164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0119 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0119  putative ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 675 aa  1343    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.086048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0120  permease domain-containing protein  95.41 
 
 		 659 aa  1238    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  33.76 
 
 		 702 aa  411  1e-113  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.863248 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1418  protein of unknown function DUF214  32.24 
 
 		 730 aa  408  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.354153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1078  protein of unknown function DUF214  32.36 
 
 		 703 aa  377  1e-103  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1937  protein of unknown function DUF214  34.09 
 
 		 700 aa  365  1e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.15704  normal  0.168646 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5202  ABC transporter, permease component  26.09 
 
 		 641 aa  187  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4949  ABC transporter permease protein  25.7 
 
 		 634 aa  179  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0288  ABC transporter, permease  24.45 
 
 		 620 aa  177  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4963  ABC transporter, permease  25.55 
 
 		 634 aa  177  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4556  ABC transporter, permease  25.18 
 
 		 634 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4642  ABC transporter permease  25.93 
 
 		 619 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4996  ABC transporter permease  25.93 
 
 		 619 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2842  ABC transporter, permease  24.12 
 
 		 614 aa  171  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4670  hypothetical protein  27.26 
 
 		 649 aa  170  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4887  ABC transporter, permease protein, putative  24.37 
 
 		 614 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4955  efflux ABC transporter, permease protein  26.86 
 
 		 649 aa  169  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0381  ABC transporter, permease component  23.95 
 
 		 616 aa  169  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4797  ABC transporter; permease  25.18 
 
 		 617 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4662  hypothetical protein  24.89 
 
 		 620 aa  167  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5250  ABC transporter; permease  26.14 
 
 		 617 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4495  ABC transporter, permease  24.56 
 
 		 619 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4880  ABC transporter, permease  23.78 
 
 		 614 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4945  efflux ABC transporter, permease protein  25.73 
 
 		 649 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4575  hypothetical protein  24.09 
 
 		 619 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4722  ABC transporter permease  25.58 
 
 		 649 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5084  ABC transporter permease  25.58 
 
 		 649 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.265996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4866  putative ABC transporter, permease protein  24.23 
 
 		 619 aa  162  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4580  ABC transporter, permease  25.58 
 
 		 649 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4564  ABC transporter, permease  26.18 
 
 		 649 aa  161  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.206962  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4477  ABC transporter, permease  23.77 
 
 		 619 aa  160  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4856  putative ABC transporter, permease protein  25.26 
 
 		 619 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4971  efflux ABC transporter, permease protein  26.03 
 
 		 649 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3417  hypothetical protein  24.26 
 
 		 621 aa  158  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.603492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2225  ABC transporter permease  24.26 
 
 		 626 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2390  ABC transporter permease  24.26 
 
 		 626 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2147  ABC transporter, permease  23.93 
 
 		 626 aa  150  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0559671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2311  hypothetical protein  23.07 
 
 		 615 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2421  ABC transporter, permease protein, putative  24.33 
 
 		 626 aa  148  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2491  putative ABC transporter, permease protein  24.22 
 
 		 626 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1525  hypothetical protein  24.89 
 
 		 622 aa  147  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2024  ABC transporter, permease component  23.75 
 
 		 609 aa  147  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0699  ABC transporter, permease  24.12 
 
 		 640 aa  147  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2111  hypothetical protein  23.45 
 
 		 685 aa  146  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2356  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 626 aa  145  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2163  ABC transporter, permease  24.26 
 
 		 626 aa  145  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270319  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1693  peptide ABC transporter permease  22.47 
 
 		 622 aa  144  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.18804e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0714  hypothetical protein  24.23 
 
 		 640 aa  142  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876899  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0837  ABC transporter permease  48.15 
 
 		 152 aa  140  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0723221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4658  hypothetical protein  23.15 
 
 		 615 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2197  hypothetical protein  24.4 
 
 		 627 aa  134  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00250497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5205  ABC transporter permease protein  23.86 
 
 		 616 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3485  hypothetical protein  21.36 
 
 		 656 aa  128  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4170  ABC transporter, permease  23.63 
 
 		 640 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4589  ABC transporter, permease  23.18 
 
 		 657 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2971  putative ABC transporter, permease protein  24.48 
 
 		 626 aa  126  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.809665  normal  0.42091 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4333  ABC transporter permease  23.59 
 
 		 640 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.403638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4668  ABC transporter permease  23.59 
 
 		 640 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4994  permease domain-containing protein  21.92 
 
 		 657 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0270  hypothetical protein  21.66 
 
 		 659 aa  124  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4516  ABC transporter, permease protein  23.44 
 
 		 640 aa  124  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3331  hypothetical protein  22.6 
 
 		 662 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2621  efflux ABC transporter, permease protein  24.6 
 
 		 643 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080038 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2350  ABC transporter, permease  24.6 
 
 		 643 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4950  hypothetical protein  22.04 
 
 		 657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4181  ABC transporter, permease  22.88 
 
 		 640 aa  122  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2725  hypothetical protein  20.06 
 
 		 626 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2782  hypothetical protein  20.06 
 
 		 626 aa  121  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4679  hypothetical protein  23 
 
 		 656 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1307  peptide ABC transporter permease  23.21 
 
 		 666 aa  120  7e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1790  hypothetical protein  22.1 
 
 		 641 aa  120  7e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111831  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2747  efflux ABC transporter, permease protein  23.84 
 
 		 643 aa  120  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.543337  hitchhiker  0.00000301265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0524  protein of unknown function DUF214  22.62 
 
 		 676 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.245064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4991  permease, putative  23.27 
 
 		 656 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0280  ABC transporter, permease component  29.14 
 
 		 649 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4282  hypothetical protein  22.4 
 
 		 640 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.855208  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4964  putative permease  22.85 
 
 		 651 aa  119  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0267  ABC transporter, permease component  22.45 
 
 		 657 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4554  ABC transporter, permease protein  22.67 
 
 		 640 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2530  hypothetical protein  24.2 
 
 		 643 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00952012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4984  ABC transporter, permease protein  29.14 
 
 		 649 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2384  ABC transporter, permease  23.16 
 
 		 641 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0584897  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4569  ABC transporter, permease  21.81 
 
 		 657 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00654206  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0680  ABC transporter permease protein  23.19 
 
 		 640 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00920993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0269  putative permease  22.34 
 
 		 651 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4981  hypothetical protein  21.69 
 
 		 658 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4590  ABC transporter, permease  22.95 
 
 		 651 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2576  efflux ABC transporter, permease protein  22.35 
 
 		 644 aa  114  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2645  hypothetical protein  23.03 
 
 		 666 aa  114  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2701  hypothetical protein  23.03 
 
 		 666 aa  114  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4527  ABC transporter, permease protein  22.9 
 
 		 640 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4966  hypothetical protein  22.29 
 
 		 658 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2325  hypothetical protein  22.02 
 
 		 645 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.93865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4592  ABC transporter, permease  21.96 
 
 		 659 aa  112  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4569  ABC transporter, permease protein  23.04 
 
 		 640 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4680  hypothetical protein  21.11 
 
 		 652 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4730  permease  22.71 
 
 		 651 aa  111  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5090  permease  22.71 
 
 		 651 aa  111  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4570  ABC transporter, permease  22.53 
 
 		 651 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0344591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1862  hypothetical protein  22.94 
 
 		 626 aa  110  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>