151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1912 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1912  peptide ABC transporter permease  100 
 
 
669 aa  1341    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0975  ABC transporter, permease protein, putative  35.47 
 
 
651 aa  354  2.9999999999999997e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0837  peptide ABC transporter permease  31.35 
 
 
655 aa  332  1e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.696049  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3331  hypothetical protein  32.07 
 
 
662 aa  294  4e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0524  protein of unknown function DUF214  29.04 
 
 
676 aa  259  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.245064  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1307  peptide ABC transporter permease  29.05 
 
 
666 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1090  protein of unknown function DUF214  27.85 
 
 
657 aa  213  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1790  hypothetical protein  27.33 
 
 
641 aa  208  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111831  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0658  ABC transporter, permease protein  25.58 
 
 
681 aa  202  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4984  ABC transporter, permease protein  27.46 
 
 
649 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4670  hypothetical protein  27.38 
 
 
649 aa  188  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4963  ABC transporter, permease  27.38 
 
 
634 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0280  ABC transporter, permease component  28.39 
 
 
649 aa  180  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4556  ABC transporter, permease  27.42 
 
 
634 aa  178  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4949  ABC transporter permease protein  25.73 
 
 
634 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4971  efflux ABC transporter, permease protein  27.73 
 
 
649 aa  170  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4564  ABC transporter, permease  28.04 
 
 
649 aa  170  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.206962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4722  ABC transporter permease  27.83 
 
 
649 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4945  efflux ABC transporter, permease protein  27.98 
 
 
649 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4580  ABC transporter, permease  26.8 
 
 
649 aa  169  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5084  ABC transporter permease  27.83 
 
 
649 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.265996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2645  hypothetical protein  23.13 
 
 
666 aa  154  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2701  hypothetical protein  23.13 
 
 
666 aa  154  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1862  hypothetical protein  23.75 
 
 
626 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5202  ABC transporter, permease component  25.87 
 
 
641 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2203  ABC transporter, permease protein  23.36 
 
 
670 aa  144  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1525  hypothetical protein  24.23 
 
 
622 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3308  hypothetical protein  23.69 
 
 
626 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.694511  hitchhiker  0.0000199726 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1827  ABC transporter permease  23.2 
 
 
626 aa  137  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0776042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1811  ABC transporter, permease  23.2 
 
 
626 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.178931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2076  permease domain-containing protein  22.51 
 
 
626 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00474198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4569  ABC transporter, permease protein  23.24 
 
 
640 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2001  hypothetical protein  24.57 
 
 
597 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0306259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2096  hypothetical protein  23.54 
 
 
626 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000483001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4527  ABC transporter, permease protein  23.24 
 
 
640 aa  134  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2174  protein of unknown function DUF214  21.5 
 
 
635 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4554  ABC transporter, permease protein  23.09 
 
 
640 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4170  ABC transporter, permease  23.02 
 
 
640 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2530  hypothetical protein  24 
 
 
643 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00952012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4516  ABC transporter, permease protein  23.22 
 
 
640 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2033  hypothetical protein  23.99 
 
 
626 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98953e-36 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4333  ABC transporter permease  23.22 
 
 
640 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.403638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4668  ABC transporter permease  23.22 
 
 
640 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2576  efflux ABC transporter, permease protein  23.63 
 
 
644 aa  130  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4955  efflux ABC transporter, permease protein  30.32 
 
 
649 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2747  efflux ABC transporter, permease protein  23.77 
 
 
643 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.543337  hitchhiker  0.00000301265 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4332  ABC transporter permease  24.12 
 
 
638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4667  ABC transporter permease  24.12 
 
 
638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4180  ABC transporter, permease  23.96 
 
 
638 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22145  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1511  hypothetical protein  23.73 
 
 
626 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0723575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2621  efflux ABC transporter, permease protein  24.21 
 
 
643 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080038 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2350  ABC transporter, permease  24.21 
 
 
643 aa  125  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3151  hypothetical protein  23.09 
 
 
640 aa  125  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0714  hypothetical protein  23.03 
 
 
640 aa  125  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4515  ABC transporter, permease protein  24.12 
 
 
638 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.834594 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4181  ABC transporter, permease  22.65 
 
 
640 aa  124  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0119  putative ABC transporter, permease protein  22.95 
 
 
675 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.086048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0699  ABC transporter, permease  24.2 
 
 
640 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4553  ABC transporter, permease protein  25 
 
 
637 aa  122  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.388232  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0120  permease domain-containing protein  23.28 
 
 
659 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4169  ABC transporter, permease  24.4 
 
 
637 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3150  hypothetical protein  24.36 
 
 
637 aa  120  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1078  protein of unknown function DUF214  22.71 
 
 
703 aa  118  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0681  ABC transporter, permease protein  23.89 
 
 
636 aa  117  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.003357  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2325  hypothetical protein  22.66 
 
 
645 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.93865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4281  hypothetical protein  24.37 
 
 
637 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117756  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4679  hypothetical protein  22.29 
 
 
656 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4526  ABC transporter, permease protein  23 
 
 
637 aa  114  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4991  permease, putative  21.79 
 
 
656 aa  113  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4730  permease  22.72 
 
 
651 aa  113  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5090  permease  22.72 
 
 
651 aa  113  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2307  hypothetical protein  22.67 
 
 
656 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00102704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4568  ABC transporter, permease protein  22.83 
 
 
637 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4570  ABC transporter, permease  22.57 
 
 
651 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0344591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3485  hypothetical protein  22.66 
 
 
656 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4964  putative permease  22.72 
 
 
651 aa  109  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4994  permease domain-containing protein  22.22 
 
 
657 aa  108  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0269  putative permease  22.5 
 
 
651 aa  108  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4589  ABC transporter, permease  22.52 
 
 
657 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4680  hypothetical protein  22.97 
 
 
652 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2660  efflux ABC transporter, permease protein  22.24 
 
 
643 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000354246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1856  ABC transporter permease  25.5 
 
 
412 aa  105  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4590  ABC transporter, permease  22.5 
 
 
651 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0680  ABC transporter permease protein  27.51 
 
 
640 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00920993  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4950  hypothetical protein  22.49 
 
 
657 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4992  permease, putative  22.84 
 
 
651 aa  104  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2356  putative ABC transporter, permease protein  21.67 
 
 
626 aa  104  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4282  hypothetical protein  27.6 
 
 
640 aa  104  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.855208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2622  permease domain-containing protein  22.09 
 
 
643 aa  104  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0226022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4569  ABC transporter, permease  22.22 
 
 
657 aa  104  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00654206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4951  putative permease  23.09 
 
 
595 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1386  protein of unknown function DUF214  23.14 
 
 
644 aa  102  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0267  ABC transporter, permease component  21.52 
 
 
657 aa  102  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0270  hypothetical protein  22.01 
 
 
659 aa  102  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2421  ABC transporter, permease protein, putative  19.79 
 
 
626 aa  101  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4979  putative permease  22.95 
 
 
651 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0340  protein of unknown function DUF214  22.44 
 
 
641 aa  100  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2491  putative ABC transporter, permease protein  19.23 
 
 
626 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4966  hypothetical protein  20.81 
 
 
658 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1693  peptide ABC transporter permease  22.75 
 
 
622 aa  98.2  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18804e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>