202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4049 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 169 aa  342  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  87.04 
 
 		 162 aa  285  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  80.25 
 
 		 162 aa  263  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  71.08 
 
 		 193 aa  235  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  71.88 
 
 		 168 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  67.92 
 
 		 173 aa  220  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  70.44 
 
 		 162 aa  219  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  53.42 
 
 		 165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  53.02 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  54.42 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  51.47 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  52.21 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  52.21 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 		 156 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  48.2 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  48.23 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  45.7 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  51.56 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  44.87 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  45.32 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 		 146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  45.52 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  35.34 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  42.19 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 165 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  40.21 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 542 aa  48.5  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0906744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 456 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  31.67 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 		 230 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  31.67 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 138 aa  47.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  48.28 
 
 		 306 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 135 aa  46.6  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3352  phosphohydrolase  26.5 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  37.23 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  30.36 
 
 		 134 aa  44.7  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 282 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 141 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  36.78 
 
 		 129 aa  44.7  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 		 140 aa  44.3  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  49.02 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  41.67 
 
 		 317 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  49.06 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  43.86 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>