134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1280 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4500  protein of unknown function DUF214  43.2 
 
 		 789 aa  657    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.140926 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1124  hypothetical protein  61.42 
 
 		 793 aa  919    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.527688 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1508  hypothetical protein  75.35 
 
 		 787 aa  1179    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  44.6 
 
 		 787 aa  668    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1478  hypothetical protein  45.05 
 
 		 787 aa  665    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6251  hypothetical protein  43.53 
 
 		 789 aa  671    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.424729  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4368  protein of unknown function DUF214  43.2 
 
 		 789 aa  657    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  81.55 
 
 		 788 aa  1279    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  69.25 
 
 		 787 aa  1093    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  67.22 
 
 		 787 aa  1066    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1280  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 787 aa  1585    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.134975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1701  hypothetical protein  42.95 
 
 		 787 aa  635  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0063  permease domain-containing protein  44.26 
 
 		 789 aa  631  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  42.95 
 
 		 789 aa  611  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1582  hypothetical protein  42.75 
 
 		 793 aa  606  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.143489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2205  hypothetical protein  40.79 
 
 		 787 aa  601  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.578732  normal  0.0125099 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5172  hypothetical protein  41.67 
 
 		 788 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.841676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2282  hypothetical protein  39.34 
 
 		 787 aa  582  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  41.86 
 
 		 790 aa  569  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2063  protein of unknown function DUF214  39.01 
 
 		 786 aa  566  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.059319  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  35.98 
 
 		 788 aa  559  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0077  hypothetical protein  40.28 
 
 		 787 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.654409 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1941  hypothetical protein  40.08 
 
 		 787 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382798  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1012  hypothetical protein  39.11 
 
 		 791 aa  538  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0301  hypothetical protein  38.31 
 
 		 787 aa  536  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1055  protein of unknown function DUF214  38.2 
 
 		 787 aa  528  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5376  hypothetical protein  37.24 
 
 		 788 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.687555  normal  0.158933 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4267  hypothetical protein  39.54 
 
 		 793 aa  517  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2960  hypothetical protein  40.75 
 
 		 786 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2657  ABC transporter, inner membrane subunit  38.5 
 
 		 786 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3437  hypothetical protein  37.5 
 
 		 800 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.248867 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  38.25 
 
 		 786 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  37.99 
 
 		 786 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3584  hypothetical protein  38.37 
 
 		 787 aa  475  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2303  hypothetical protein  37.48 
 
 		 788 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.951648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2068  hypothetical protein  37.7 
 
 		 790 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.847092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4212  hypothetical protein  36.61 
 
 		 789 aa  441  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  32.2 
 
 		 792 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  31.38 
 
 		 791 aa  349  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  27.94 
 
 		 792 aa  345  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4677  protein of unknown function DUF214  29.02 
 
 		 792 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  29.31 
 
 		 787 aa  292  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  28.34 
 
 		 797 aa  286  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  23.7 
 
 		 774 aa  177  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  23.94 
 
 		 1132 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  24.13 
 
 		 1132 aa  152  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1080  peptide ABC transporter permease  23.34 
 
 		 859 aa  138  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0653596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2589  hypothetical protein  23.94 
 
 		 947 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  23.35 
 
 		 1016 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  22.74 
 
 		 868 aa  127  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  22.29 
 
 		 1090 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1003  permease, putative  21.55 
 
 		 876 aa  110  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0149153  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1582  protein of unknown function DUF214  20.77 
 
 		 743 aa  107  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1113  protein of unknown function DUF214  23.99 
 
 		 1110 aa  106  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0748  protein of unknown function DUF214  20.98 
 
 		 1068 aa  105  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1665  protein of unknown function DUF214  21.43 
 
 		 773 aa  103  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  22.68 
 
 		 1143 aa  102  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2177  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 		 1177 aa  100  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0391  protein of unknown function DUF214  23.5 
 
 		 737 aa  100  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0110  protein of unknown function DUF214  19.76 
 
 		 759 aa  88.2  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0590348  normal  0.0712299 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01930  Predicted permease  23.04 
 
 		 1232 aa  80.9  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.436624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0133  efflux ABC transporter, permease protein  23.89 
 
 		 917 aa  74.3  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1694  protein of unknown function DUF214  19.68 
 
 		 749 aa  61.2  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1516  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  22.3 
 
 		 1211 aa  57.4  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  21.14 
 
 		 828 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  23.74 
 
 		 389 aa  55.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 		 852 aa  54.7  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  24.58 
 
 		 848 aa  53.9  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  21.34 
 
 		 856 aa  53.9  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  29.77 
 
 		 861 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.17 
 
 		 863 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf117  ABC transporter permease protein  23.2 
 
 		 2777 aa  52.4  0.00003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.247181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  22.88 
 
 		 847 aa  52  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.12 
 
 		 414 aa  51.2  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  26 
 
 		 838 aa  51.2  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  22.99 
 
 		 399 aa  50.8  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  29.71 
 
 		 841 aa  50.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  25.61 
 
 		 827 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6966  protein of unknown function DUF214  25.6 
 
 		 805 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0119  putative ABC transporter, permease protein  25.73 
 
 		 675 aa  49.3  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.086048  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  30.36 
 
 		 842 aa  49.3  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  23.45 
 
 		 855 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.23 
 
 		 386 aa  48.5  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.41 
 
 		 437 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  21.29 
 
 		 389 aa  48.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  22.84 
 
 		 850 aa  47.8  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3859  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.19 
 
 		 416 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0120  permease domain-containing protein  25.15 
 
 		 659 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  28.97 
 
 		 380 aa  47  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  27.63 
 
 		 896 aa  47.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  28 
 
 		 404 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0759  hypothetical protein  24.63 
 
 		 401 aa  46.6  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00207585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  30.43 
 
 		 846 aa  46.6  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  24.42 
 
 		 419 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1671  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.53 
 
 		 416 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.966628  normal  0.962664 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  20.72 
 
 		 416 aa  46.2  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  20.67 
 
 		 858 aa  45.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  29.73 
 
 		 391 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  29.73 
 
 		 384 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  29.73 
 
 		 391 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>