203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1629 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  908    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  36.43 
 
 		 433 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  35.01 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  34.78 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  33.03 
 
 		 432 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  33.49 
 
 		 447 aa  167  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  32.55 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  31.4 
 
 		 404 aa  161  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  30.27 
 
 		 437 aa  156  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  31.06 
 
 		 400 aa  156  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  31.32 
 
 		 448 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  32.94 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  27.29 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  31.18 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  32.15 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  29.84 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  30.62 
 
 		 420 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  32.15 
 
 		 420 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  31.86 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  29.33 
 
 		 413 aa  129  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  29.29 
 
 		 415 aa  123  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  31.29 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  30.03 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  28.21 
 
 		 422 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  30.77 
 
 		 408 aa  91.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  28.41 
 
 		 437 aa  87.4  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  25.98 
 
 		 425 aa  86.7  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  28.07 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  27.15 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  25.82 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  25.24 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  26.8 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  26.8 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  26.8 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  26.8 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  26.8 
 
 		 440 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  26.8 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  24.44 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  26.58 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  28.43 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  28.87 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  28.52 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  27.02 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  31.01 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  29.15 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  27.03 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  28.16 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  27.47 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  29.14 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  27.4 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  26.05 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  30.22 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  25.69 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  33.51 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  25.54 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  26.29 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  30.95 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  27.59 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  29.05 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  25.33 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  25.35 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  27.2 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  29.07 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  26.45 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  25.88 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  26.83 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  26.9 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  29.79 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  27.89 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  26.9 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  26.9 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  26.9 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  26.9 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  27.71 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  27.72 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  26.92 
 
 		 622 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  25.07 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  25.54 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  32.85 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  29.79 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  28.47 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  26.96 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  23.12 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  26.92 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  27.48 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  27.54 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  26.56 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  28.06 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  32.28 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  26.37 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  29.71 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  26.37 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  27.34 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  27.49 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  28.65 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  31.88 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  28.16 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  25.35 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  27.31 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  26.34 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>