76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3264 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  904    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0350  internalin-related protein  41.22 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0909966 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  35.59 
 
 		 631 aa  158  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  34.13 
 
 		 424 aa  154  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0206  surface antigen, putative  37.4 
 
 		 618 aa  147  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000122541  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.55 
 
 		 1679 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1374  immunoreactive 47 kDa antigen PG97  40.67 
 
 		 428 aa  137  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0515  leucine-rich repeat-containing protein  37.13 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05537  hypothetical protein  35.29 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  34.96 
 
 		 581 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  38.7 
 
 		 816 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1188  hypothetical protein  38.24 
 
 		 1389 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3410  hypothetical protein  35.43 
 
 		 277 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2231  internalin-related protein  38.86 
 
 		 273 aa  113  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0773813  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3631  hypothetical protein  34.57 
 
 		 586 aa  110  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0143724  hitchhiker  0.0000570457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0631  hypothetical protein  32.91 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  31.27 
 
 		 1266 aa  89.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1110  putative lipoprotein  30.88 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  39.04 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  32.55 
 
 		 1041 aa  83.6  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.94 
 
 		 1107 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  34.21 
 
 		 863 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  29.15 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1488  hypothetical protein  32.22 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0421806  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1696  hypothetical protein  29.36 
 
 		 384 aa  69.7  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1059 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1703  hypothetical protein  29.5 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0566348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.88 
 
 		 1015 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  34.17 
 
 		 788 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  34.17 
 
 		 788 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  34.17 
 
 		 788 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  30.39 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1694  hypothetical protein  28.73 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04855  hypothetical protein  31.09 
 
 		 191 aa  57  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  30.38 
 
 		 937 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  25.44 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  31.27 
 
 		 1263 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2080  leucine-rich repeat protein  28.33 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  31.11 
 
 		 565 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  30.38 
 
 		 937 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2048  glycoprotein  31.94 
 
 		 528 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  32.88 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  28.84 
 
 		 467 aa  54.3  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  29.86 
 
 		 2132 aa  53.5  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  28.57 
 
 		 755 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  31.19 
 
 		 535 aa  53.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  23.86 
 
 		 2491 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  28.06 
 
 		 731 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1704  hypothetical protein  27.12 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  31 
 
 		 482 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  28.06 
 
 		 755 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  28.06 
 
 		 755 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  33.84 
 
 		 416 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13363  cell wall surface anchor family protein  31.61 
 
 		 416 aa  50.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.259442  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  35.9 
 
 		 448 aa  50.1  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  28.06 
 
 		 765 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1958  hypothetical protein  30.37 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272689  normal  0.538677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  26.7 
 
 		 643 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  37.23 
 
 		 581 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32564  predicted protein  30.65 
 
 		 692 aa  49.7  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0025  effector protein YopM  33.92 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012796  normal  0.260783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  27.61 
 
 		 763 aa  47.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  25.95 
 
 		 354 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  27.08 
 
 		 713 aa  47.4  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1170  hypothetical protein  26.64 
 
 		 809 aa  47.4  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  28.65 
 
 		 399 aa  46.6  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  24.22 
 
 		 400 aa  46.6  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  33.12 
 
 		 413 aa  44.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  31.75 
 
 		 523 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1554  leucine-rich repeat-containing protein  26.77 
 
 		 443 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.041299  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0527  hypothetical protein  28.93 
 
 		 193 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.12645  normal  0.159535 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1651  leucine-rich repeat-containing protein  26.77 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2186  hypothetical protein  26.77 
 
 		 431 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.311872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  29.74 
 
 		 692 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01441  hypothetical protein  26.77 
 
 		 318 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01429  hypothetical protein  26.77 
 
 		 318 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>