151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0658 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0658  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
681 aa  1353    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3331  hypothetical protein  33.66 
 
 
662 aa  324  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1307  peptide ABC transporter permease  26.98 
 
 
666 aa  239  2e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0524  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 
676 aa  237  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.245064  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1090  protein of unknown function DUF214  29.72 
 
 
657 aa  227  6e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0975  ABC transporter, permease protein, putative  26.07 
 
 
651 aa  204  3e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0837  peptide ABC transporter permease  26.83 
 
 
655 aa  202  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.696049  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1912  peptide ABC transporter permease  25.58 
 
 
669 aa  199  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1790  hypothetical protein  24.21 
 
 
641 aa  177  7e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111831  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2645  hypothetical protein  24.12 
 
 
666 aa  168  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2701  hypothetical protein  24.12 
 
 
666 aa  168  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4963  ABC transporter, permease  25.76 
 
 
634 aa  167  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4556  ABC transporter, permease  26.06 
 
 
634 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4949  ABC transporter permease protein  25.07 
 
 
634 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2203  ABC transporter, permease protein  26.11 
 
 
670 aa  163  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4670  hypothetical protein  24.56 
 
 
649 aa  160  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4984  ABC transporter, permease protein  23.69 
 
 
649 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4580  ABC transporter, permease  24.54 
 
 
649 aa  150  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0280  ABC transporter, permease component  24.35 
 
 
649 aa  147  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4945  efflux ABC transporter, permease protein  24.43 
 
 
649 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4722  ABC transporter permease  24.43 
 
 
649 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4971  efflux ABC transporter, permease protein  24.68 
 
 
649 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5084  ABC transporter permease  24.43 
 
 
649 aa  146  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.265996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4564  ABC transporter, permease  24.11 
 
 
649 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.206962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4955  efflux ABC transporter, permease protein  24.25 
 
 
649 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0699  ABC transporter, permease  25.11 
 
 
640 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1525  hypothetical protein  23.71 
 
 
622 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2491  putative ABC transporter, permease protein  22.91 
 
 
626 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2421  ABC transporter, permease protein, putative  23.11 
 
 
626 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2163  ABC transporter, permease  22.57 
 
 
626 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4554  ABC transporter, permease protein  24.66 
 
 
640 aa  110  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4332  ABC transporter permease  23.03 
 
 
638 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4667  ABC transporter permease  23.03 
 
 
638 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2311  hypothetical protein  22.58 
 
 
615 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4991  permease, putative  22.14 
 
 
656 aa  108  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4282  hypothetical protein  24.74 
 
 
640 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.855208  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0119  putative ABC transporter, permease protein  23.96 
 
 
675 aa  107  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.086048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0680  ABC transporter permease protein  24.21 
 
 
640 aa  107  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00920993  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4515  ABC transporter, permease protein  23.4 
 
 
638 aa  107  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.834594 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5202  ABC transporter, permease component  25.87 
 
 
641 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4642  ABC transporter permease  24.06 
 
 
619 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4170  ABC transporter, permease  24.43 
 
 
640 aa  106  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4181  ABC transporter, permease  24.22 
 
 
640 aa  106  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4996  ABC transporter permease  24.06 
 
 
619 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4856  putative ABC transporter, permease protein  22.13 
 
 
619 aa  105  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0270  hypothetical protein  22.46 
 
 
659 aa  104  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4730  permease  23.57 
 
 
651 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5090  permease  23.57 
 
 
651 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4979  putative permease  22.16 
 
 
651 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4992  permease, putative  23.63 
 
 
651 aa  103  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4333  ABC transporter permease  24.28 
 
 
640 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.403638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4570  ABC transporter, permease  23.34 
 
 
651 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0344591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4668  ABC transporter permease  24.28 
 
 
640 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4516  ABC transporter, permease protein  24.28 
 
 
640 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2197  hypothetical protein  22.59 
 
 
627 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00250497  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4169  ABC transporter, permease  23.05 
 
 
637 aa  101  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4680  hypothetical protein  23.83 
 
 
652 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4964  putative permease  23.9 
 
 
651 aa  100  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0120  permease domain-containing protein  23.97 
 
 
659 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4527  ABC transporter, permease protein  24.28 
 
 
640 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4679  hypothetical protein  22.19 
 
 
656 aa  99  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2033  hypothetical protein  21.48 
 
 
626 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98953e-36 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4569  ABC transporter, permease protein  24.28 
 
 
640 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2747  efflux ABC transporter, permease protein  22.16 
 
 
643 aa  97.8  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.543337  hitchhiker  0.00000301265 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0269  putative permease  23.18 
 
 
651 aa  97.4  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0315  ABC transporter, permease protein  20.71 
 
 
629 aa  97.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0917781  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4477  ABC transporter, permease  22.3 
 
 
619 aa  96.3  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3151  hypothetical protein  23.28 
 
 
640 aa  95.9  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1693  peptide ABC transporter permease  22.02 
 
 
622 aa  95.1  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18804e-19 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4951  putative permease  23.29 
 
 
595 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3150  hypothetical protein  22.84 
 
 
637 aa  94.4  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4553  ABC transporter, permease protein  22.02 
 
 
637 aa  94  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.388232  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  22.73 
 
 
702 aa  93.2  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.863248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2530  hypothetical protein  21.87 
 
 
643 aa  92.8  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00952012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4590  ABC transporter, permease  23.16 
 
 
651 aa  92  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4495  ABC transporter, permease  22.3 
 
 
619 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0714  hypothetical protein  27.38 
 
 
640 aa  91.3  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876899  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0681  ABC transporter, permease protein  22.19 
 
 
636 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.003357  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5250  ABC transporter; permease  25.67 
 
 
617 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1511  hypothetical protein  20.99 
 
 
626 aa  89.7  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0723575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4569  ABC transporter, permease  21.79 
 
 
657 aa  88.2  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00654206  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2384  ABC transporter, permease  22.34 
 
 
641 aa  87.8  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0584897  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4589  ABC transporter, permease  22.03 
 
 
657 aa  87.4  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4575  hypothetical protein  21.76 
 
 
619 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4950  hypothetical protein  21.89 
 
 
657 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1827  ABC transporter permease  23.32 
 
 
626 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0776042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1811  ABC transporter, permease  23.32 
 
 
626 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.178931  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2147  ABC transporter, permease  26.17 
 
 
626 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0559671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1862  hypothetical protein  22.19 
 
 
626 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2096  hypothetical protein  23 
 
 
626 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000483001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2225  ABC transporter permease  25.91 
 
 
626 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2390  ABC transporter permease  25.91 
 
 
626 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2076  permease domain-containing protein  22.68 
 
 
626 aa  81.6  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00474198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1856  ABC transporter permease  23 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3308  hypothetical protein  23 
 
 
626 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.694511  hitchhiker  0.0000199726 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4682  hypothetical protein  21.1 
 
 
659 aa  80.9  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4797  ABC transporter; permease  23.47 
 
 
617 aa  79  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2356  putative ABC transporter, permease protein  25.17 
 
 
626 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4866  putative ABC transporter, permease protein  24.83 
 
 
619 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4658  hypothetical protein  23.43 
 
 
615 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>