More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0497 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0497  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
574 aa  1177    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.710767  normal  0.476938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0540  putative PAS/PAC sensor protein  91.62 
 
 
573 aa  1089    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0429  putative PAS/PAC sensor protein  39.68 
 
 
579 aa  379  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.422258  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0893  two component sensor kinase  39.42 
 
 
554 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.88 
 
 
1126 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.12 
 
 
1131 aa  122  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
1202 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  45.76 
 
 
847 aa  101  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 
784 aa  99  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.18 
 
 
902 aa  97.4  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.92 
 
 
945 aa  97.4  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1245 aa  95.9  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 
1352 aa  93.2  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.09 
 
 
865 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  37.21 
 
 
676 aa  93.2  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
1055 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 
920 aa  92.4  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 
1275 aa  92.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.46 
 
 
1316 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  38.33 
 
 
968 aa  92.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 
633 aa  92  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0072  putative sensor/response hybrid  37.32 
 
 
527 aa  90.9  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0111636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  29.29 
 
 
977 aa  90.9  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 
833 aa  90.9  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.16 
 
 
636 aa  90.5  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
770 aa  90.5  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 
717 aa  90.5  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
873 aa  90.5  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  39.02 
 
 
1560 aa  90.5  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.33 
 
 
643 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
785 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.5 
 
 
763 aa  89.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  33.81 
 
 
786 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
1005 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  35.03 
 
 
853 aa  89.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 
649 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 
1287 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 
1090 aa  88.6  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
827 aa  88.2  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.5 
 
 
643 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
977 aa  88.2  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  36.75 
 
 
1297 aa  87.8  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.1 
 
 
1072 aa  87.8  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0053  membrane associated response regulator,histidine kinase  41.23 
 
 
818 aa  87.8  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.255701  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0191  histidine kinase  38.98 
 
 
531 aa  87.8  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 
1313 aa  87.8  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4809  response regulator receiver protein  37.82 
 
 
134 aa  87.8  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 
1240 aa  87.4  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  38.52 
 
 
650 aa  87.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 
1029 aa  87.4  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
614 aa  87.4  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 
1274 aa  87  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.67 
 
 
659 aa  87  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.98 
 
 
1066 aa  86.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40 
 
 
582 aa  86.7  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.59 
 
 
858 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  40.83 
 
 
1346 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
936 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3040  histidine kinase  28.22 
 
 
1053 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0526469  normal  0.364658 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 
1110 aa  86.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2818  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.02 
 
 
720 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215558  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  38.33 
 
 
651 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  36.59 
 
 
1135 aa  85.9  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
835 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 
846 aa  85.5  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 
631 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  38.26 
 
 
647 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02306  hypothetical protein  41.44 
 
 
576 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.05 
 
 
1165 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
643 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
705 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  36.51 
 
 
794 aa  85.1  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 
745 aa  85.1  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  34.04 
 
 
641 aa  85.5  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
1003 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  40.52 
 
 
120 aa  85.1  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
1397 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
1118 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3366  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.32 
 
 
762 aa  85.1  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
1309 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.61 
 
 
1442 aa  85.5  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 
862 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01579  Response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like protein  37.4 
 
 
891 aa  84.7  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  31.22 
 
 
779 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  36.67 
 
 
606 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
801 aa  84.7  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1377  Cache sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 
731 aa  84.7  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.873394  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  40 
 
 
671 aa  84.7  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000382  putative sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.71 
 
 
873 aa  84.3  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 
1033 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
1977 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  37.72 
 
 
850 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  37.5 
 
 
651 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
631 aa  84.3  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
1407 aa  84  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
1363 aa  84.3  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 
896 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.11 
 
 
877 aa  84  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 
830 aa  84  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.07 
 
 
1078 aa  84  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>