162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0120 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0119  putative ABC transporter, permease protein  95.41 
 
 		 675 aa  1248    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.086048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0120  permease domain-containing protein  100 
 
 		 659 aa  1310    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  35.04 
 
 		 702 aa  421  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.863248 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1418  protein of unknown function DUF214  32.2 
 
 		 730 aa  409  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.354153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1078  protein of unknown function DUF214  32.67 
 
 		 703 aa  380  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1937  protein of unknown function DUF214  34.23 
 
 		 700 aa  374  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.15704  normal  0.168646 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4949  ABC transporter permease protein  26.39 
 
 		 634 aa  187  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4556  ABC transporter, permease  26.32 
 
 		 634 aa  187  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4963  ABC transporter, permease  26.69 
 
 		 634 aa  187  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4887  ABC transporter, permease protein, putative  24.93 
 
 		 614 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0288  ABC transporter, permease  25.34 
 
 		 620 aa  183  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5202  ABC transporter, permease component  25.38 
 
 		 641 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4642  ABC transporter permease  26.68 
 
 		 619 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4996  ABC transporter permease  26.68 
 
 		 619 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0381  ABC transporter, permease component  24.41 
 
 		 616 aa  180  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4575  hypothetical protein  25.04 
 
 		 619 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4662  hypothetical protein  25.38 
 
 		 620 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4880  ABC transporter, permease  24.7 
 
 		 614 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4495  ABC transporter, permease  25.04 
 
 		 619 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4866  putative ABC transporter, permease protein  25.11 
 
 		 619 aa  174  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4477  ABC transporter, permease  25.22 
 
 		 619 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2842  ABC transporter, permease  24.24 
 
 		 614 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4670  hypothetical protein  26.78 
 
 		 649 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5250  ABC transporter; permease  25.64 
 
 		 617 aa  171  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4856  putative ABC transporter, permease protein  24.81 
 
 		 619 aa  170  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4797  ABC transporter; permease  25.59 
 
 		 617 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4984  ABC transporter, permease protein  24.85 
 
 		 649 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4955  efflux ABC transporter, permease protein  26.87 
 
 		 649 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3417  hypothetical protein  24.96 
 
 		 621 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.603492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4945  efflux ABC transporter, permease protein  26.14 
 
 		 649 aa  163  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4564  ABC transporter, permease  26.46 
 
 		 649 aa  162  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.206962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2024  ABC transporter, permease component  24.77 
 
 		 609 aa  162  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4722  ABC transporter permease  26 
 
 		 649 aa  161  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5084  ABC transporter permease  26 
 
 		 649 aa  161  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.265996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4971  efflux ABC transporter, permease protein  26.31 
 
 		 649 aa  160  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4580  ABC transporter, permease  26 
 
 		 649 aa  160  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2311  hypothetical protein  24.55 
 
 		 615 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2147  ABC transporter, permease  24.25 
 
 		 626 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0559671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0280  ABC transporter, permease component  25.04 
 
 		 649 aa  152  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2225  ABC transporter permease  24.48 
 
 		 626 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2390  ABC transporter permease  24.48 
 
 		 626 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2111  hypothetical protein  24.02 
 
 		 685 aa  150  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1693  peptide ABC transporter permease  22.9 
 
 		 622 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.18804e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2163  ABC transporter, permease  25.04 
 
 		 626 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1525  hypothetical protein  24.44 
 
 		 622 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2421  ABC transporter, permease protein, putative  24.88 
 
 		 626 aa  148  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972606  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2356  putative ABC transporter, permease protein  25.11 
 
 		 626 aa  147  6e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4658  hypothetical protein  23.1 
 
 		 615 aa  147  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2491  putative ABC transporter, permease protein  24.92 
 
 		 626 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0699  ABC transporter, permease  24.4 
 
 		 640 aa  144  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0837  ABC transporter permease  48.15 
 
 		 152 aa  140  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0723221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3485  hypothetical protein  22.63 
 
 		 656 aa  139  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5205  ABC transporter permease protein  24.43 
 
 		 616 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2197  hypothetical protein  25.3 
 
 		 627 aa  134  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00250497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4589  ABC transporter, permease  23.85 
 
 		 657 aa  134  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0714  hypothetical protein  23.5 
 
 		 640 aa  134  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876899  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0270  hypothetical protein  22.5 
 
 		 659 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1307  peptide ABC transporter permease  23.82 
 
 		 666 aa  130  9.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2971  putative ABC transporter, permease protein  24.89 
 
 		 626 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.809665  normal  0.42091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3331  hypothetical protein  23.2 
 
 		 662 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4950  hypothetical protein  23.54 
 
 		 657 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4964  putative permease  23.2 
 
 		 651 aa  126  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4991  permease, putative  23.57 
 
 		 656 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2350  ABC transporter, permease  24.3 
 
 		 643 aa  126  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2621  efflux ABC transporter, permease protein  24.3 
 
 		 643 aa  126  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080038 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2747  efflux ABC transporter, permease protein  23.63 
 
 		 643 aa  125  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.543337  hitchhiker  0.00000301265 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4679  hypothetical protein  23.54 
 
 		 656 aa  124  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4994  permease domain-containing protein  22.38 
 
 		 657 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4569  ABC transporter, permease  23.3 
 
 		 657 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00654206  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0269  putative permease  22.81 
 
 		 651 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4981  hypothetical protein  22.03 
 
 		 658 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2725  hypothetical protein  20.35 
 
 		 626 aa  122  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2782  hypothetical protein  20.35 
 
 		 626 aa  122  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0267  ABC transporter, permease component  21.84 
 
 		 657 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4966  hypothetical protein  23.23 
 
 		 658 aa  120  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2530  hypothetical protein  23.77 
 
 		 643 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00952012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4170  ABC transporter, permease  22.65 
 
 		 640 aa  120  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4590  ABC transporter, permease  22.81 
 
 		 651 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2645  hypothetical protein  22.64 
 
 		 666 aa  120  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2701  hypothetical protein  22.64 
 
 		 666 aa  120  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4333  ABC transporter permease  22.45 
 
 		 640 aa  119  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.403638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4668  ABC transporter permease  22.45 
 
 		 640 aa  119  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2576  efflux ABC transporter, permease protein  22.45 
 
 		 644 aa  117  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4516  ABC transporter, permease protein  22.3 
 
 		 640 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4680  hypothetical protein  21.69 
 
 		 652 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4730  permease  22.1 
 
 		 651 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4570  ABC transporter, permease  22.91 
 
 		 651 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0344591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5090  permease  22.1 
 
 		 651 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1790  hypothetical protein  21.24 
 
 		 641 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2325  hypothetical protein  23.11 
 
 		 645 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.93865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2384  ABC transporter, permease  22.32 
 
 		 641 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0584897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4282  hypothetical protein  22.03 
 
 		 640 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.855208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1862  hypothetical protein  22.7 
 
 		 626 aa  115  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2174  protein of unknown function DUF214  22.08 
 
 		 635 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4992  permease, putative  21.52 
 
 		 651 aa  114  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4181  ABC transporter, permease  22.02 
 
 		 640 aa  114  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4682  hypothetical protein  22.32 
 
 		 659 aa  114  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4554  ABC transporter, permease protein  22.56 
 
 		 640 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4592  ABC transporter, permease  21.31 
 
 		 659 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4979  putative permease  21.25 
 
 		 651 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>