More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0540 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0540  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
573 aa  1176    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0497  putative PAS/PAC sensor protein  91.62 
 
 
574 aa  1089    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.710767  normal  0.476938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0429  putative PAS/PAC sensor protein  40.53 
 
 
579 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.422258  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0893  two component sensor kinase  39.01 
 
 
554 aa  352  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.76 
 
 
1126 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.45 
 
 
1131 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
1202 aa  110  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  42.86 
 
 
847 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  29.25 
 
 
977 aa  95.9  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.6 
 
 
636 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  38.85 
 
 
968 aa  95.1  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.8 
 
 
945 aa  94.7  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 
1245 aa  94.7  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 
1090 aa  94.7  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
1055 aa  94.4  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
784 aa  93.6  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  36.67 
 
 
676 aa  91.7  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 
865 aa  92  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
1274 aa  91.3  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  35.17 
 
 
1560 aa  90.5  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
936 aa  90.5  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 
649 aa  90.5  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
902 aa  90.5  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  27.53 
 
 
1177 aa  90.1  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  36.51 
 
 
1297 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 
1316 aa  90.1  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
873 aa  89.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 
1275 aa  89.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
717 aa  89.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
633 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
1352 aa  89.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
1287 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  37.5 
 
 
651 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 
643 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  32.7 
 
 
786 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 
920 aa  89  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
762 aa  88.6  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.28 
 
 
764 aa  88.6  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0191  histidine kinase  32.52 
 
 
531 aa  88.2  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73542  histidine kinase osmosensor  35.82 
 
 
1118 aa  88.2  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
1029 aa  88.2  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  31.58 
 
 
651 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
643 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.17 
 
 
858 aa  87  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1072 aa  86.7  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
770 aa  87  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.38 
 
 
763 aa  87  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3693  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 
602 aa  86.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
1005 aa  86.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.76 
 
 
745 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02306  hypothetical protein  40.54 
 
 
576 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 
631 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  37.7 
 
 
650 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0053  membrane associated response regulator,histidine kinase  41.23 
 
 
818 aa  86.3  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.255701  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
1002 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 
1240 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
1002 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 
1611 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2107  hypothetical protein  36.07 
 
 
676 aa  85.9  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0072  putative sensor/response hybrid  36.89 
 
 
527 aa  85.9  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0111636 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  39.37 
 
 
738 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.97 
 
 
582 aa  85.9  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3749  histidine kinase  35.48 
 
 
935 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  38.02 
 
 
659 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.89 
 
 
1397 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 
1309 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 
614 aa  85.9  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 
827 aa  85.9  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
705 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
833 aa  86.3  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  37.19 
 
 
982 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  37.72 
 
 
850 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 
778 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 
877 aa  84.7  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  35.88 
 
 
1014 aa  84.7  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
819 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0907  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
919 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.651038 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000382  putative sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.68 
 
 
873 aa  84.3  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1772  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 
1169 aa  84.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.914739  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  36.89 
 
 
1023 aa  84.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 
1433 aa  84.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4809  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
134 aa  84.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0305  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 
967 aa  84.3  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  unclonable  0.00000133293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
643 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3751  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 
1070 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  34.43 
 
 
691 aa  84.7  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  28.44 
 
 
1351 aa  84.3  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  36.13 
 
 
647 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1369 aa  84  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0139  histidine kinase  36.07 
 
 
1064 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 
921 aa  84  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  37.19 
 
 
1026 aa  84  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
757 aa  84  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 
758 aa  84  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.46 
 
 
1442 aa  84  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  36.29 
 
 
795 aa  84  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 
909 aa  83.6  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
1069 aa  84  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.91 
 
 
862 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 
743 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>