145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0837 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0837  ABC transporter permease  100 
 
 		 152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0723221  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0119  putative ABC transporter, permease protein  48.15 
 
 		 675 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.086048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0120  permease domain-containing protein  48.15 
 
 		 659 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1937  protein of unknown function DUF214  36.3 
 
 		 700 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.15704  normal  0.168646 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1418  protein of unknown function DUF214  36.11 
 
 		 730 aa  101  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.354153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  38.14 
 
 		 702 aa  97.4  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.863248 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1078  protein of unknown function DUF214  32.19 
 
 		 703 aa  94.4  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4670  hypothetical protein  33.61 
 
 		 649 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5202  ABC transporter, permease component  34.15 
 
 		 641 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4984  ABC transporter, permease protein  33.61 
 
 		 649 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4949  ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 634 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4963  ABC transporter, permease  30.71 
 
 		 634 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4556  ABC transporter, permease  32.5 
 
 		 634 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4575  hypothetical protein  32.67 
 
 		 619 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4856  putative ABC transporter, permease protein  32 
 
 		 619 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5250  ABC transporter; permease  31.62 
 
 		 617 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4642  ABC transporter permease  31.33 
 
 		 619 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0699  ABC transporter, permease  31.75 
 
 		 640 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4996  ABC transporter permease  31.33 
 
 		 619 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4866  putative ABC transporter, permease protein  31.33 
 
 		 619 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4880  ABC transporter, permease  31.85 
 
 		 614 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2421  ABC transporter, permease protein, putative  31.65 
 
 		 626 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972606  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2356  putative ABC transporter, permease protein  30.94 
 
 		 626 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4495  ABC transporter, permease  31.33 
 
 		 619 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1525  hypothetical protein  29.37 
 
 		 622 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2971  putative ABC transporter, permease protein  30.94 
 
 		 626 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.809665  normal  0.42091 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2163  ABC transporter, permease  30.94 
 
 		 626 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4477  ABC transporter, permease  31.33 
 
 		 619 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2197  hypothetical protein  30.94 
 
 		 627 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00250497  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2491  putative ABC transporter, permease protein  30.94 
 
 		 626 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0164  protein of unknown function DUF214  32.61 
 
 		 461 aa  67.8  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.305799  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2225  ABC transporter permease  30.22 
 
 		 626 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2390  ABC transporter permease  30.22 
 
 		 626 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4887  ABC transporter, permease protein, putative  31.11 
 
 		 614 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0315  ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 629 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0917781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2408  ABC transporter, permease  30.94 
 
 		 516 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2147  ABC transporter, permease  30.22 
 
 		 626 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0559671  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0700  ABC transporter permease  26.57 
 
 		 629 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.059741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4797  ABC transporter; permease  30.88 
 
 		 617 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2311  hypothetical protein  28.15 
 
 		 615 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2842  ABC transporter, permease  30 
 
 		 614 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0381  ABC transporter, permease component  30.37 
 
 		 616 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3417  hypothetical protein  33.61 
 
 		 621 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.603492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0280  ABC transporter, permease component  33.61 
 
 		 649 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0685  hypothetical protein  25.87 
 
 		 629 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0975  ABC transporter, permease protein, putative  32.52 
 
 		 651 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0288  ABC transporter, permease  30.77 
 
 		 620 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3331  hypothetical protein  31.2 
 
 		 662 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0714  hypothetical protein  30.08 
 
 		 640 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4658  hypothetical protein  30 
 
 		 615 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4722  ABC transporter permease  33.61 
 
 		 649 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4945  efflux ABC transporter, permease protein  33.61 
 
 		 649 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4580  ABC transporter, permease  33.61 
 
 		 649 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1090  protein of unknown function DUF214  30.89 
 
 		 657 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5084  ABC transporter permease  33.61 
 
 		 649 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.265996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2725  hypothetical protein  26.97 
 
 		 626 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2782  hypothetical protein  26.97 
 
 		 626 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4971  efflux ABC transporter, permease protein  33.61 
 
 		 649 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4955  efflux ABC transporter, permease protein  32.77 
 
 		 649 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4564  ABC transporter, permease  33.61 
 
 		 649 aa  60.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.206962  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1912  peptide ABC transporter permease  28.69 
 
 		 669 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2024  ABC transporter, permease component  27.41 
 
 		 609 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1307  peptide ABC transporter permease  31.09 
 
 		 666 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1790  hypothetical protein  28.44 
 
 		 641 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4662  hypothetical protein  29.23 
 
 		 620 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0837  peptide ABC transporter permease  26.42 
 
 		 655 aa  57  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.696049  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2111  hypothetical protein  29.09 
 
 		 685 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2174  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 		 635 aa  54.7  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5205  ABC transporter permease protein  28.46 
 
 		 616 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0658  ABC transporter, permease protein  25.37 
 
 		 681 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2203  ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 670 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2001  hypothetical protein  25.29 
 
 		 597 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0306259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4589  ABC transporter, permease  31.58 
 
 		 657 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4679  hypothetical protein  28.87 
 
 		 656 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0340  protein of unknown function DUF214  29.87 
 
 		 641 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0270  hypothetical protein  30.26 
 
 		 659 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4991  permease, putative  27.37 
 
 		 656 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4729  ABC transporter permease, C-terminus  30.26 
 
 		 426 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4964  putative permease  27.16 
 
 		 651 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3308  hypothetical protein  25.29 
 
 		 626 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.694511  hitchhiker  0.0000199726 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4569  ABC transporter, permease  30.26 
 
 		 657 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00654206  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4570  ABC transporter, permease  24.51 
 
 		 651 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0344591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0267  ABC transporter, permease component  28 
 
 		 657 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4950  hypothetical protein  30.26 
 
 		 657 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4979  putative permease  27.16 
 
 		 651 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4992  permease, putative  27.16 
 
 		 651 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4730  permease  27.16 
 
 		 651 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4951  putative permease  24.51 
 
 		 595 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4590  ABC transporter, permease  27.16 
 
 		 651 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5090  permease  27.16 
 
 		 651 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5259  ABC transporter, permease  29.31 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4981  hypothetical protein  26.8 
 
 		 658 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1857  ABC transporter permease  25.33 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0194569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0269  putative permease  25.93 
 
 		 651 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3485  hypothetical protein  26.09 
 
 		 656 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4680  hypothetical protein  27.16 
 
 		 652 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4682  hypothetical protein  25.51 
 
 		 659 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2076  permease domain-containing protein  25.29 
 
 		 626 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00474198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4526  ABC transporter, permease protein  23.08 
 
 		 637 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1827  ABC transporter permease  25.33 
 
 		 626 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0776042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>