More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4454 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4454  inner-membrane translocator  100 
 
 		 288 aa  548  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242993  normal  0.0168386 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0056  ABC transporter, permease protein  56.74 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2666  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  56.38 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2713  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.38 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3288  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.38 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1839  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.38 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0055  ABC transporter, permease protein  56.03 
 
 		 292 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0268  branched chain amino acid ABC transporter permease  54.47 
 
 		 264 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0048  branched chain amino acid ABC transporter permease  53.31 
 
 		 264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1174  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.34 
 
 		 289 aa  105  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3395  ABC transporter related  31.23 
 
 		 956 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3867  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 704 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.318133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.37 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3966  inner-membrane translocator  32.38 
 
 		 382 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5664  inner-membrane translocator  30.17 
 
 		 741 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.269421  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1604  inner-membrane translocator  26.77 
 
 		 288 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1579  inner-membrane translocator  26.77 
 
 		 288 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2538  inner-membrane translocator  34.94 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  28.95 
 
 		 294 aa  89.4  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 292 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7507  ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 		 290 aa  89  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2136  ABC transporter related protein  33.83 
 
 		 908 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.135271 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  27.89 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.37 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3489  inner-membrane translocator  30.86 
 
 		 743 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  31.1 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  28.88 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  29.2 
 
 		 289 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4898  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 342 aa  85.9  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4017  inner-membrane translocator  33.2 
 
 		 697 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0657  inner-membrane translocator  30.92 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3459  inner-membrane translocator  29.84 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.411869  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1051  inner-membrane translocator  29.84 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7078  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  25.41 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  28.4 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2495  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  26.47 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.799542  hitchhiker  0.00275887 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4242  inner-membrane translocator  27.71 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0855  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 772 aa  79  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.852549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.94 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  26.4 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0601  inner-membrane translocator  28.46 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  27.41 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0505  inner-membrane translocator  24.62 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0978839  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2177  integral membrane protein of the ABC-type Nat permease for neutral amino acids NatD  27.84 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.801545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  29.05 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  27.66 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  27.11 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  27.74 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  27.82 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  28.8 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  27.41 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1781  ABC transporter permease  30.11 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0603975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1544  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  27.6 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  28.22 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  28.22 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8833  inner-membrane translocator  31.37 
 
 		 637 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.756263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0350  inner-membrane translocator  28.63 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.018915  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1742  inner-membrane translocator  27.31 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0350501  normal  0.0888724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  26.52 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4564  ABC transporter related  29.6 
 
 		 989 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2201  inner-membrane translocator  25.94 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.796899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  28.06 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2545  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  26.75 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  0.322886 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  29.44 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4737  ABC transporter related  27.91 
 
 		 940 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  27.78 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  25.61 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2312  inner-membrane translocator  26.42 
 
 		 551 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.280528  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  28.94 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2987  ABC transporter inner-membrane translocator  25.09 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23000  branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  26.56 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.135077  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2619  urea ABC transporter, permease protein UrtB  24.81 
 
 		 545 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.098179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  24.8 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1111  inner-membrane translocator  28.74 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1201  inner-membrane translocator  28.1 
 
 		 527 aa  73.9  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2705  inner-membrane translocator  28.91 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  26.19 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  26.1 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1838  inner-membrane translocator  29.66 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  25.83 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2098  inner-membrane translocator  27.09 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0236105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  23.64 
 
 		 548 aa  72.8  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  24.06 
 
 		 558 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  28.06 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1420  inner-membrane translocator  26.6 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3674  putative urea/short-chain amide transport system permease protein  27.24 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  29.63 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  27.63 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  24.48 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1980  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component-like protein  28.79 
 
 		 898 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3557  inner-membrane translocator  28.11 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  28.05 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3000  inner-membrane translocator  24.81 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  22.55 
 
 		 542 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  29.63 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  26.91 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>