More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1654 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  804    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2199  hypothetical protein  39.64 
 
 
400 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.748449  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1426  hypothetical protein  43.15 
 
 
402 aa  278  1e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.407629  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0759  hypothetical protein  37.76 
 
 
401 aa  277  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00207585  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0895  hypothetical protein  29.4 
 
 
400 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465052  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2654  ABC transporter, permease protein  29 
 
 
401 aa  187  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0708496 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0985  hypothetical protein  29.59 
 
 
402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  22.5 
 
 
389 aa  73.6  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  24.87 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  24.47 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  22.67 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  25.17 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  21.54 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  30.52 
 
 
681 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3413  hypothetical protein  30.52 
 
 
373 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779659  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  30.52 
 
 
687 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  30.52 
 
 
681 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  24.68 
 
 
647 aa  63.5  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.82 
 
 
653 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  24.68 
 
 
682 aa  63.2  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  25.32 
 
 
656 aa  63.2  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  24.68 
 
 
682 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.82 
 
 
653 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.82 
 
 
653 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  24.68 
 
 
667 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.82 
 
 
653 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  24.68 
 
 
667 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.68 
 
 
656 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  22.36 
 
 
400 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6489  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 
406 aa  60.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 
404 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  22.39 
 
 
648 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  23.96 
 
 
788 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  27.97 
 
 
419 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  22.39 
 
 
648 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  26.83 
 
 
651 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  23.82 
 
 
787 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  26.44 
 
 
484 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0081  hypothetical protein  24.74 
 
 
420 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.466459  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26210  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  26.19 
 
 
919 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.443044  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  29.41 
 
 
402 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0832  protein of unknown function DUF214  21.81 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3411  ABC transporter, inner membrane subunit  24.32 
 
 
405 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 
402 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  26.61 
 
 
790 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  25.27 
 
 
408 aa  57  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
401 aa  57.4  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.32 
 
 
648 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  23.03 
 
 
649 aa  57  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.32 
 
 
648 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  24.78 
 
 
830 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.32 
 
 
648 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.32 
 
 
648 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  21.4 
 
 
421 aa  56.6  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  24.51 
 
 
404 aa  56.2  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.32 
 
 
648 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3560  protein of unknown function DUF214  25.91 
 
 
405 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  23.08 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  25 
 
 
643 aa  55.8  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  25.11 
 
 
399 aa  56.2  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  24.81 
 
 
678 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  24.81 
 
 
678 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.81 
 
 
678 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  25.46 
 
 
484 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2534  hypothetical protein  25.42 
 
 
416 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176241  normal  0.761271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  29.32 
 
 
403 aa  54.3  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  23.98 
 
 
641 aa  53.9  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  22.8 
 
 
641 aa  53.9  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  26.02 
 
 
668 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  28.46 
 
 
1090 aa  53.5  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  22.33 
 
 
401 aa  53.5  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  25 
 
 
398 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  23.39 
 
 
641 aa  53.1  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  21.68 
 
 
397 aa  53.1  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  23.39 
 
 
641 aa  53.1  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 
386 aa  53.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.18 
 
 
851 aa  53.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 
452 aa  53.1  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  31.62 
 
 
443 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.95 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  26.95 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  23.11 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  22.7 
 
 
642 aa  52.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  24.48 
 
 
642 aa  52.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  23.12 
 
 
791 aa  52.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  21.07 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.93 
 
 
411 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  26.58 
 
 
421 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  22.56 
 
 
652 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  25.98 
 
 
663 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  24.06 
 
 
787 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  31.67 
 
 
397 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  24.53 
 
 
464 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0912  hypothetical protein  28.78 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0881  hypothetical protein  27.7 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1839  protein of unknown function DUF214  22.94 
 
 
416 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  0.633197 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  22.3 
 
 
409 aa  51.6  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0199  peptide ABC transporter permease  26.28 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  27.14 
 
 
1207 aa  51.2  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  30.66 
 
 
406 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>