102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2111 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2111  hypothetical protein  100 
 
 		 685 aa  1380    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0120  permease domain-containing protein  24.02 
 
 		 659 aa  150  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0119  putative ABC transporter, permease protein  23.45 
 
 		 675 aa  147  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.086048  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  26.34 
 
 		 702 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.863248 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1418  protein of unknown function DUF214  24.1 
 
 		 730 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.354153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1937  protein of unknown function DUF214  23.77 
 
 		 700 aa  105  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.15704  normal  0.168646 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4670  hypothetical protein  24.39 
 
 		 649 aa  99.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4984  ABC transporter, permease protein  23.49 
 
 		 649 aa  97.4  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1525  hypothetical protein  22.58 
 
 		 622 aa  95.1  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5202  ABC transporter, permease component  22.7 
 
 		 641 aa  91.3  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4722  ABC transporter permease  24.92 
 
 		 649 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4564  ABC transporter, permease  22.83 
 
 		 649 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.206962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5084  ABC transporter permease  24.92 
 
 		 649 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.265996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0280  ABC transporter, permease component  23.57 
 
 		 649 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4945  efflux ABC transporter, permease protein  24.05 
 
 		 649 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1078  protein of unknown function DUF214  20.81 
 
 		 703 aa  80.5  0.00000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4971  efflux ABC transporter, permease protein  22.83 
 
 		 649 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4580  ABC transporter, permease  23.65 
 
 		 649 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4955  efflux ABC transporter, permease protein  22.71 
 
 		 649 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4949  ABC transporter permease protein  21.17 
 
 		 634 aa  78.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1790  hypothetical protein  22.97 
 
 		 641 aa  73.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4658  hypothetical protein  22.34 
 
 		 615 aa  73.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2147  ABC transporter, permease  25.64 
 
 		 626 aa  70.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0559671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4994  permease domain-containing protein  21.61 
 
 		 657 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2163  ABC transporter, permease  25.93 
 
 		 626 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2842  ABC transporter, permease  21.77 
 
 		 614 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2421  ABC transporter, permease protein, putative  25.93 
 
 		 626 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4556  ABC transporter, permease  20.99 
 
 		 634 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4887  ABC transporter, permease protein, putative  26.3 
 
 		 614 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4880  ABC transporter, permease  22.31 
 
 		 614 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2356  putative ABC transporter, permease protein  26.02 
 
 		 626 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0381  ABC transporter, permease component  26.04 
 
 		 616 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2225  ABC transporter permease  25.64 
 
 		 626 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2390  ABC transporter permease  25.64 
 
 		 626 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2491  putative ABC transporter, permease protein  25.64 
 
 		 626 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4963  ABC transporter, permease  21.31 
 
 		 634 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3417  hypothetical protein  21.51 
 
 		 621 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.603492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4797  ABC transporter; permease  24.66 
 
 		 617 aa  64.3  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4866  putative ABC transporter, permease protein  26.04 
 
 		 619 aa  64.3  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4477  ABC transporter, permease  25.78 
 
 		 619 aa  63.9  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4495  ABC transporter, permease  25.78 
 
 		 619 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5250  ABC transporter; permease  25.62 
 
 		 617 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4856  putative ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 		 619 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4642  ABC transporter permease  25.84 
 
 		 619 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4996  ABC transporter permease  25.84 
 
 		 619 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1693  peptide ABC transporter permease  26.32 
 
 		 622 aa  60.5  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.18804e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2024  ABC transporter, permease component  23.86 
 
 		 609 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0714  hypothetical protein  21.12 
 
 		 640 aa  59.7  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2311  hypothetical protein  25.99 
 
 		 615 aa  59.7  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2971  putative ABC transporter, permease protein  26.06 
 
 		 626 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.809665  normal  0.42091 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2197  hypothetical protein  24.79 
 
 		 627 aa  58.9  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00250497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4575  hypothetical protein  26.1 
 
 		 619 aa  58.9  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4981  hypothetical protein  19.91 
 
 		 658 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0699  ABC transporter, permease  21.64 
 
 		 640 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2350  ABC transporter, permease  21.76 
 
 		 643 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2621  efflux ABC transporter, permease protein  21.76 
 
 		 643 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080038 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0020  ABC transporter, permease protein  28.91 
 
 		 626 aa  57  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.763643  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0267  ABC transporter, permease component  20.12 
 
 		 657 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0288  ABC transporter, permease  26.32 
 
 		 620 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0837  ABC transporter permease  29.09 
 
 		 152 aa  55.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0723221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2893  ABC transporter, permease  23.51 
 
 		 656 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0821213  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2725  hypothetical protein  21.88 
 
 		 626 aa  55.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2782  hypothetical protein  21.88 
 
 		 626 aa  55.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4662  hypothetical protein  25.99 
 
 		 620 aa  55.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4592  ABC transporter, permease  21.28 
 
 		 659 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4682  hypothetical protein  22.08 
 
 		 659 aa  54.7  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4953  hypothetical protein  20.12 
 
 		 658 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4572  ABC transporter, permease  20.12 
 
 		 658 aa  54.3  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.670805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5205  ABC transporter permease protein  21.77 
 
 		 616 aa  54.3  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3331  hypothetical protein  21.71 
 
 		 662 aa  53.9  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2325  hypothetical protein  29.3 
 
 		 645 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.93865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0340  protein of unknown function DUF214  23.53 
 
 		 641 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2957  ABC transporter, permease associated with salivaricin lantibiotic  23.88 
 
 		 656 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2530  hypothetical protein  32.33 
 
 		 643 aa  52  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00952012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4966  hypothetical protein  19.79 
 
 		 658 aa  52  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1511  hypothetical protein  19.88 
 
 		 626 aa  51.6  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0723575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2307  hypothetical protein  20.96 
 
 		 656 aa  51.6  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00102704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4991  permease, putative  24.55 
 
 		 656 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4730  permease  21.24 
 
 		 651 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5090  permease  21.24 
 
 		 651 aa  48.9  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2747  efflux ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 		 643 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.543337  hitchhiker  0.00000301265 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4732  ABC transporter permease, N-terminus  28.17 
 
 		 235 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2203  ABC transporter, permease protein  22.24 
 
 		 670 aa  48.1  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4590  ABC transporter, permease  21.24 
 
 		 651 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4964  putative permease  19.97 
 
 		 651 aa  47.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1827  ABC transporter permease  20.6 
 
 		 626 aa  47.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0776042  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4527  ABC transporter, permease protein  22.37 
 
 		 640 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4570  ABC transporter, permease  21.04 
 
 		 651 aa  47.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0344591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4679  hypothetical protein  25.55 
 
 		 656 aa  47.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3308  hypothetical protein  23.53 
 
 		 626 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.694511  hitchhiker  0.0000199726 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4951  putative permease  20.42 
 
 		 595 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4282  hypothetical protein  22.14 
 
 		 640 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.855208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2096  hypothetical protein  24.49 
 
 		 626 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000483001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4569  ABC transporter, permease protein  22.32 
 
 		 640 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2076  permease domain-containing protein  23.36 
 
 		 626 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00474198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1811  ABC transporter, permease  24.26 
 
 		 626 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.178931  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0658  ABC transporter, permease protein  20.33 
 
 		 681 aa  45.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1856  ABC transporter permease  24.59 
 
 		 412 aa  45.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1862  hypothetical protein  23.69 
 
 		 626 aa  45.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2576  efflux ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 		 644 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>