151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3812 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3812  recombinase  100 
 
 		 523 aa  1064    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0075  recombinase  60.04 
 
 		 521 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.243508  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3501  recombinase  98.47 
 
 		 523 aa  1051    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0028  recombinase  59.92 
 
 		 537 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1192  putative recombinase  60.85 
 
 		 521 aa  629  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0189  putative recombinase  60.85 
 
 		 521 aa  629  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.113456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3109  Recombinase  60.56 
 
 		 497 aa  625  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.183661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0526  recombinase  59.41 
 
 		 524 aa  623  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2982  putative recombinase  57.76 
 
 		 521 aa  619  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4807  recombinase  59.49 
 
 		 519 aa  617  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3172  Recombinase  59.03 
 
 		 521 aa  608  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0034  recombinase, putative  55.8 
 
 		 518 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0192  recombinase, putative  55.8 
 
 		 518 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2746  recombinase  55.88 
 
 		 528 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0770  resolvase family site-specific recombinase  48.51 
 
 		 519 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0463  recombinase  81.52 
 
 		 328 aa  495  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  43.39 
 
 		 518 aa  475  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02510  Recombinase  43.39 
 
 		 518 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  43.39 
 
 		 518 aa  474  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2888  recombinase  41.63 
 
 		 518 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.36866  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1402  Recombinase  45.53 
 
 		 534 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0830  Recombinase  43.68 
 
 		 534 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1466  putative recombinase  46 
 
 		 568 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0347  hypothetical protein  67.2 
 
 		 339 aa  350  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.688314  normal  0.0146201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0186  recombinase  37.57 
 
 		 559 aa  249  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673106 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0607  resolvase domain-containing protein  49.49 
 
 		 157 aa  100  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.92 
 
 		 506 aa  94  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  27.57 
 
 		 554 aa  87  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  27.57 
 
 		 542 aa  87  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  30.5 
 
 		 541 aa  84.7  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.33 
 
 		 548 aa  83.2  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  24.52 
 
 		 537 aa  81.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  24.25 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  23.72 
 
 		 494 aa  80.1  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  25.21 
 
 		 547 aa  77  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  28.01 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  27.44 
 
 		 563 aa  76.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  25.41 
 
 		 517 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  26.79 
 
 		 523 aa  75.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  27.36 
 
 		 546 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  26.73 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  25.72 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  25.17 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  26.79 
 
 		 523 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  23.93 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  25.5 
 
 		 496 aa  71.6  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  29.35 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  28.74 
 
 		 578 aa  70.9  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.92 
 
 		 542 aa  70.5  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  28.15 
 
 		 665 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.92 
 
 		 542 aa  70.5  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.92 
 
 		 542 aa  70.5  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  25 
 
 		 539 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  27.01 
 
 		 522 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.42 
 
 		 485 aa  69.7  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  28.48 
 
 		 523 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0612  recombinase  27.21 
 
 		 656 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  27.81 
 
 		 597 aa  66.6  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.91 
 
 		 613 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3285  Recombinase  23.23 
 
 		 554 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.47 
 
 		 521 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  28.57 
 
 		 862 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  23.57 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  29.9 
 
 		 564 aa  64.7  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  25.64 
 
 		 561 aa  64.7  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  27.63 
 
 		 601 aa  64.7  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  28.43 
 
 		 549 aa  64.7  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  27.63 
 
 		 578 aa  64.3  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  27.35 
 
 		 565 aa  64.3  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  27.53 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  25.16 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  27.24 
 
 		 523 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  23.87 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  24.27 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1700  recombinase  25.54 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000219867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  23.97 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  26.15 
 
 		 551 aa  61.2  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.28 
 
 		 522 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  26.98 
 
 		 540 aa  60.5  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.44 
 
 		 547 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2325  recombinase  21.62 
 
 		 697 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.26 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  28.24 
 
 		 281 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  22.8 
 
 		 516 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  22.8 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  25.83 
 
 		 584 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  24.07 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  25.2 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  23.65 
 
 		 524 aa  58.2  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  23.19 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  23.98 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08120  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  24.73 
 
 		 274 aa  57  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  normal  0.202082 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  23.99 
 
 		 586 aa  57  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  23.35 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2438  Resolvase domain protein  22.05 
 
 		 526 aa  56.2  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  26.43 
 
 		 515 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  23.18 
 
 		 579 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  22.48 
 
 		 552 aa  54.3  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  24.15 
 
 		 738 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0430  Resolvase domain protein  22.09 
 
 		 535 aa  54.3  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>