More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1809 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1809  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 630 aa  1288    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.345903  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.43 
 
 		 545 aa  171  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  36.02 
 
 		 575 aa  169  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  37.46 
 
 		 459 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  35.5 
 
 		 442 aa  163  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  37.19 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  37.19 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  38.99 
 
 		 474 aa  161  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  38.99 
 
 		 474 aa  161  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  38.99 
 
 		 474 aa  161  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  38.99 
 
 		 474 aa  161  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  38.99 
 
 		 474 aa  161  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  38.99 
 
 		 474 aa  161  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  38.99 
 
 		 474 aa  161  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  32.31 
 
 		 471 aa  160  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  36.92 
 
 		 535 aa  160  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  35.89 
 
 		 464 aa  160  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  37.28 
 
 		 511 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  38.63 
 
 		 474 aa  157  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.22 
 
 		 524 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  37.41 
 
 		 469 aa  157  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  36.62 
 
 		 483 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  36.59 
 
 		 478 aa  155  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.29 
 
 		 518 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  37.91 
 
 		 584 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  38.27 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  37.02 
 
 		 525 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  37.91 
 
 		 496 aa  155  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  37.41 
 
 		 475 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  37.41 
 
 		 475 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  37.41 
 
 		 475 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  37.41 
 
 		 478 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  37.41 
 
 		 478 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  36.36 
 
 		 477 aa  154  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  37.08 
 
 		 459 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  37.41 
 
 		 475 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  35.86 
 
 		 457 aa  154  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  36.92 
 
 		 464 aa  154  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  38.03 
 
 		 518 aa  153  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  37.28 
 
 		 464 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0789  serine endoprotease  34.92 
 
 		 476 aa  153  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  36.48 
 
 		 511 aa  153  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  37.91 
 
 		 474 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  36.05 
 
 		 479 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  35.43 
 
 		 481 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  34.45 
 
 		 476 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.91 
 
 		 474 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.76 
 
 		 640 aa  151  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  33.76 
 
 		 466 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  31.51 
 
 		 472 aa  151  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  39.48 
 
 		 461 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  34.45 
 
 		 476 aa  150  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  34.75 
 
 		 552 aa  150  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2934  trypsin-like serine protease  35.82 
 
 		 374 aa  150  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.92 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  34.77 
 
 		 497 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  35.59 
 
 		 513 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  34.26 
 
 		 385 aa  149  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  37.28 
 
 		 524 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  34.53 
 
 		 423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  36.93 
 
 		 523 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  35.84 
 
 		 411 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  36.93 
 
 		 524 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  36.24 
 
 		 460 aa  147  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  35.87 
 
 		 459 aa  147  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  35.87 
 
 		 459 aa  147  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3032  Serine protease do-like precursor  37 
 
 		 365 aa  147  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.722688 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0535  2-alkenal reductase  36.54 
 
 		 469 aa  147  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.474663  normal  0.227386 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  37.17 
 
 		 480 aa  147  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.91 
 
 		 474 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  36.2 
 
 		 393 aa  146  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  34.34 
 
 		 424 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  36.09 
 
 		 515 aa  146  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 471 aa  146  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  34.82 
 
 		 583 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  36.07 
 
 		 458 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  35.57 
 
 		 511 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.81 
 
 		 544 aa  144  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.77 
 
 		 475 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.77 
 
 		 475 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  35.85 
 
 		 456 aa  145  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  35.36 
 
 		 511 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  36.86 
 
 		 457 aa  145  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.77 
 
 		 475 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  35.12 
 
 		 474 aa  145  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  31.66 
 
 		 476 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  34.45 
 
 		 462 aa  144  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  37.46 
 
 		 469 aa  144  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.64 
 
 		 497 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.64 
 
 		 501 aa  144  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  35.49 
 
 		 472 aa  144  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.64 
 
 		 501 aa  144  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  36.25 
 
 		 506 aa  143  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  36.25 
 
 		 493 aa  143  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  35.64 
 
 		 353 aa  143  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  37.04 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  34.4 
 
 		 492 aa  143  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.71 
 
 		 388 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  31.3 
 
 		 389 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  32.18 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>