160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0020 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0020  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 626 aa  1249    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.763643  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2725  hypothetical protein  57.83 
 
 		 626 aa  743    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2782  hypothetical protein  57.83 
 
 		 626 aa  743    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0315  ABC transporter, permease protein  44.72 
 
 		 629 aa  533  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0917781  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0700  ABC transporter permease  43.53 
 
 		 629 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.059741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0685  hypothetical protein  43.38 
 
 		 629 aa  481  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0340  protein of unknown function DUF214  30.64 
 
 		 641 aa  324  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4963  ABC transporter, permease  26.03 
 
 		 634 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4984  ABC transporter, permease protein  25.61 
 
 		 649 aa  193  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4556  ABC transporter, permease  25.73 
 
 		 634 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4949  ABC transporter permease protein  24.58 
 
 		 634 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4670  hypothetical protein  24.77 
 
 		 649 aa  187  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5202  ABC transporter, permease component  26.32 
 
 		 641 aa  185  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4722  ABC transporter permease  26.74 
 
 		 649 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5084  ABC transporter permease  26.74 
 
 		 649 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.265996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4580  ABC transporter, permease  26.28 
 
 		 649 aa  178  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4955  efflux ABC transporter, permease protein  25.55 
 
 		 649 aa  178  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4945  efflux ABC transporter, permease protein  26.74 
 
 		 649 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0280  ABC transporter, permease component  25.76 
 
 		 649 aa  174  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4564  ABC transporter, permease  25.71 
 
 		 649 aa  173  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.206962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4971  efflux ABC transporter, permease protein  25.71 
 
 		 649 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0699  ABC transporter, permease  22.8 
 
 		 640 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0714  hypothetical protein  23.66 
 
 		 640 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876899  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1525  hypothetical protein  24.72 
 
 		 622 aa  147  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1790  hypothetical protein  22.14 
 
 		 641 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000111831  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4170  ABC transporter, permease  23.54 
 
 		 640 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.256087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4181  ABC transporter, permease  24.39 
 
 		 640 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1307  peptide ABC transporter permease  24.14 
 
 		 666 aa  140  8.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4282  hypothetical protein  24.12 
 
 		 640 aa  138  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.855208  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4333  ABC transporter permease  23.65 
 
 		 640 aa  137  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.403638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4668  ABC transporter permease  23.65 
 
 		 640 aa  137  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4516  ABC transporter, permease protein  23.86 
 
 		 640 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4569  ABC transporter, permease protein  23.19 
 
 		 640 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4554  ABC transporter, permease protein  23.33 
 
 		 640 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1862  hypothetical protein  22.8 
 
 		 626 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4527  ABC transporter, permease protein  23.32 
 
 		 640 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2096  hypothetical protein  22.94 
 
 		 626 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000483001  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3308  hypothetical protein  22.39 
 
 		 626 aa  126  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.694511  hitchhiker  0.0000199726 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1827  ABC transporter permease  22.17 
 
 		 626 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0776042  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2174  protein of unknown function DUF214  22.42 
 
 		 635 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3151  hypothetical protein  23.09 
 
 		 640 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2325  hypothetical protein  23.79 
 
 		 645 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.93865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0680  ABC transporter permease protein  23.56 
 
 		 640 aa  125  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00920993  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1811  ABC transporter, permease  22.72 
 
 		 626 aa  124  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.178931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2033  hypothetical protein  22.56 
 
 		 626 aa  124  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98953e-36 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2576  efflux ABC transporter, permease protein  21.99 
 
 		 644 aa  123  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2747  efflux ABC transporter, permease protein  22.89 
 
 		 643 aa  123  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.543337  hitchhiker  0.00000301265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2076  permease domain-containing protein  22.15 
 
 		 626 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00474198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2384  ABC transporter, permease  21.07 
 
 		 641 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0584897  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3331  hypothetical protein  23.76 
 
 		 662 aa  117  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2530  hypothetical protein  22.42 
 
 		 643 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00952012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2001  hypothetical protein  21.21 
 
 		 597 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0306259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2893  ABC transporter, permease  22.07 
 
 		 656 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0821213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2957  ABC transporter, permease associated with salivaricin lantibiotic  21.91 
 
 		 656 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000628063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1511  hypothetical protein  22.97 
 
 		 626 aa  114  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0723575  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2621  efflux ABC transporter, permease protein  22.1 
 
 		 643 aa  113  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080038 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2350  ABC transporter, permease  22.1 
 
 		 643 aa  113  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4590  ABC transporter, permease  21.24 
 
 		 651 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0267  ABC transporter, permease component  23.31 
 
 		 657 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4570  ABC transporter, permease  20.33 
 
 		 651 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0344591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4682  hypothetical protein  22.06 
 
 		 659 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4964  putative permease  20.83 
 
 		 651 aa  109  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4730  permease  20.93 
 
 		 651 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5090  permease  20.93 
 
 		 651 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4679  hypothetical protein  21.31 
 
 		 656 aa  109  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4966  hypothetical protein  21.75 
 
 		 658 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0120  permease domain-containing protein  22.74 
 
 		 659 aa  107  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0269  putative permease  20.57 
 
 		 651 aa  107  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5250  ABC transporter; permease  22.59 
 
 		 617 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4658  hypothetical protein  23.33 
 
 		 615 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4981  hypothetical protein  21.44 
 
 		 658 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0288  ABC transporter, permease  23.36 
 
 		 620 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0837  peptide ABC transporter permease  21.73 
 
 		 655 aa  103  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.696049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4553  ABC transporter, permease protein  21.02 
 
 		 637 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.388232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4994  permease domain-containing protein  21.18 
 
 		 657 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4797  ABC transporter; permease  22.78 
 
 		 617 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0270  hypothetical protein  20.95 
 
 		 659 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3485  hypothetical protein  19.76 
 
 		 656 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4680  hypothetical protein  20.4 
 
 		 652 aa  102  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2842  ABC transporter, permease  22.87 
 
 		 614 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2660  efflux ABC transporter, permease protein  22.96 
 
 		 643 aa  100  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000354246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0524  protein of unknown function DUF214  20.09 
 
 		 676 aa  99.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.245064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4866  putative ABC transporter, permease protein  22.86 
 
 		 619 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2622  permease domain-containing protein  22.96 
 
 		 643 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0226022  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0119  putative ABC transporter, permease protein  21.2 
 
 		 675 aa  98.2  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.086048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2024  ABC transporter, permease component  24.92 
 
 		 609 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4991  permease, putative  19.45 
 
 		 656 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4477  ABC transporter, permease  23.57 
 
 		 619 aa  97.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4495  ABC transporter, permease  22.79 
 
 		 619 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4979  putative permease  20.33 
 
 		 651 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4856  putative ABC transporter, permease protein  23.04 
 
 		 619 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4572  ABC transporter, permease  22.05 
 
 		 658 aa  96.3  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.670805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4953  hypothetical protein  22.05 
 
 		 658 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0681  ABC transporter, permease protein  19.97 
 
 		 636 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.003357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4992  permease, putative  20.63 
 
 		 651 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2421  ABC transporter, permease protein, putative  22.57 
 
 		 626 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3417  hypothetical protein  22.36 
 
 		 621 aa  94.4  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.603492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4575  hypothetical protein  22.87 
 
 		 619 aa  94  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2491  putative ABC transporter, permease protein  22.73 
 
 		 626 aa  94  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4281  hypothetical protein  19.43 
 
 		 637 aa  94  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>