185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0551 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0551  hypothetical protein  100 
 
 		 823 aa  1634    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.454209  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  30.21 
 
 		 869 aa  328  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  29.84 
 
 		 844 aa  324  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  31.69 
 
 		 840 aa  317  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  29.11 
 
 		 870 aa  317  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0998  hypothetical protein  30.98 
 
 		 863 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0792753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  29.53 
 
 		 844 aa  314  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2303  hypothetical protein  30.32 
 
 		 871 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  30.05 
 
 		 827 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1668  hypothetical protein  29.98 
 
 		 871 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2280  hypothetical protein  29.98 
 
 		 871 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0427  hypothetical protein  30.07 
 
 		 829 aa  308  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.940862  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  29.69 
 
 		 843 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  30.19 
 
 		 851 aa  307  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2465  protein of unknown function DUF214  28.93 
 
 		 840 aa  303  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0205544  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5607  hypothetical protein  29.95 
 
 		 871 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1068  hypothetical protein  29.76 
 
 		 832 aa  301  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0948  hypothetical protein  29.29 
 
 		 835 aa  296  8e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2196  hypothetical protein  30.37 
 
 		 834 aa  293  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2114  hypothetical protein  31.52 
 
 		 831 aa  293  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74108  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2318  hypothetical protein  30.37 
 
 		 871 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  28.91 
 
 		 858 aa  290  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  28.33 
 
 		 853 aa  288  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2266  permease, putative  29.15 
 
 		 838 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1029  hypothetical protein  29.46 
 
 		 869 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1315  protein of unknown function DUF214  28.61 
 
 		 861 aa  283  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156464 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3245  ABC lysophospholipase exporter, fused innermembrane subunits, FtsX  28.86 
 
 		 860 aa  279  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2066  hypothetical protein  29.08 
 
 		 838 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134664  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1251  efflux ABC transporter, permease protein  29.57 
 
 		 883 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1918  hypothetical protein  29.22 
 
 		 835 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00695603  hitchhiker  0.000000000000882803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  28.75 
 
 		 857 aa  277  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1602  hypothetical protein  29.06 
 
 		 874 aa  276  8e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000566259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  28.2 
 
 		 838 aa  276  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1259  efflux ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 		 880 aa  276  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356208  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  28.75 
 
 		 857 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  27.66 
 
 		 842 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2618  hypothetical protein  29.51 
 
 		 842 aa  275  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.855589  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2407  hypothetical protein  30.28 
 
 		 826 aa  274  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514228  hitchhiker  0.00130087 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1400  putative permease  29.05 
 
 		 1108 aa  273  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27140  hypothetical protein  30.36 
 
 		 830 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2296  hypothetical protein  30.32 
 
 		 833 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3453  hypothetical protein  29.34 
 
 		 832 aa  271  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000113684 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2316  hypothetical protein  29.34 
 
 		 832 aa  270  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000697167 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  27.93 
 
 		 843 aa  264  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0810  putative transmembrane protein  28.14 
 
 		 856 aa  263  8.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4016  hypothetical protein  28.16 
 
 		 834 aa  263  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401086  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  27.38 
 
 		 840 aa  263  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2310  ABC transporter, permease protein  25.68 
 
 		 836 aa  262  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.545589  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  26.94 
 
 		 844 aa  259  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2896  hypothetical protein  26.98 
 
 		 821 aa  258  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431502 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2209  hypothetical protein  28.11 
 
 		 819 aa  256  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.795386  normal  0.224518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  27.92 
 
 		 839 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0533  hypothetical protein  27.9 
 
 		 840 aa  254  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1539  hypothetical protein  28.01 
 
 		 833 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00274903 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1545  hypothetical protein  27.9 
 
 		 833 aa  252  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1480  hypothetical protein  27.78 
 
 		 833 aa  250  7e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2566  hypothetical protein  28.02 
 
 		 827 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3446  ABC transporter, permease protein, putative  27.19 
 
 		 828 aa  246  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000339618  hitchhiker  0.000208184 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2783  hypothetical protein  27.53 
 
 		 837 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.667381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23050  hypothetical protein  28.17 
 
 		 833 aa  239  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.636342  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1399  ABC transporter, permease protein  25.59 
 
 		 830 aa  239  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1680  protein of unknown function DUF214  27.25 
 
 		 842 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.432743  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2707  hypothetical protein  27.44 
 
 		 836 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1124  hypothetical protein  26.05 
 
 		 809 aa  238  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.101154  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2366  hypothetical protein  27.28 
 
 		 827 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.197088  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2686  hypothetical protein  27.25 
 
 		 842 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1662  hypothetical protein  26.7 
 
 		 817 aa  237  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000552359  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1758  hypothetical protein  28.16 
 
 		 835 aa  237  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293557  hitchhiker  0.00000000277599 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0008  protein of unknown function DUF214  30.22 
 
 		 836 aa  237  8e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3019  efflux ABC transporter, permease protein  27.43 
 
 		 809 aa  237  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00602267  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0684  hypothetical protein  29.41 
 
 		 829 aa  236  9e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.852275  normal  0.517784 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1273  efflux ABC transporter permease  27.18 
 
 		 809 aa  237  9e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.924579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3157  hypothetical protein  27.43 
 
 		 809 aa  235  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.513308  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1056  protein of unknown function DUF214  27.99 
 
 		 810 aa  234  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1698  hypothetical protein  26.18 
 
 		 823 aa  233  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.405062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2926  ABC transporter, permease, putative  28.39 
 
 		 835 aa  232  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3191  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 		 809 aa  230  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0495543  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0970  hypothetical protein  26.15 
 
 		 804 aa  229  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0722  hypothetical protein  27.26 
 
 		 815 aa  228  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000480127  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2390  hypothetical protein  27.81 
 
 		 831 aa  228  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.652609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2401  hypothetical protein  27.42 
 
 		 816 aa  228  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.678425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0575  efflux ABC transporter, permease protein  26.52 
 
 		 804 aa  227  7e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0431  efflux ABC transporter, permease protein  26.33 
 
 		 805 aa  225  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0535  efflux ABC transporter, permease protein  26.39 
 
 		 804 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3114  protein of unknown function DUF214  26.39 
 
 		 804 aa  223  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3120  hypothetical protein  26.34 
 
 		 804 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749019 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0545  efflux ABC transporter, permease protein  26.27 
 
 		 804 aa  222  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0600  efflux ABC transporter, permease protein  26.27 
 
 		 804 aa  221  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.77559 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1487  ABC transporter, permease, putative  26.75 
 
 		 818 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3003  protein of unknown function DUF214  28.36 
 
 		 810 aa  221  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.558274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1159  hypothetical protein  27.59 
 
 		 810 aa  220  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184343 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1252  hypothetical protein  34.94 
 
 		 835 aa  219  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2066  hypothetical protein  26.73 
 
 		 835 aa  217  5.9999999999999996e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0287  predicted permease  24.94 
 
 		 815 aa  216  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0572  efflux ABC transporter permease  26.58 
 
 		 804 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.868504 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00447  predicted inner membrane protein  26.45 
 
 		 804 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00452  hypothetical protein  26.45 
 
 		 804 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0616  efflux ABC transporter permease  26.46 
 
 		 804 aa  214  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0555  efflux ABC transporter, permease protein  26.58 
 
 		 804 aa  213  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1046  hypothetical protein  26.98 
 
 		 828 aa  213  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>