168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0073 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_2115  ABC efflux transporter, fused inner membrane subunits  58.72 
 
 		 882 aa  973    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.675122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2436  hypothetical protein  58.08 
 
 		 870 aa  968    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0073  hypothetical protein  100 
 
 		 884 aa  1785    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2108  protein of unknown function DUF214  28.26 
 
 		 832 aa  323  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2414  hypothetical protein  29 
 
 		 832 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.459172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2110  protein of unknown function DUF214  28.59 
 
 		 833 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  27.75 
 
 		 871 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  29.44 
 
 		 871 aa  211  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  29.44 
 
 		 871 aa  211  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  27.81 
 
 		 870 aa  202  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  27.57 
 
 		 871 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  29.58 
 
 		 871 aa  194  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  27.44 
 
 		 863 aa  194  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  25.27 
 
 		 844 aa  191  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  24.73 
 
 		 804 aa  191  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  29.53 
 
 		 834 aa  191  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  23.14 
 
 		 841 aa  187  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0829  hypothetical protein  25 
 
 		 871 aa  186  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270904  normal  0.305315 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  24.66 
 
 		 815 aa  183  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  26.04 
 
 		 831 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  27.54 
 
 		 838 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  27.83 
 
 		 860 aa  180  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  27.67 
 
 		 838 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  26.1 
 
 		 835 aa  179  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  24.94 
 
 		 830 aa  179  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  27.22 
 
 		 861 aa  179  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  25.06 
 
 		 804 aa  178  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  26.1 
 
 		 844 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  25.42 
 
 		 869 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  24.85 
 
 		 804 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  25.06 
 
 		 809 aa  176  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0562  efflux ABC transporter permease protein  25 
 
 		 804 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  26.52 
 
 		 826 aa  175  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  26.23 
 
 		 810 aa  175  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0557  efflux ABC transporter permease  24.88 
 
 		 804 aa  175  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  24.94 
 
 		 804 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  24.94 
 
 		 804 aa  174  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6498  protein of unknown function DUF214  24.41 
 
 		 835 aa  173  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.850994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  25.5 
 
 		 842 aa  173  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  24.25 
 
 		 804 aa  173  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  25.06 
 
 		 809 aa  173  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  22.93 
 
 		 842 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  24.25 
 
 		 804 aa  172  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  25.14 
 
 		 809 aa  172  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  24.25 
 
 		 804 aa  171  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  23.05 
 
 		 829 aa  171  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  24.25 
 
 		 804 aa  171  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1597  protein of unknown function DUF214  22.42 
 
 		 861 aa  171  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  24.7 
 
 		 804 aa  170  9e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  24.7 
 
 		 804 aa  170  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  24.61 
 
 		 805 aa  170  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  22.46 
 
 		 836 aa  169  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  25.53 
 
 		 832 aa  169  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  24.7 
 
 		 804 aa  169  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  25.57 
 
 		 843 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  26.05 
 
 		 880 aa  167  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  22.27 
 
 		 809 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  21.85 
 
 		 809 aa  164  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  26.05 
 
 		 1108 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  25.92 
 
 		 883 aa  164  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  27.12 
 
 		 869 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2957  hypothetical protein  24.68 
 
 		 810 aa  160  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133946  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  25.43 
 
 		 864 aa  160  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  27.19 
 
 		 856 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  25.69 
 
 		 840 aa  160  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5469  hypothetical protein  22.96 
 
 		 862 aa  159  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18562  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  23.8 
 
 		 856 aa  158  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  25.89 
 
 		 835 aa  157  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1394  hypothetical protein  21.79 
 
 		 858 aa  157  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.472262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1671  protein of unknown function DUF214  22.88 
 
 		 844 aa  154  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0107522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  23.05 
 
 		 856 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  27.31 
 
 		 828 aa  154  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2783  hypothetical protein  24.77 
 
 		 837 aa  153  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.667381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  24.21 
 
 		 810 aa  150  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  24.7 
 
 		 819 aa  150  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0542  protein of unknown function DUF214  24.78 
 
 		 843 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1680  protein of unknown function DUF214  23.71 
 
 		 842 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.432743  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1545  hypothetical protein  25 
 
 		 833 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1480  hypothetical protein  25 
 
 		 833 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  24.73 
 
 		 840 aa  149  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2390  hypothetical protein  24.01 
 
 		 831 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.652609  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1539  hypothetical protein  24.9 
 
 		 833 aa  148  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274903 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  24.62 
 
 		 828 aa  147  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2686  hypothetical protein  23.71 
 
 		 842 aa  147  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0411  hypothetical protein  23.11 
 
 		 852 aa  147  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.773219  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2707  hypothetical protein  24.01 
 
 		 836 aa  147  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0551  hypothetical protein  22.4 
 
 		 823 aa  146  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.454209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0286  hypothetical protein  26.02 
 
 		 860 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463422  normal  0.0456114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4181  hypothetical protein  24.03 
 
 		 848 aa  145  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.821525  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  25.16 
 
 		 851 aa  144  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3352  hypothetical protein  23.48 
 
 		 869 aa  144  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  25.2 
 
 		 838 aa  143  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2679  putative ABC transporter permease  23.04 
 
 		 842 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0339343  normal  0.926867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1662  hypothetical protein  23.01 
 
 		 817 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000552359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2926  ABC transporter, permease, putative  24.84 
 
 		 835 aa  139  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1016  hypothetical protein  22.67 
 
 		 858 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331004  normal  0.145704 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0099  hypothetical protein  21.42 
 
 		 849 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0550  hypothetical protein  24.11 
 
 		 858 aa  137  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2401  hypothetical protein  24.83 
 
 		 816 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.678425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000166  predicted ABC-type transport system permease component  23.31 
 
 		 818 aa  135  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>