151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2203 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2203  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
670 aa  1341    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2645  hypothetical protein  35.11 
 
 
666 aa  432  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2701  hypothetical protein  35.11 
 
 
666 aa  432  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1090  protein of unknown function DUF214  31.16 
 
 
657 aa  262  2e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1307  peptide ABC transporter permease  27.98 
 
 
666 aa  212  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3331  hypothetical protein  28.44 
 
 
662 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0975  ABC transporter, permease protein, putative  27.08 
 
 
651 aa  180  9e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0658  ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 
681 aa  171  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0837  peptide ABC transporter permease  24.38 
 
 
655 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.696049  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1912  peptide ABC transporter permease  22.76 
 
 
669 aa  145  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4963  ABC transporter, permease  23 
 
 
634 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4984  ABC transporter, permease protein  23.37 
 
 
649 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4556  ABC transporter, permease  23.34 
 
 
634 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4949  ABC transporter permease protein  23 
 
 
634 aa  127  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4670  hypothetical protein  22.73 
 
 
649 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5202  ABC transporter, permease component  24.44 
 
 
641 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0700  ABC transporter permease  23.05 
 
 
629 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.059741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0685  hypothetical protein  22.9 
 
 
629 aa  114  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1790  hypothetical protein  26.28 
 
 
641 aa  113  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111831  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0280  ABC transporter, permease component  23.61 
 
 
649 aa  112  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4955  efflux ABC transporter, permease protein  22.6 
 
 
649 aa  111  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4971  efflux ABC transporter, permease protein  22.9 
 
 
649 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4564  ABC transporter, permease  22.9 
 
 
649 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.206962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4945  efflux ABC transporter, permease protein  23.05 
 
 
649 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0120  permease domain-containing protein  23.85 
 
 
659 aa  109  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2311  hypothetical protein  24.13 
 
 
615 aa  108  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4580  ABC transporter, permease  23.21 
 
 
649 aa  107  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4722  ABC transporter permease  23.02 
 
 
649 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5084  ABC transporter permease  23.02 
 
 
649 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.265996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4991  permease, putative  23.51 
 
 
656 aa  105  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2024  ABC transporter, permease component  23.13 
 
 
609 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4797  ABC transporter; permease  23.23 
 
 
617 aa  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191811  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0119  putative ABC transporter, permease protein  23.92 
 
 
675 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.086048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4682  hypothetical protein  23.06 
 
 
659 aa  100  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4575  hypothetical protein  23.7 
 
 
619 aa  99.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0381  ABC transporter, permease component  24.24 
 
 
616 aa  99  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1078  protein of unknown function DUF214  22.32 
 
 
703 aa  98.2  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0315  ABC transporter, permease protein  20.84 
 
 
629 aa  97.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0917781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4880  ABC transporter, permease  23.17 
 
 
614 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0524  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 
676 aa  96.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.245064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0681  ABC transporter, permease protein  23.07 
 
 
636 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.003357  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4887  ABC transporter, permease protein, putative  22.65 
 
 
614 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4553  ABC transporter, permease protein  21.93 
 
 
637 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.388232  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4332  ABC transporter permease  21.17 
 
 
638 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.491332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4667  ABC transporter permease  21.17 
 
 
638 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0270  hypothetical protein  24.33 
 
 
659 aa  94  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4526  ABC transporter, permease protein  22.48 
 
 
637 aa  94  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4679  hypothetical protein  23 
 
 
656 aa  94  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4169  ABC transporter, permease  21.09 
 
 
637 aa  93.2  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4994  permease domain-containing protein  21.23 
 
 
657 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4180  ABC transporter, permease  21.21 
 
 
638 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22145  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0699  ABC transporter, permease  23.32 
 
 
640 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4589  ABC transporter, permease  23.7 
 
 
657 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4966  hypothetical protein  22.94 
 
 
658 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4568  ABC transporter, permease protein  22.17 
 
 
637 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2842  ABC transporter, permease  22.65 
 
 
614 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3150  hypothetical protein  21.18 
 
 
637 aa  89.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4515  ABC transporter, permease protein  21.21 
 
 
638 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.834594 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4950  hypothetical protein  22.4 
 
 
657 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0714  hypothetical protein  22.52 
 
 
640 aa  88.6  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4992  permease, putative  21.66 
 
 
651 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2747  efflux ABC transporter, permease protein  23.75 
 
 
643 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.543337  hitchhiker  0.00000301265 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0269  putative permease  21.55 
 
 
651 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3485  hypothetical protein  22.03 
 
 
656 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2174  protein of unknown function DUF214  20.13 
 
 
635 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4979  putative permease  22.03 
 
 
651 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4981  hypothetical protein  21.62 
 
 
658 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4569  ABC transporter, permease  22.09 
 
 
657 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00654206  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2725  hypothetical protein  21.71 
 
 
626 aa  86.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2782  hypothetical protein  21.71 
 
 
626 aa  86.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4281  hypothetical protein  21.56 
 
 
637 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117756  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4680  hypothetical protein  21.16 
 
 
652 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4951  putative permease  20.86 
 
 
595 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4730  permease  21.79 
 
 
651 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4570  ABC transporter, permease  20.86 
 
 
651 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0344591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5090  permease  21.79 
 
 
651 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4953  hypothetical protein  23.17 
 
 
658 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2384  ABC transporter, permease  21.61 
 
 
641 aa  84  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0584897  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4572  ABC transporter, permease  23.17 
 
 
658 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.670805  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4592  ABC transporter, permease  22.03 
 
 
659 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2325  hypothetical protein  23.26 
 
 
645 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.93865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4856  putative ABC transporter, permease protein  23.31 
 
 
619 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2530  hypothetical protein  21.98 
 
 
643 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00952012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2576  efflux ABC transporter, permease protein  22.81 
 
 
644 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0340  protein of unknown function DUF214  21.39 
 
 
641 aa  81.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0020  ABC transporter, permease protein  26.86 
 
 
626 aa  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.763643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2491  putative ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 
626 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2421  ABC transporter, permease protein, putative  28.57 
 
 
626 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972606  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2356  putative ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 
626 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2163  ABC transporter, permease  30.1 
 
 
626 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270319  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1693  peptide ABC transporter permease  21.17 
 
 
622 aa  77  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18804e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4282  hypothetical protein  22.77 
 
 
640 aa  77  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.855208  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2147  ABC transporter, permease  29.23 
 
 
626 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0559671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4658  hypothetical protein  22.4 
 
 
615 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4662  hypothetical protein  27.1 
 
 
620 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2225  ABC transporter permease  28.72 
 
 
626 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2390  ABC transporter permease  28.72 
 
 
626 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2350  ABC transporter, permease  21.14 
 
 
643 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2621  efflux ABC transporter, permease protein  21.14 
 
 
643 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080038 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4866  putative ABC transporter, permease protein  24.51 
 
 
619 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>