More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1675 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  75.15 
 
 		 1041 aa  1563    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  41.8 
 
 		 1048 aa  807    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  48.15 
 
 		 1059 aa  951    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  77.25 
 
 		 1036 aa  1598    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  41.71 
 
 		 1053 aa  843    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  47.58 
 
 		 1040 aa  918    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  44.28 
 
 		 1058 aa  908    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  42.36 
 
 		 1055 aa  835    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  45.17 
 
 		 1050 aa  881    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  47.78 
 
 		 1049 aa  914    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  44.77 
 
 		 1039 aa  880    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  76.02 
 
 		 1046 aa  1521    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1034 aa  2061    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  46.69 
 
 		 1063 aa  934    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  34.58 
 
 		 1058 aa  646    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  42.87 
 
 		 1058 aa  850    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 		 1034 aa  592  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  34.04 
 
 		 1055 aa  591  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  32.92 
 
 		 1038 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 		 1032 aa  579  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 		 1011 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  34.2 
 
 		 1496 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1044 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1470 aa  571  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  32.15 
 
 		 1050 aa  567  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1043 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1043 aa  557  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1095 aa  555  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1028 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1039 aa  549  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 		 1028 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  32.95 
 
 		 1036 aa  545  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  34.1 
 
 		 1041 aa  542  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.15 
 
 		 1024 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1028 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.5 
 
 		 1024 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 		 1065 aa  530  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1044 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1070 aa  528  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1026 aa  524  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  32.48 
 
 		 1071 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  32.45 
 
 		 1047 aa  517  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  32.28 
 
 		 1066 aa  515  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  32.54 
 
 		 1048 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1075 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  32.19 
 
 		 1069 aa  513  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1023 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  34.5 
 
 		 1026 aa  510  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.14 
 
 		 1049 aa  509  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  30.94 
 
 		 1035 aa  506  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  31.42 
 
 		 1040 aa  504  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  32.5 
 
 		 1031 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  32.47 
 
 		 1054 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  32.71 
 
 		 1038 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 		 1054 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 		 1054 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  32.42 
 
 		 1045 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  33.75 
 
 		 1027 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  30.47 
 
 		 1022 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  31.6 
 
 		 1033 aa  496  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  31.52 
 
 		 1028 aa  495  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  32.14 
 
 		 1024 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1062 aa  493  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  31.92 
 
 		 1031 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 		 1044 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 		 1064 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  29.95 
 
 		 1073 aa  492  1e-137  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  32.26 
 
 		 1037 aa  491  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  31.82 
 
 		 1031 aa  493  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  31.82 
 
 		 1031 aa  492  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  29.67 
 
 		 1171 aa  490  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  30.64 
 
 		 1022 aa  490  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1042 aa  489  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  31.82 
 
 		 1067 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  30.92 
 
 		 1177 aa  487  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  34.78 
 
 		 1028 aa  488  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 		 1009 aa  485  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1031 aa  485  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  29.68 
 
 		 1034 aa  484  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1031 aa  482  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  30.04 
 
 		 1006 aa  481  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1031 aa  483  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  30.31 
 
 		 1051 aa  481  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  32.11 
 
 		 1031 aa  481  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1031 aa  482  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  31.53 
 
 		 1034 aa  481  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.24 
 
 		 1031 aa  479  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  31.63 
 
 		 1031 aa  479  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 		 1101 aa  478  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1031 aa  478  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 		 1030 aa  475  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 		 1034 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.66 
 
 		 1034 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1046 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  30.09 
 
 		 1026 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01921  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1041 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413816  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1041 aa  470  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  29.65 
 
 		 1027 aa  469  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 		 1024 aa  467  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  30.44 
 
 		 1037 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>