220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0104 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  100 
 
 		 960 aa  1929    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  68.87 
 
 		 1217 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  30.14 
 
 		 1814 aa  270  8.999999999999999e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  31.26 
 
 		 940 aa  259  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  31.23 
 
 		 3598 aa  251  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  29.62 
 
 		 1480 aa  205  4e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  34.18 
 
 		 1789 aa  203  9.999999999999999e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  29.38 
 
 		 1499 aa  194  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  28.87 
 
 		 2107 aa  194  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  28.54 
 
 		 999 aa  184  8.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  29.83 
 
 		 1607 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  34.01 
 
 		 1112 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.12 
 
 		 4798 aa  130  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  38.52 
 
 		 2954 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  35.92 
 
 		 844 aa  110  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  36.41 
 
 		 541 aa  110  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 1925 aa  109  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  28.05 
 
 		 959 aa  105  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  34.95 
 
 		 679 aa  105  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  32.6 
 
 		 860 aa  102  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  35.89 
 
 		 1156 aa  97.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  38.41 
 
 		 585 aa  90.9  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  37.68 
 
 		 582 aa  90.1  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  39.77 
 
 		 1809 aa  89.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  37.98 
 
 		 928 aa  82.4  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  30.61 
 
 		 946 aa  82.8  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  30.8 
 
 		 855 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  37.98 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6493  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  37.16 
 
 		 1102 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  30.36 
 
 		 1306 aa  79.7  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  34.57 
 
 		 1805 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  38.85 
 
 		 3026 aa  79  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  33.16 
 
 		 4687 aa  79  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  33.14 
 
 		 618 aa  78.6  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  36.72 
 
 		 548 aa  77.4  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  30.89 
 
 		 2245 aa  75.9  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  34.81 
 
 		 1895 aa  72.8  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  33.56 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  44.04 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  36.43 
 
 		 3209 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  31.25 
 
 		 2775 aa  70.1  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  32.86 
 
 		 2667 aa  68.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  30.3 
 
 		 1383 aa  69.3  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0927  hypothetical protein  34.42 
 
 		 351 aa  68.9  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  30.75 
 
 		 15831 aa  68.2  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  32.48 
 
 		 4334 aa  68.2  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  28.91 
 
 		 998 aa  67.4  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.01 
 
 		 1279 aa  67.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  30.66 
 
 		 833 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  30.65 
 
 		 14829 aa  66.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.48 
 
 		 3427 aa  65.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  30.3 
 
 		 595 aa  64.3  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  36.36 
 
 		 677 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  34.48 
 
 		 1400 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  35.85 
 
 		 2885 aa  63.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  39.05 
 
 		 326 aa  63.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  28.92 
 
 		 2767 aa  62.4  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  29.74 
 
 		 1421 aa  62.4  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.01 
 
 		 980 aa  62.4  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  31.42 
 
 		 942 aa  62.4  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  36.36 
 
 		 532 aa  62  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  32.39 
 
 		 3954 aa  62  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  33.21 
 
 		 2105 aa  62  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  31.05 
 
 		 1534 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  28.52 
 
 		 2689 aa  61.6  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6671  hypothetical protein  29.49 
 
 		 755 aa  61.6  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538949  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  30.8 
 
 		 518 aa  61.6  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  27.86 
 
 		 1532 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  33.01 
 
 		 219 aa  60.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  33.12 
 
 		 965 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  29.13 
 
 		 589 aa  59.7  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  37.14 
 
 		 202 aa  59.3  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  31.71 
 
 		 1287 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  32.69 
 
 		 260 aa  59.7  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  37.14 
 
 		 202 aa  59.3  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  34.15 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.02 
 
 		 1795 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  31.86 
 
 		 1079 aa  58.9  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1525  rhizobiocin/RTX toxin  34.48 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.715875  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  31.53 
 
 		 686 aa  58.9  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.99 
 
 		 1236 aa  58.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  32.9 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  35.45 
 
 		 950 aa  58.5  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.06 
 
 		 1363 aa  58.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.86 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  34.33 
 
 		 3314 aa  57.8  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  33.08 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1526 aa  57.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1424 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  34.38 
 
 		 639 aa  57.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  33.91 
 
 		 982 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.46 
 
 		 1963 aa  57.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  36.67 
 
 		 1855 aa  57  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  32.33 
 
 		 396 aa  57  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  28.99 
 
 		 4800 aa  56.6  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  32.13 
 
 		 2145 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1433  hypothetical protein  35.14 
 
 		 320 aa  56.6  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0949231  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  40 
 
 		 5098 aa  56.6  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  28.16 
 
 		 2911 aa  55.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0371  hypothetical protein  32.61 
 
 		 345 aa  56.2  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>