protein  27.17 
 
 
402 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000035841 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1029  AAA ATPase  25.33 
 
 
390 aa  103  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000298007  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1984  hypothetical protein  27.3 
 
 
377 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0133  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  36.76 
 
 
259 aa  99.8  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1026  hypothetical ATPase  28.91 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4042  hypothetical protein  26.63 
 
 
376 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163305 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4315  AAA family ATPase  27.4 
 
 
407 aa  96.3  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.993823 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1351  putative AAA+ superfamily ATPase  36.78 
 
 
229 aa  94.7  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0172  hypothetical ATPase  25.97 
 
 
382 aa  94  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1813  AAA+ superfamily protein  25.89 
 
 
382 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.309123  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4180  hypothetical protein  30.11 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0306  hypothetical ATPase  26.23 
 
 
419 aa  90.9  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1885  hypothetical protein  25.8 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5624  AAA ATPase  24.86 
 
 
378 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2465  hypothetical protein  25.14 
 
 
379 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628763  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0107  hypothetical ATPase  26.11 
 
 
427 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2079  hypothetical protein  26.11 
 
 
427 aa  88.2  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0738237  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1630  hypothetical protein  25.75 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.12881  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0497  hypothetical ATPase  26.16 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0413  hypothetical protein  41.53 
 
 
119 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3078  hypothetical protein  25.27 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318961  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0506  hypothetical protein  27.03 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4210  AAA ATPase  23.8 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1841  ATPase  26.53 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1709  hypothetical protein  26.21 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5654  ATPase  25.07 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0263  hypothetical protein  25.92 
 
 
413 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1590  putative AAA+ superfamily ATPase  27.68 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1860  hypothetical protein  24.7 
 
 
394 aa  66.6  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1812  hypothetical protein  24.74 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000822502  normal  0.708548 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13323  hypothetical protein  30.41 
 
 
269 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1286  putative AAA+ superfamily ATPase  25.62 
 
 
427 aa  63.5  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0509  hypothetical protein  23.76 
 
 
396 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>