162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1307 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1307  peptide ABC transporter permease  100 
 
 
666 aa  1325    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3331  hypothetical protein  33.28 
 
 
662 aa  331  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0524  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
676 aa  327  6e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.245064  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1790  hypothetical protein  29.75 
 
 
641 aa  296  6e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111831  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0837  peptide ABC transporter permease  29.99 
 
 
655 aa  278  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.696049  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1912  peptide ABC transporter permease  29.05 
 
 
669 aa  263  8.999999999999999e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0658  ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
681 aa  242  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0975  ABC transporter, permease protein, putative  29.94 
 
 
651 aa  231  4e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4670  hypothetical protein  29.71 
 
 
649 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4984  ABC transporter, permease protein  29.12 
 
 
649 aa  220  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2203  ABC transporter, permease protein  27.98 
 
 
670 aa  211  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4949  ABC transporter permease protein  27.41 
 
 
634 aa  206  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1090  protein of unknown function DUF214  26.75 
 
 
657 aa  205  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4556  ABC transporter, permease  27.55 
 
 
634 aa  200  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4564  ABC transporter, permease  28.21 
 
 
649 aa  197  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.206962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4722  ABC transporter permease  28.72 
 
 
649 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5084  ABC transporter permease  28.72 
 
 
649 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.265996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4955  efflux ABC transporter, permease protein  28.63 
 
 
649 aa  196  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0280  ABC transporter, permease component  27.5 
 
 
649 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4971  efflux ABC transporter, permease protein  28.06 
 
 
649 aa  195  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4580  ABC transporter, permease  28.39 
 
 
649 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4945  efflux ABC transporter, permease protein  28.19 
 
 
649 aa  193  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4963  ABC transporter, permease  26.58 
 
 
634 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2645  hypothetical protein  22.55 
 
 
666 aa  188  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2701  hypothetical protein  22.55 
 
 
666 aa  188  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4516  ABC transporter, permease protein  26.91 
 
 
640 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4333  ABC transporter permease  26.91 
 
 
640 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.403638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4668  ABC transporter permease  26.91 
 
 
640 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4554  ABC transporter, permease protein  25.99 
 
 
640 aa  180  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4569  ABC transporter, permease protein  26.14 
 
 
640 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4170  ABC transporter, permease  26.76 
 
 
640 aa  179  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4181  ABC transporter, permease  26.73 
 
 
640 aa  178  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4527  ABC transporter, permease protein  25.84 
 
 
640 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4282  hypothetical protein  26.28 
 
 
640 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.855208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5202  ABC transporter, permease component  25.84 
 
 
641 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0680  ABC transporter permease protein  26.43 
 
 
640 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00920993  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3150  hypothetical protein  24.14 
 
 
637 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3151  hypothetical protein  27.13 
 
 
640 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1525  hypothetical protein  24.96 
 
 
622 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4281  hypothetical protein  24.52 
 
 
637 aa  161  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4169  ABC transporter, permease  23.19 
 
 
637 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4332  ABC transporter permease  22.89 
 
 
638 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4667  ABC transporter permease  22.89 
 
 
638 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4180  ABC transporter, permease  23.16 
 
 
638 aa  158  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22145  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4515  ABC transporter, permease protein  22.89 
 
 
638 aa  157  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.834594 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0681  ABC transporter, permease protein  24.3 
 
 
636 aa  153  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.003357  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4553  ABC transporter, permease protein  23.67 
 
 
637 aa  150  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.388232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4526  ABC transporter, permease protein  23.48 
 
 
637 aa  150  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4658  hypothetical protein  25.3 
 
 
615 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4568  ABC transporter, permease protein  23.45 
 
 
637 aa  148  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2576  efflux ABC transporter, permease protein  23.1 
 
 
644 aa  144  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3485  hypothetical protein  23.31 
 
 
656 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0699  ABC transporter, permease  25.86 
 
 
640 aa  140  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4679  hypothetical protein  23.38 
 
 
656 aa  140  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2163  ABC transporter, permease  24.01 
 
 
626 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2747  efflux ABC transporter, permease protein  23.67 
 
 
643 aa  139  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.543337  hitchhiker  0.00000301265 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4662  hypothetical protein  24.26 
 
 
620 aa  138  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4797  ABC transporter; permease  23.93 
 
 
617 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4992  permease, putative  24.78 
 
 
651 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5250  ABC transporter; permease  24.23 
 
 
617 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2384  ABC transporter, permease  22.44 
 
 
641 aa  137  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0584897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0120  permease domain-containing protein  23.82 
 
 
659 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2491  putative ABC transporter, permease protein  23.68 
 
 
626 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2421  ABC transporter, permease protein, putative  22.99 
 
 
626 aa  135  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2147  ABC transporter, permease  23.84 
 
 
626 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0559671  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4495  ABC transporter, permease  22.71 
 
 
619 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0381  ABC transporter, permease component  24.14 
 
 
616 aa  134  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4856  putative ABC transporter, permease protein  23.39 
 
 
619 aa  134  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4887  ABC transporter, permease protein, putative  23.4 
 
 
614 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2356  putative ABC transporter, permease protein  23.13 
 
 
626 aa  133  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4866  putative ABC transporter, permease protein  24.06 
 
 
619 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4880  ABC transporter, permease  22.6 
 
 
614 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2530  hypothetical protein  23.18 
 
 
643 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00952012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4642  ABC transporter permease  23.39 
 
 
619 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4477  ABC transporter, permease  22.42 
 
 
619 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4996  ABC transporter permease  23.39 
 
 
619 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2621  efflux ABC transporter, permease protein  21.9 
 
 
643 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080038 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4730  permease  24.22 
 
 
651 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2350  ABC transporter, permease  21.9 
 
 
643 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5090  permease  24.22 
 
 
651 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2725  hypothetical protein  23.65 
 
 
626 aa  131  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2782  hypothetical protein  23.65 
 
 
626 aa  131  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4575  hypothetical protein  23.2 
 
 
619 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4979  putative permease  24.15 
 
 
651 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2024  ABC transporter, permease component  23.78 
 
 
609 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4570  ABC transporter, permease  24.22 
 
 
651 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0344591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1862  hypothetical protein  22.04 
 
 
626 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2225  ABC transporter permease  24.16 
 
 
626 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4590  ABC transporter, permease  23.62 
 
 
651 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2390  ABC transporter permease  24.16 
 
 
626 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2311  hypothetical protein  23.5 
 
 
615 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2842  ABC transporter, permease  23.31 
 
 
614 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0288  ABC transporter, permease  23.71 
 
 
620 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0269  putative permease  24.12 
 
 
651 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0714  hypothetical protein  26.21 
 
 
640 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876899  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0315  ABC transporter, permease protein  23.97 
 
 
629 aa  128  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0917781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4680  hypothetical protein  24.39 
 
 
652 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4994  permease domain-containing protein  21.99 
 
 
657 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2174  protein of unknown function DUF214  21.68 
 
 
635 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4991  permease, putative  23.79 
 
 
656 aa  127  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>